87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3356 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3356  catechol 2,3 dioxygenase  100 
 
 		 314 aa  652    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2789  catechol 2,3-dioxygenase  86.62 
 
 		 314 aa  583  1.0000000000000001e-165  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.33846 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0214  catechol 2,3-dioxygenase  86.31 
 
 		 314 aa  579  1e-164  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.368491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4624  catechol 2,3 dioxygenase  84.71 
 
 		 314 aa  573  1.0000000000000001e-162  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5687  catechol 2,3-dioxygenase  84.71 
 
 		 314 aa  572  1.0000000000000001e-162  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.581242  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3548  catechol 2,3 dioxygenase  84.71 
 
 		 314 aa  573  1.0000000000000001e-162  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.15689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1324  catechol 2,3-dioxygenase  83.44 
 
 		 314 aa  565  1e-160  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.173325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2964  catechol 2,3-dioxygenase  73.25 
 
 		 314 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0413409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1182  catechol 2,3-dioxygenase  61.46 
 
 		 314 aa  409  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0804011 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2277  metapyrocatechase  44.62 
 
 		 310 aa  276  2e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3093  catechol 2,3 dioxygenase  46.98 
 
 		 309 aa  269  5e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.396841  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2776  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  46.35 
 
 		 309 aa  268  1e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00387931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0529  catechol 2,3 dioxygenase  44.94 
 
 		 304 aa  266  5e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3311  extradiol ring-cleavage dioxygenase family protein  46.06 
 
 		 311 aa  264  1e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3789  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  43.49 
 
 		 308 aa  259  6e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  1.01416e-18  hitchhiker  0.00301341 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08720  Catechol 2,3 dioxygenase, XylE  43.49 
 
 		 307 aa  257  2e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30770  catechol 2,3-dioxygenase, LapB  44.94 
 
 		 309 aa  256  3e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3109  catechol 2,3 dioxygenase  43.49 
 
 		 309 aa  256  3e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0110217  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3805  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  46.05 
 
 		 311 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00564691 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08800  Extradiol ring-cleavage dioxygenase  43.49 
 
 		 308 aa  248  1e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1474  catechol 2,3 dioxygenase  42.04 
 
 		 306 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3857  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  40.63 
 
 		 307 aa  239  5.999999999999999e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.541619  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0218  catechol 2,3-dioxygenase  43.04 
 
 		 303 aa  231  1e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0340  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  30.04 
 
 		 328 aa  131  1.0000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2413  catechol 2,3-dioxygenase  30.5 
 
 		 335 aa  130  3e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2570  catechol 2,3-dioxygenase  30.19 
 
 		 335 aa  129  7.000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.734645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0444  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.51 
 
 		 320 aa  129  8.000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.399259  decreased coverage  0.00429579 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3544  Catechol 2,3-dioxygenase  30.19 
 
 		 339 aa  125  9e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2031  catechol 2,3 dioxygenase  28.81 
 
 		 326 aa  124  3e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0199  catechol 2,3-dioxygenase  28.66 
 
 		 324 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0824837  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0967  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  29.6 
 
 		 327 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1615  Catechol 2,3-dioxygenase  27.15 
 
 		 315 aa  107  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2681  catechol 2,3 dioxygenase  29.45 
 
 		 332 aa  107  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0886015 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3112  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  27.48 
 
 		 327 aa  107  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1775  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  26.25 
 
 		 314 aa  104  2e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0882804  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0866  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  27.59 
 
 		 363 aa  103  4e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0669494  normal  0.20827 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2314  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  29.3 
 
 		 322 aa  103  5e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3021  putative catechol 2,3-dioxygenase  27.68 
 
 		 304 aa  103  5e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3523  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  26.9 
 
 		 361 aa  100  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3747  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.34 
 
 		 304 aa  100  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20010  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  27.93 
 
 		 388 aa  99.4  7e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0240  Catechol 2,3-dioxygenase  27.02 
 
 		 362 aa  98.6  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3611  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  26.21 
 
 		 363 aa  98.2  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3592  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase HpaD  28.73 
 
 		 325 aa  97.1  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.318937  normal  0.834201 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4282  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  28.41 
 
 		 306 aa  96.3  7e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.594556  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2419  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase HpaD  28.16 
 
 		 325 aa  95.5  9e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1705  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase HpaD  26.43 
 
 		 325 aa  94.4  3e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.159333  normal  0.870304 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1330  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  27.08 
 
 		 323 aa  92.4  9e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00370431  normal  0.041902 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2656  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  24.91 
 
 		 289 aa  86.7  5e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.185638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2612  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase HpaD  24.91 
 
 		 289 aa  86.7  5e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.537215  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0995  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  26.82 
 
 		 308 aa  86.3  6e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0341301  normal  0.0115779 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2641  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  25.52 
 
 		 351 aa  85.9  7e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.67921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4442  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  26.26 
 
 		 326 aa  82.4  0.000000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.266673 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2934  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.82 
 
 		 295 aa  80.9  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.397052  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3502  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase HpaD  26.16 
 
 		 327 aa  80.1  0.00000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00320908 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4021  Catechol 2,3-dioxygenase  24.36 
 
 		 319 aa  79.3  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.686433  normal  0.0157574 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3467  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase HpaD  24.73 
 
 		 326 aa  77.8  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2547  Biphenyl-2,3-diol 1,2-dioxygenase  23.89 
 
 		 342 aa  78.2  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2243  catechol 2,3-dioxygenase  21.5 
 
 		 344 aa  70.5  0.00000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1538  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.77 
 
 		 313 aa  68.6  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000107078  hitchhiker  0.00208557 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2506  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  23.74 
 
 		 326 aa  65.1  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.445473  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1756  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  23.02 
 
 		 305 aa  60.1  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2931  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  23.02 
 
 		 332 aa  59.7  0.00000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1548  Catechol 2,3-dioxygenase  22.43 
 
 		 330 aa  54.7  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.46473  normal  0.832189 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2896  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  21.07 
 
 		 312 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.693532  normal  0.428314 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0713  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.26 
 
 		 300 aa  54.7  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1033  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  23.23 
 
 		 307 aa  53.5  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0380289  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0159  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  23.53 
 
 		 303 aa  50.8  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3843  Biphenyl-2,3-diol 1,2-dioxygenase  22.14 
 
 		 301 aa  50.4  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.724858  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3554  2,3-dihydroxy-p-cumate-3,4-dioxygenase (CmtC)  20.57 
 
 		 314 aa  50.4  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.167156  normal  0.573755 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5584  putative metapyrocatechase (MPC) (CatO2ase) (catechol 2,3- dioxygenase)  23.53 
 
 		 297 aa  50.1  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.932647  normal  0.332055 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1487  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  23.49 
 
 		 201 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0640  aromatic ring-cleavage dioxygenase  20.96 
 
 		 301 aa  47.4  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000774206  normal  0.0582062 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4501  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.47 
 
 		 320 aa  46.6  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.183527  normal  0.639433 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4633  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.47 
 
 		 320 aa  46.6  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0207462  normal  0.0759343 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5318  oxidoreductase  23.7 
 
 		 299 aa  46.6  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5807  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.31 
 
 		 279 aa  46.2  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2669  biphenyl-2,3-diol 1,2-dioxygenase  24.01 
 
 		 299 aa  45.8  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00955472  normal  0.0761655 
 
 
-
 
NC_003296  RS01659  oxidoreductase protein  21.4 
 
 		 288 aa  45.4  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.494847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0688  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  21.9 
 
 		 309 aa  44.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5200  putative glyoxalase/bleomycin resistance protein/dihydroxybiphenyl dioxygenase  26.06 
 
 		 201 aa  44.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000172312  normal  0.0747764 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7651  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  23.72 
 
 		 204 aa  44.3  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.281044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1680  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.04 
 
 		 301 aa  43.9  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.750023  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01756  hypothetical protein  26.19 
 
 		 180 aa  43.5  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.473381 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3684  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  23.53 
 
 		 319 aa  43.1  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5079  oxidoreductase  24.81 
 
 		 299 aa  42.7  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.976387  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3964  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.01 
 
 		 336 aa  42.7  0.009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>