49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_19260 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_19260  Glyoxalase/Bleomycin resistance protein/Dioxygenase superfamily  100 
 
 
124 aa  260  4e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.121548  normal  0.371802 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2638  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  66.13 
 
 
124 aa  172  9.999999999999999e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1787  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  65.32 
 
 
124 aa  164  2.9999999999999998e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3986  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  52.8 
 
 
133 aa  130  9e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.294887  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3927  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  52.8 
 
 
133 aa  130  9e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.494573  normal  0.163495 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3912  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  52.8 
 
 
133 aa  130  9e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.789032  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17750  Glyoxalase/Bleomycin resistance protein/Dioxygenase superfamily  47.58 
 
 
124 aa  118  3e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.622772 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3977  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  47.58 
 
 
134 aa  117  4.9999999999999996e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4390  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  48.03 
 
 
135 aa  117  7e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.649125  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0322  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  49.59 
 
 
134 aa  117  7e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.344411  normal  0.135191 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1073  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  47.58 
 
 
127 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.839113  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0496  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  47.15 
 
 
130 aa  114  5e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2112  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  47.15 
 
 
127 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.27409  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0324  hypothetical protein  43.9 
 
 
127 aa  111  4.0000000000000004e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0346  hypothetical protein  43.9 
 
 
127 aa  110  5e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1073  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  45.97 
 
 
127 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.157029  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4277  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  46.77 
 
 
128 aa  109  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0278537  normal  0.188614 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1169  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  45.53 
 
 
127 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.436841  normal  0.0323915 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4897  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  47.2 
 
 
130 aa  109  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.523633  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3223  hypothetical protein  48.78 
 
 
126 aa  107  6e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0631046 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1194  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  45.53 
 
 
127 aa  107  6e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.931119  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0715  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  45.53 
 
 
127 aa  107  6e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.981181  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2640  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  44.72 
 
 
130 aa  107  6e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3071  glyoxalase family protein  45.53 
 
 
129 aa  106  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.359123  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2944  glyoxalase family protein  45.53 
 
 
129 aa  106  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1298  cysteine transferase  45.53 
 
 
129 aa  106  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4303  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  44.35 
 
 
127 aa  103  6e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.361146  normal  0.160231 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1621  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  41.32 
 
 
122 aa  102  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.608041  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1801  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  43.09 
 
 
133 aa  102  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.549988 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2513  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  41.73 
 
 
138 aa  101  4e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03193  hypothetical protein  41.46 
 
 
127 aa  100  7e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6299  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  41.73 
 
 
130 aa  100  8e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.111522 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0677  hypothetical protein  42.15 
 
 
121 aa  99  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1593  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  41.13 
 
 
125 aa  87.4  6e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0822774  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0768  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  40.16 
 
 
124 aa  87.4  6e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3872  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.02 
 
 
121 aa  87  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.765477 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0897  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.89 
 
 
121 aa  84.3  5e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0132857 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2257  glyoxalase family protein superfamily  61.02 
 
 
64 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.820677  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3649  metallothiol transferase FosB  35.54 
 
 
123 aa  69.7  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.126585  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6265  metallothiol transferase FosB  30.89 
 
 
124 aa  54.3  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0800729 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2644  hypothetical protein  29.84 
 
 
136 aa  52  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.14094  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2516  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.63 
 
 
333 aa  47.4  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.308047  normal  0.012324 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1002  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.28 
 
 
255 aa  45.1  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3136  glutathione transferase  27.27 
 
 
113 aa  43.9  0.0007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1367  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.45 
 
 
125 aa  43.9  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2432  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.12 
 
 
264 aa  42  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2409  Glutathione transferase  30.4 
 
 
137 aa  41.6  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.121998  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1663  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.98 
 
 
126 aa  40.4  0.008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000363775  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3263  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.1 
 
 
138 aa  40  0.01  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0131351  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>