65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3977 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_3977  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  100 
 
 
134 aa  275  2e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4277  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  74.4 
 
 
128 aa  191  2e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0278537  normal  0.188614 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4897  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  63.85 
 
 
130 aa  167  3e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.523633  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3912  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  52.38 
 
 
133 aa  141  3e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.789032  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3927  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  52.38 
 
 
133 aa  141  3e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.494573  normal  0.163495 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3986  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  52.38 
 
 
133 aa  141  3e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.294887  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0496  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  56 
 
 
130 aa  140  7e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0322  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  56.15 
 
 
134 aa  139  9.999999999999999e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.344411  normal  0.135191 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2640  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  56 
 
 
130 aa  138  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1801  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  54.84 
 
 
133 aa  134  4e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.549988 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1298  cysteine transferase  51.61 
 
 
129 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4390  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  53.85 
 
 
135 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.649125  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2944  glyoxalase family protein  51.61 
 
 
129 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3071  glyoxalase family protein  51.61 
 
 
129 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.359123  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0324  hypothetical protein  51.2 
 
 
127 aa  131  3e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0346  hypothetical protein  50 
 
 
127 aa  129  1.0000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2112  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  48 
 
 
127 aa  128  3e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.27409  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03193  hypothetical protein  50 
 
 
127 aa  128  3e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1787  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  48.39 
 
 
124 aa  123  8.000000000000001e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1621  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  47.54 
 
 
122 aa  122  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.608041  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1073  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  46.77 
 
 
127 aa  120  5e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.839113  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1169  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  45.6 
 
 
127 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.436841  normal  0.0323915 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0715  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  45.6 
 
 
127 aa  117  6e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.981181  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1194  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  45.6 
 
 
127 aa  117  6e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.931119  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19260  Glyoxalase/Bleomycin resistance protein/Dioxygenase superfamily  47.58 
 
 
124 aa  117  6e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.121548  normal  0.371802 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1073  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  45.97 
 
 
127 aa  117  7e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.157029  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2638  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  43.55 
 
 
124 aa  115  9.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4303  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  45.16 
 
 
127 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.361146  normal  0.160231 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3223  hypothetical protein  48.39 
 
 
126 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0631046 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2513  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  47.62 
 
 
138 aa  114  3.9999999999999997e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0677  hypothetical protein  47.54 
 
 
121 aa  114  5e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6299  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  46.03 
 
 
130 aa  114  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.111522 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3872  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  45.08 
 
 
121 aa  114  6e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.765477 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0897  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  47.15 
 
 
121 aa  113  6.9999999999999995e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0132857 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0768  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  49.59 
 
 
124 aa  107  4.0000000000000004e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1593  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  41.94 
 
 
125 aa  99.8  1e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0822774  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17750  Glyoxalase/Bleomycin resistance protein/Dioxygenase superfamily  37.9 
 
 
124 aa  98.6  2e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.622772 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3649  metallothiol transferase FosB  38.52 
 
 
123 aa  85.1  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.126585  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2644  hypothetical protein  40.31 
 
 
136 aa  77.8  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.14094  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6265  metallothiol transferase FosB  36.29 
 
 
124 aa  76.3  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0800729 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2257  glyoxalase family protein superfamily  57.14 
 
 
64 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.820677  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4899  metallothiol transferase FosB  28.57 
 
 
140 aa  56.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4824  metallothiol transferase FosB  28.57 
 
 
140 aa  55.5  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3136  glutathione transferase  30.58 
 
 
113 aa  52.8  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0728  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.27 
 
 
137 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.570083  normal  0.0191793 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4704  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.27 
 
 
139 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.435252  normal  0.0441285 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4705  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.27 
 
 
137 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00068361 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2503  Glutathione transferase  31.93 
 
 
135 aa  49.3  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4570  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.27 
 
 
137 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.623689  normal  0.46324 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1740  putative ring-cleaving dioxygenase  27.64 
 
 
137 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20240  putative ring-cleaving dioxygenase  27.64 
 
 
137 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.504368  normal  0.859939 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2409  Glutathione transferase  27.05 
 
 
137 aa  46.6  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.121998  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0005  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.54 
 
 
141 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.100474 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0005  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.34 
 
 
138 aa  45.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.742613  hitchhiker  0.00144174 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0588  hypothetical protein  27.05 
 
 
136 aa  44.3  0.0005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0022  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.2 
 
 
129 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1702  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.02 
 
 
136 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0946955 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3963  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.57 
 
 
144 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00112812  normal  0.0292714 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3849  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.57 
 
 
144 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00552747  normal  0.89966 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0037  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.6 
 
 
129 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1321  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.27 
 
 
138 aa  42  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0713  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.35 
 
 
300 aa  41.6  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2073  glyoxalase/bleomycin resistanceprotein/dioxygenase superfamily protein  26.98 
 
 
144 aa  41.6  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.557902  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0572  hypothetical protein  26.24 
 
 
146 aa  40.8  0.006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.985503  normal  0.0152096 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2516  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.77 
 
 
333 aa  40.4  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.308047  normal  0.012324 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>