74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0380 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A0380  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  100 
 
 
118 aa  239  7.999999999999999e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4040  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  72.57 
 
 
118 aa  174  5e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4319  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  73.87 
 
 
118 aa  173  6e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.201964  normal  0.363116 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1798  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  71.68 
 
 
118 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.448615  normal  0.770527 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3642  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  71.68 
 
 
118 aa  171  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0295152  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1735  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  70.43 
 
 
117 aa  170  6.999999999999999e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151578  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2110  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  62.61 
 
 
119 aa  152  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.890858  normal  0.0161954 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0146  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  63.96 
 
 
122 aa  147  6e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.265259  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2352  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  61.21 
 
 
120 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0361891 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2097  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase superfamily protein  60.53 
 
 
117 aa  141  3e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.327341  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4750  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  46.28 
 
 
146 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.116089  hitchhiker  0.0000231054 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2852  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  49.58 
 
 
120 aa  116  9e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1506  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  49.12 
 
 
116 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00430807  normal  0.832914 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0364  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  56.76 
 
 
114 aa  114  5e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.783367  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0771  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  54.05 
 
 
115 aa  113  7.999999999999999e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.727814  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3900  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  44.64 
 
 
117 aa  108  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00105604  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1898  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  50 
 
 
120 aa  108  3e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.118607  normal  0.864819 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0880  hypothetical protein  43.48 
 
 
119 aa  107  4.0000000000000004e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2036  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  44.74 
 
 
116 aa  107  6e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000445701  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0991  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  48.65 
 
 
133 aa  107  6e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2104  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  46.09 
 
 
115 aa  106  9.000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.73063 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2366  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  46.9 
 
 
118 aa  105  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1836  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  44.74 
 
 
116 aa  105  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.824589  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0502  glyoxalase family protein  48.65 
 
 
135 aa  104  3e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0492338  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2575  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  46.43 
 
 
115 aa  104  3e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00187079  normal  0.355565 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1602  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  43.33 
 
 
120 aa  104  4e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00273074  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1714  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  46.02 
 
 
116 aa  103  5e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0179217  normal  0.110045 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1521  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  48.65 
 
 
119 aa  104  5e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.936574 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3959  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  45.45 
 
 
141 aa  103  6e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2483  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  45.54 
 
 
115 aa  103  7e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.100026  normal  0.202075 
 
 
-
 
NC_004310  BR0499  glyoxalase family protein  48.65 
 
 
113 aa  103  8e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1692  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  45.13 
 
 
116 aa  103  9e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.43805  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2665  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  45.13 
 
 
116 aa  103  9e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.200314  normal  0.0153203 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1598  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  43.86 
 
 
116 aa  103  9e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.548689  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2413  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  45.54 
 
 
115 aa  103  9e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00307776  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2654  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  47.32 
 
 
117 aa  103  9e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0301786 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000700  glyoxalase family protein  42.11 
 
 
118 aa  102  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0789931  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1602  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  44.26 
 
 
123 aa  102  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.924243  normal  0.151586 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1566  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  43.48 
 
 
116 aa  100  5e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.570273  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0839  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  45.69 
 
 
124 aa  99.8  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.146537  normal  0.308201 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3615  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  52.29 
 
 
107 aa  100  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.199635  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02675  glyoxalase/dioxygenase superfamily protein  42.15 
 
 
119 aa  99.4  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7578  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  43.97 
 
 
127 aa  99  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.848256  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2793  glyoxalase family protein  43.86 
 
 
115 aa  98.2  4e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3658  glyoxalase/dioxygenase superfamily protein  42.11 
 
 
119 aa  97.8  5e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.542995  normal  0.367409 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0570  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  47.17 
 
 
118 aa  97.4  6e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.973299 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3147  glyoxalase family protein  42.2 
 
 
122 aa  95.5  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1677  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  45.13 
 
 
116 aa  95.5  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.108123  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06581  hypothetical protein  39.47 
 
 
119 aa  94.4  5e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0825  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  44.86 
 
 
133 aa  93.6  8e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.947605  hitchhiker  0.000446101 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0511  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  42.06 
 
 
115 aa  89.7  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.815455 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4204  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  41.32 
 
 
121 aa  88.6  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.377514  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1684  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.94 
 
 
121 aa  80.5  0.000000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.178699  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01266  glyoxalase family protein  60 
 
 
56 aa  68.9  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3565  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.14 
 
 
122 aa  46.2  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.277784  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2833  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.73 
 
 
275 aa  45.4  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.581429 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1540  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.95 
 
 
121 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.620388  normal  0.0602433 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6100  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.36 
 
 
125 aa  45.4  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4951  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30 
 
 
280 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.366376 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0543  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.04 
 
 
259 aa  43.9  0.0008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000696806 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4804  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.43 
 
 
260 aa  43.5  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22560  lactoylglutathione lyase family protein  31.5 
 
 
265 aa  43.1  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.438518  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2719  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.17 
 
 
122 aa  43.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.956111  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2353  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.65 
 
 
275 aa  43.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.201801  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0680  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.28 
 
 
124 aa  42.4  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2736  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.64 
 
 
255 aa  42.4  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.77414  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2166  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.8 
 
 
131 aa  41.6  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0593975  normal  0.513472 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2905  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.36 
 
 
129 aa  41.6  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2866  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.46 
 
 
122 aa  41.2  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0649616  normal  0.041772 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4111  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.57 
 
 
122 aa  40.8  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0482478  normal  0.0854177 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01265  hypothetical protein  43.59 
 
 
51 aa  40.8  0.006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7974  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.04 
 
 
265 aa  40.4  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2762  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.12 
 
 
131 aa  40.4  0.009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.132325  normal  0.78823 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10929  hypothetical protein  27.03 
 
 
257 aa  40  0.01  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>