51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3223 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_3223  hypothetical protein  100 
 
 
126 aa  258  2e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0631046 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0322  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  69.92 
 
 
134 aa  182  2.0000000000000003e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.344411  normal  0.135191 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1073  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  64.23 
 
 
127 aa  164  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.839113  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1073  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  63.41 
 
 
127 aa  163  5.9999999999999996e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.157029  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1169  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  62.6 
 
 
127 aa  163  8e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.436841  normal  0.0323915 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2112  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  62.6 
 
 
127 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.27409  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1298  cysteine transferase  60.98 
 
 
129 aa  161  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4303  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  62.6 
 
 
127 aa  161  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.361146  normal  0.160231 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2944  glyoxalase family protein  60.98 
 
 
129 aa  161  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3071  glyoxalase family protein  60.98 
 
 
129 aa  161  3e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.359123  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1194  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  62.6 
 
 
127 aa  161  3e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.931119  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0715  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  62.6 
 
 
127 aa  161  3e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.981181  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0496  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  56.91 
 
 
130 aa  158  2e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03193  hypothetical protein  60.16 
 
 
127 aa  158  3e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2640  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  61.79 
 
 
130 aa  154  5.0000000000000005e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0324  hypothetical protein  52.85 
 
 
127 aa  154  5.0000000000000005e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0346  hypothetical protein  52.03 
 
 
127 aa  152  2e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1801  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  59.35 
 
 
133 aa  150  4e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.549988 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4390  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  59.06 
 
 
135 aa  147  4e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.649125  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1621  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  57.02 
 
 
122 aa  144  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.608041  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3912  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  55.2 
 
 
133 aa  140  6e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.789032  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3927  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  55.2 
 
 
133 aa  140  6e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.494573  normal  0.163495 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3986  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  55.2 
 
 
133 aa  140  6e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.294887  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4897  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  53.6 
 
 
130 aa  129  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.523633  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6299  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  47.29 
 
 
130 aa  115  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.111522 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3977  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  48.39 
 
 
134 aa  115  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0768  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  50 
 
 
124 aa  114  3.9999999999999997e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2513  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  46.83 
 
 
138 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4277  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  48.39 
 
 
128 aa  111  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0278537  normal  0.188614 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1787  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  50 
 
 
124 aa  107  4.0000000000000004e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19260  Glyoxalase/Bleomycin resistance protein/Dioxygenase superfamily  48.78 
 
 
124 aa  107  6e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.121548  normal  0.371802 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3872  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  41.32 
 
 
121 aa  105  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.765477 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1593  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  40.65 
 
 
125 aa  101  3e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0822774  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0897  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  40.98 
 
 
121 aa  100  8e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0132857 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2638  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  42.28 
 
 
124 aa  98.6  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0677  hypothetical protein  40.5 
 
 
121 aa  94.4  5e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3649  metallothiol transferase FosB  43.8 
 
 
123 aa  91.7  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.126585  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17750  Glyoxalase/Bleomycin resistance protein/Dioxygenase superfamily  39.68 
 
 
124 aa  85.9  2e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.622772 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2257  glyoxalase family protein superfamily  68.52 
 
 
64 aa  79.3  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.820677  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2644  hypothetical protein  40.16 
 
 
136 aa  79  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.14094  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6265  metallothiol transferase FosB  31.71 
 
 
124 aa  63.5  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0800729 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3136  glutathione transferase  30.58 
 
 
113 aa  48.5  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1616  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  43.86 
 
 
180 aa  45.4  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2516  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.1 
 
 
333 aa  43.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.308047  normal  0.012324 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0498  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.41 
 
 
135 aa  43.1  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01756  hypothetical protein  27.08 
 
 
180 aa  42.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.473381 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4824  metallothiol transferase FosB  27.64 
 
 
140 aa  41.2  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3263  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.1 
 
 
138 aa  40.8  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0131351  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4899  metallothiol transferase FosB  27.64 
 
 
140 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3120  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.55 
 
 
147 aa  40.4  0.009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.187371 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02481  hypothetical protein  28.1 
 
 
155 aa  40.4  0.009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>