45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1073 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008390  Bamb_1073  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  100 
 
 
127 aa  267  5e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.839113  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1073  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  97.64 
 
 
127 aa  260  4e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.157029  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2112  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  89.76 
 
 
127 aa  241  1.9999999999999999e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.27409  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4303  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  90.55 
 
 
127 aa  239  6e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.361146  normal  0.160231 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1194  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  88.98 
 
 
127 aa  235  1e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.931119  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0715  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  88.98 
 
 
127 aa  235  1e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.981181  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1169  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  88.1 
 
 
127 aa  232  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.436841  normal  0.0323915 
 
 
-
 
NC_003296  RS03193  hypothetical protein  69.6 
 
 
127 aa  186  8e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3071  glyoxalase family protein  68.8 
 
 
129 aa  186  1e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.359123  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2944  glyoxalase family protein  68.8 
 
 
129 aa  186  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1298  cysteine transferase  68.8 
 
 
129 aa  186  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0496  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  61.79 
 
 
130 aa  171  3.9999999999999995e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3223  hypothetical protein  64.23 
 
 
126 aa  164  2.9999999999999998e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0631046 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0322  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  63.41 
 
 
134 aa  159  1e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.344411  normal  0.135191 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2640  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  59.06 
 
 
130 aa  154  3e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3927  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  58.4 
 
 
133 aa  148  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.494573  normal  0.163495 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3912  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  58.4 
 
 
133 aa  148  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.789032  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3986  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  58.4 
 
 
133 aa  148  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.294887  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0346  hypothetical protein  52.85 
 
 
127 aa  148  3e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0324  hypothetical protein  52.85 
 
 
127 aa  148  3e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1801  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  56.1 
 
 
133 aa  147  6e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.549988 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1621  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  54.55 
 
 
122 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.608041  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4390  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  58.02 
 
 
135 aa  144  3e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.649125  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6299  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  51.94 
 
 
130 aa  134  5e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.111522 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4277  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  51.56 
 
 
128 aa  131  3e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0278537  normal  0.188614 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4897  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  52.8 
 
 
130 aa  130  6e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.523633  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2513  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  49.61 
 
 
138 aa  122  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3977  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  46.77 
 
 
134 aa  120  5e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19260  Glyoxalase/Bleomycin resistance protein/Dioxygenase superfamily  47.58 
 
 
124 aa  114  3.9999999999999997e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.121548  normal  0.371802 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1787  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  47.58 
 
 
124 aa  112  1.0000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2638  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  44.35 
 
 
124 aa  109  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0768  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  48.36 
 
 
124 aa  105  3e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0677  hypothetical protein  42.15 
 
 
121 aa  103  6e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3872  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  40.5 
 
 
121 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.765477 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0897  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  40.16 
 
 
121 aa  96.7  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0132857 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1593  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.3 
 
 
125 aa  92.8  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0822774  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17750  Glyoxalase/Bleomycin resistance protein/Dioxygenase superfamily  36.29 
 
 
124 aa  90.1  8e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.622772 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2257  glyoxalase family protein superfamily  71.43 
 
 
64 aa  90.1  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.820677  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2644  hypothetical protein  39.2 
 
 
136 aa  80.9  0.000000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.14094  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3649  metallothiol transferase FosB  37.19 
 
 
123 aa  77.8  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.126585  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6265  metallothiol transferase FosB  33.33 
 
 
124 aa  62.8  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0800729 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0037  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28 
 
 
129 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3263  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.79 
 
 
138 aa  43.9  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0131351  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2516  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.92 
 
 
333 aa  43.5  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.308047  normal  0.012324 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2503  Glutathione transferase  32.23 
 
 
135 aa  41.2  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>