107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3646 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_3646  hypothetical protein  100 
 
 
127 aa  263  5.999999999999999e-70  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1937  hypothetical protein  60.33 
 
 
125 aa  155  2e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.36707  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0172  hypothetical protein  55.28 
 
 
125 aa  151  2.9999999999999998e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0589  hypothetical protein  57.26 
 
 
126 aa  147  4e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4029  hypothetical protein  53.17 
 
 
128 aa  142  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.118399  normal  0.350843 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1387  hypothetical protein  54.03 
 
 
126 aa  142  2e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.712354  normal  0.0522494 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1554  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  54.47 
 
 
123 aa  141  4e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1508  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  57.72 
 
 
123 aa  140  7e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1518  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  50.78 
 
 
138 aa  126  1.0000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.902517 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1839  hypothetical protein  50.78 
 
 
138 aa  126  1.0000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0595  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  45.19 
 
 
137 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.771439  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2807  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  46.88 
 
 
130 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0659632  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1520  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  43.2 
 
 
127 aa  106  1e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000677002 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1411  putative glyoxalase  43.65 
 
 
130 aa  97.1  8e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.377433 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4043  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  42.86 
 
 
132 aa  84.3  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.776404  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4002  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  42.62 
 
 
129 aa  83.2  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1826  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  43.9 
 
 
123 aa  80.1  0.000000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.145544  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3901  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  41.18 
 
 
132 aa  79  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2270  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.8 
 
 
127 aa  78.2  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.33899 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0455  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.07 
 
 
121 aa  69.7  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0449  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.07 
 
 
121 aa  69.7  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.857663  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0509  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.07 
 
 
121 aa  68.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42870  hypothetical protein  33.9 
 
 
126 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.948104 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3031  glyoxalase  33.33 
 
 
129 aa  62.8  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.116954  normal  0.49404 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1463  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.96 
 
 
127 aa  62  0.000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2501  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.62 
 
 
131 aa  61.2  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.517764 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3600  hypothetical protein  33.05 
 
 
126 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.947186  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0695  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.29 
 
 
127 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.483535  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4004  hypothetical protein  33.33 
 
 
127 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37373  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2907  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.76 
 
 
131 aa  60.5  0.000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2540  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.5 
 
 
127 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2607  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.5 
 
 
127 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2706  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.5 
 
 
127 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2538  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.45 
 
 
127 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6709  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.4 
 
 
136 aa  58.9  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2543  glyoxalase family protein  33.58 
 
 
139 aa  58.5  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2011  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.15 
 
 
127 aa  58.2  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3477  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.23 
 
 
258 aa  58.2  0.00000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.567455 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2671  hypothetical protein  31.9 
 
 
131 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.283114  normal  0.58691 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25870  lactoylglutathione lyase family protein  30.77 
 
 
126 aa  57.4  0.00000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0578  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.05 
 
 
127 aa  57  0.00000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.704686  normal  0.313337 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1756  glyoxalase family protein  32.5 
 
 
129 aa  56.6  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0222  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.2 
 
 
134 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.660505  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0706  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.2 
 
 
134 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.242399  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2787  glyoxalase family protein  29.84 
 
 
127 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0233  glyoxalase  31.86 
 
 
122 aa  56.6  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0673  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.2 
 
 
134 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3792  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.36 
 
 
136 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.500886  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0597  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.05 
 
 
136 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4164  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.83 
 
 
120 aa  55.8  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.648232  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0622  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.05 
 
 
136 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.594994  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1191  hypothetical protein  29.91 
 
 
122 aa  55.5  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.889775  hitchhiker  0.00000394377 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1455  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.52 
 
 
127 aa  54.7  0.0000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.205031  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7086  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28 
 
 
129 aa  54.3  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.678926 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1562  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.52 
 
 
127 aa  53.5  0.0000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1556  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.52 
 
 
127 aa  53.5  0.0000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1591  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.52 
 
 
127 aa  53.5  0.0000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.576975 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2788  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.52 
 
 
127 aa  53.5  0.0000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.910627 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2678  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.36 
 
 
144 aa  53.1  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3399  glyoxalase family protein  30.65 
 
 
127 aa  52.4  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3388  hypothetical protein  31.45 
 
 
347 aa  52  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0891  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.43 
 
 
123 aa  51.2  0.000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.740664  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0170  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.67 
 
 
136 aa  51.2  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0309396  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1148  hypothetical protein  30.51 
 
 
300 aa  51.2  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.536905  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0285  hypothetical protein  30.25 
 
 
130 aa  50.8  0.000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3382  hypothetical protein  30.25 
 
 
130 aa  50.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00775023  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2552  hypothetical protein  30.25 
 
 
130 aa  50.8  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2796  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.33 
 
 
123 aa  50.8  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3347  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.25 
 
 
136 aa  50.8  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.725063  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3144  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.46 
 
 
128 aa  50.4  0.000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0680  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.75 
 
 
124 aa  50.1  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0188  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.96 
 
 
129 aa  49.7  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.628816  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1263  hypothetical protein  28.57 
 
 
130 aa  49.3  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0383  glyoxalase  26.67 
 
 
126 aa  49.3  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3986  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.81 
 
 
258 aa  48.9  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4457  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.06 
 
 
125 aa  49.3  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.728285  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4623  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.57 
 
 
252 aa  48.5  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0432436 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2191  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.43 
 
 
121 aa  48.5  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.345356  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1712  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.83 
 
 
240 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3786  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.51 
 
 
258 aa  47.4  0.00007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04802  lactoylglutathione lyase  64.71 
 
 
38 aa  47.4  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3859  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.51 
 
 
258 aa  47  0.00008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4600  antigen, putative  28.57 
 
 
260 aa  46.6  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0263  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.83 
 
 
258 aa  46.6  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4175  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.73 
 
 
257 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4306  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.73 
 
 
257 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.397521 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0914  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.22 
 
 
277 aa  45.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.590177  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1190  glyoxalase family protein  29.75 
 
 
127 aa  45.8  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.939066  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0159  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.73 
 
 
257 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3990  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.41 
 
 
260 aa  45.4  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4107  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.73 
 
 
257 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3512  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.57 
 
 
260 aa  45.1  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0348  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.66 
 
 
126 aa  44.7  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0208  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.7 
 
 
262 aa  44.7  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2765  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.05 
 
 
144 aa  44.7  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000201247 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3064  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.36 
 
 
142 aa  44.3  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0158866  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0880  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.43 
 
 
122 aa  44.3  0.0006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3635  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.69 
 
 
123 aa  43.9  0.0007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.309285 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1602  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.17 
 
 
123 aa  42.4  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.924243  normal  0.151586 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10929  hypothetical protein  27.59 
 
 
257 aa  42  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>