48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3901 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_3901  hypothetical protein  100 
 
 		 83 aa  164  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1431  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  92.96 
 
 		 298 aa  136  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1557  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  65.82 
 
 		 298 aa  108  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.558327  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2153  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  50.65 
 
 		 300 aa  89  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1465  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  46.25 
 
 		 299 aa  70.5  0.000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2877  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  53.42 
 
 		 299 aa  68.2  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4793  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  52.24 
 
 		 299 aa  67.4  0.00000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4707  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  52.24 
 
 		 299 aa  67.4  0.00000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13601  biphenyl-2,3-diol-1,2-dioxygenase bphC  44 
 
 		 300 aa  67  0.00000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.389978 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5092  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  52.24 
 
 		 299 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.389389 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2669  biphenyl-2,3-diol 1,2-dioxygenase  52.05 
 
 		 299 aa  65.9  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00955472  normal  0.0761655 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5306  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  44 
 
 		 300 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.230196 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1921  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.8 
 
 		 304 aa  65.1  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4549  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  43.04 
 
 		 302 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.379336 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0327  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  43.42 
 
 		 302 aa  63.5  0.0000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.234924 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0317  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  43.42 
 
 		 302 aa  63.5  0.0000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.174667  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0308  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  43.42 
 
 		 302 aa  63.5  0.0000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3843  Biphenyl-2,3-diol 1,2-dioxygenase  50.72 
 
 		 301 aa  62.8  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.724858  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2891  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  45.21 
 
 		 302 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0921  Biphenyl-2,3-diol 1,2-dioxygenase  43.75 
 
 		 303 aa  61.2  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3647  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  40.26 
 
 		 306 aa  59.3  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3516  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  41.56 
 
 		 306 aa  58.5  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3298  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.27 
 
 		 297 aa  55.5  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0920314 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1686  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.78 
 
 		 234 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.309239  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1630  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.78 
 
 		 296 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1656  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.78 
 
 		 296 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1715  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.78 
 
 		 296 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.104829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1659  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.78 
 
 		 296 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.569022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1603  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.78 
 
 		 296 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.327735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0545  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.78 
 
 		 296 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0618  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.43 
 
 		 119 aa  52  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0470  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.78 
 
 		 296 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0538  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.43 
 
 		 296 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.390763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3750  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  40 
 
 		 307 aa  51.6  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0640  aromatic ring-cleavage dioxygenase  40.3 
 
 		 301 aa  52  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000774206  normal  0.0582062 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5616  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.78 
 
 		 296 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.289287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0591  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.78 
 
 		 327 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0587  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.43 
 
 		 296 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0675  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.43 
 
 		 296 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0894  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.57 
 
 		 313 aa  50.8  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.114407  normal  0.256671 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3514  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.17 
 
 		 336 aa  50.4  0.000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2774  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.06 
 
 		 300 aa  49.7  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4413  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.23 
 
 		 298 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1826  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.65 
 
 		 299 aa  43.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0207  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.69 
 
 		 305 aa  42.4  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2481  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.21 
 
 		 302 aa  42.4  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.538336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1465  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.3 
 
 		 295 aa  42  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3865  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.73 
 
 		 299 aa  41.6  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>