54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS03193 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003296  RS03193  hypothetical protein  100 
 
 
127 aa  265  1e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2944  glyoxalase family protein  69.29 
 
 
129 aa  194  5.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3071  glyoxalase family protein  69.29 
 
 
129 aa  194  5.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.359123  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1298  cysteine transferase  69.29 
 
 
129 aa  194  5.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2112  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  71.2 
 
 
127 aa  189  8e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.27409  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1073  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  69.6 
 
 
127 aa  189  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.157029  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1169  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  69.6 
 
 
127 aa  187  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.436841  normal  0.0323915 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1073  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  69.6 
 
 
127 aa  186  8e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.839113  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0715  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  69.6 
 
 
127 aa  185  2e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.981181  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1194  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  69.6 
 
 
127 aa  185  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.931119  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4303  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  68.8 
 
 
127 aa  184  4e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.361146  normal  0.160231 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0496  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  56.69 
 
 
130 aa  162  1.0000000000000001e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0322  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  62.6 
 
 
134 aa  160  5.0000000000000005e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.344411  normal  0.135191 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3223  hypothetical protein  60.16 
 
 
126 aa  158  3e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0631046 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2640  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  59.35 
 
 
130 aa  150  5e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0324  hypothetical protein  51.18 
 
 
127 aa  149  1e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0346  hypothetical protein  50.39 
 
 
127 aa  147  4e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1801  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  54.47 
 
 
133 aa  145  2.0000000000000003e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.549988 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4390  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  55.12 
 
 
135 aa  143  6e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.649125  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1621  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  52.89 
 
 
122 aa  137  7e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.608041  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3986  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  49.6 
 
 
133 aa  131  3e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.294887  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3912  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  49.6 
 
 
133 aa  131  3e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.789032  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3927  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  49.6 
 
 
133 aa  131  3e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.494573  normal  0.163495 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4897  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  52 
 
 
130 aa  129  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.523633  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3977  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  50 
 
 
134 aa  128  3e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4277  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  50.81 
 
 
128 aa  126  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0278537  normal  0.188614 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0677  hypothetical protein  47.93 
 
 
121 aa  120  6e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6299  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  46.83 
 
 
130 aa  115  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.111522 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0768  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  48.36 
 
 
124 aa  112  2.0000000000000002e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2513  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  46.03 
 
 
138 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3872  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  41.32 
 
 
121 aa  105  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.765477 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19260  Glyoxalase/Bleomycin resistance protein/Dioxygenase superfamily  41.46 
 
 
124 aa  100  7e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.121548  normal  0.371802 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0897  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  41.46 
 
 
121 aa  99.4  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0132857 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1787  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  41.46 
 
 
124 aa  98.2  4e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1593  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.3 
 
 
125 aa  92  2e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0822774  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2638  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.59 
 
 
124 aa  92.4  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2257  glyoxalase family protein superfamily  65 
 
 
64 aa  90.5  8e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.820677  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17750  Glyoxalase/Bleomycin resistance protein/Dioxygenase superfamily  33.33 
 
 
124 aa  80.9  0.000000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.622772 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2644  hypothetical protein  35.48 
 
 
136 aa  75.1  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.14094  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3649  metallothiol transferase FosB  36.36 
 
 
123 aa  71.2  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.126585  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6265  metallothiol transferase FosB  30.89 
 
 
124 aa  58.9  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0800729 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0037  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28 
 
 
129 aa  45.4  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4824  metallothiol transferase FosB  31.34 
 
 
140 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0572  hypothetical protein  29.79 
 
 
146 aa  45.4  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.985503  normal  0.0152096 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4899  metallothiol transferase FosB  31.34 
 
 
140 aa  44.7  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3120  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.23 
 
 
147 aa  43.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.187371 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0040  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.19 
 
 
183 aa  43.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3136  glutathione transferase  29.51 
 
 
113 aa  42.7  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2894  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.46 
 
 
147 aa  41.6  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.531023  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2503  Glutathione transferase  30.58 
 
 
135 aa  41.2  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2409  Glutathione transferase  28.46 
 
 
137 aa  40.4  0.007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.121998  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2855  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.48 
 
 
147 aa  40.4  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0772639  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01756  hypothetical protein  25 
 
 
180 aa  40.4  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.473381 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1386  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.25 
 
 
128 aa  40  0.01  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>