89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0640 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0640  aromatic ring-cleavage dioxygenase  100 
 
 		 301 aa  617  1e-176  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000774206  normal  0.0582062 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1921  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  61.46 
 
 		 304 aa  378  1e-104  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1715  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.49 
 
 		 296 aa  172  7.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.104829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1659  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.49 
 
 		 296 aa  172  7.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.569022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1656  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.49 
 
 		 296 aa  171  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1603  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.49 
 
 		 296 aa  171  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.327735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1630  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.49 
 
 		 296 aa  171  1e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0587  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  39.05 
 
 		 296 aa  171  1e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0675  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  39.05 
 
 		 296 aa  171  1e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0470  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.49 
 
 		 296 aa  170  2e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0545  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.49 
 
 		 296 aa  171  2e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0538  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.13 
 
 		 296 aa  169  4e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.390763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5616  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.77 
 
 		 296 aa  168  9e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.289287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1686  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  40.18 
 
 		 234 aa  148  8e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.309239  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3843  Biphenyl-2,3-diol 1,2-dioxygenase  35.34 
 
 		 301 aa  138  1e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.724858  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0207  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.03 
 
 		 305 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2458  biphenyl-2,3-diol 1,2-dioxygenase  31.65 
 
 		 291 aa  121  1.9999999999999998e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.064994  normal  0.508219 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13601  biphenyl-2,3-diol-1,2-dioxygenase bphC  33.1 
 
 		 300 aa  120  3e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.389978 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3865  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.2 
 
 		 299 aa  118  9.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2774  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.14 
 
 		 300 aa  118  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2153  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.36 
 
 		 300 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3516  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.34 
 
 		 306 aa  117  3e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5306  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.14 
 
 		 300 aa  116  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.230196 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1191  2,3-dihydroxybiphenyl-1,2-dioxygenase  32.73 
 
 		 298 aa  116  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.42588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1431  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.43 
 
 		 298 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5092  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.5 
 
 		 299 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.389389 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4146  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.01 
 
 		 292 aa  115  1.0000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.590632  normal  0.122141 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4793  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.5 
 
 		 299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2891  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.34 
 
 		 302 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1787  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.75 
 
 		 300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0931654 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4707  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.5 
 
 		 299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0327  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.71 
 
 		 302 aa  113  3e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.234924 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0921  Biphenyl-2,3-diol 1,2-dioxygenase  32.51 
 
 		 303 aa  114  3e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2481  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.95 
 
 		 302 aa  114  3e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.538336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1465  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.5 
 
 		 299 aa  113  3e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0308  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.71 
 
 		 302 aa  113  3e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0317  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.71 
 
 		 302 aa  113  3e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.174667  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1557  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.03 
 
 		 298 aa  112  7.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.558327  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0929  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.9 
 
 		 322 aa  111  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4549  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.67 
 
 		 302 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.379336 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0591  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.42 
 
 		 327 aa  107  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3647  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.91 
 
 		 306 aa  107  4e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1335  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.56 
 
 		 295 aa  101  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00028013 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3298  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.25 
 
 		 297 aa  100  4e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0920314 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2877  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.64 
 
 		 299 aa  99.4  6e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0894  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.98 
 
 		 313 aa  99  9e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.114407  normal  0.256671 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1826  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.41 
 
 		 299 aa  96.7  5e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2669  biphenyl-2,3-diol 1,2-dioxygenase  29.54 
 
 		 299 aa  96.3  5e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00955472  normal  0.0761655 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4413  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.2 
 
 		 298 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1848  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.37 
 
 		 323 aa  94  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2876  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.21 
 
 		 291 aa  94  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0656635 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1465  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.13 
 
 		 295 aa  92.4  8e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3046  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.13 
 
 		 298 aa  90.5  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0342349  unclonable  0.000000641858 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3514  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.82 
 
 		 336 aa  90.1  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4902  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.74 
 
 		 294 aa  83.2  0.000000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.671705  normal  0.255308 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3750  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.24 
 
 		 307 aa  82  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4182  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.24 
 
 		 323 aa  72.4  0.000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.246336 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1756  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  23.9 
 
 		 305 aa  64.3  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0618  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.25 
 
 		 119 aa  62.8  0.000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01659  oxidoreductase protein  27.16 
 
 		 288 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.494847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4210  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.11 
 
 		 326 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2896  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  23.26 
 
 		 312 aa  56.6  0.0000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.693532  normal  0.428314 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2964  catechol 2,3-dioxygenase  22.38 
 
 		 314 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0413409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3805  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.47 
 
 		 311 aa  55.8  0.0000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00564691 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2243  catechol 2,3-dioxygenase  25.11 
 
 		 344 aa  55.5  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3093  catechol 2,3 dioxygenase  23.61 
 
 		 309 aa  52.8  0.000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.396841  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3901  hypothetical protein  40.3 
 
 		 83 aa  52  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30770  catechol 2,3-dioxygenase, LapB  24.17 
 
 		 309 aa  51.2  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3554  2,3-dihydroxy-p-cumate-3,4-dioxygenase (CmtC)  22.61 
 
 		 314 aa  50.8  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.167156  normal  0.573755 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3544  Catechol 2,3-dioxygenase  24.24 
 
 		 339 aa  50.4  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0214  catechol 2,3-dioxygenase  20.66 
 
 		 314 aa  49.3  0.00007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.368491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2789  catechol 2,3-dioxygenase  22.4 
 
 		 314 aa  49.3  0.00007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.33846 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5687  catechol 2,3-dioxygenase  22.11 
 
 		 314 aa  48.9  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.581242  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2934  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  20.51 
 
 		 295 aa  48.1  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.397052  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3356  catechol 2,3 dioxygenase  20.96 
 
 		 314 aa  47.4  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1324  catechol 2,3-dioxygenase  20.68 
 
 		 314 aa  47.4  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.173325  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3548  catechol 2,3 dioxygenase  22.65 
 
 		 314 aa  47  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.15689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4624  catechol 2,3 dioxygenase  22.65 
 
 		 314 aa  47  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3611  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  23.11 
 
 		 363 aa  46.6  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2776  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  23.33 
 
 		 309 aa  46.6  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00387931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3311  extradiol ring-cleavage dioxygenase family protein  22.63 
 
 		 311 aa  46.6  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2931  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  22.79 
 
 		 332 aa  45.4  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5525  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.19 
 
 		 299 aa  45.8  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000313604 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1182  catechol 2,3-dioxygenase  23.23 
 
 		 314 aa  44.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0804011 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5079  oxidoreductase  23.08 
 
 		 299 aa  44.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.976387  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08720  Catechol 2,3 dioxygenase, XylE  23.4 
 
 		 307 aa  44.3  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08800  Extradiol ring-cleavage dioxygenase  23.1 
 
 		 308 aa  43.9  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20010  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  23.11 
 
 		 388 aa  42.4  0.008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1474  catechol 2,3 dioxygenase  21.56 
 
 		 306 aa  42.4  0.01  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>