89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1787 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1787  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  100 
 
 		 300 aa  622  1e-177  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0931654 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3865  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  52.6 
 
 		 299 aa  308  1.0000000000000001e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2481  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  47.2 
 
 		 302 aa  274  1.0000000000000001e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.538336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4146  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.07 
 
 		 292 aa  169  6e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.590632  normal  0.122141 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1191  2,3-dihydroxybiphenyl-1,2-dioxygenase  36 
 
 		 298 aa  168  8e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.42588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0470  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.89 
 
 		 296 aa  162  6e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5616  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.89 
 
 		 296 aa  161  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.289287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1603  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.55 
 
 		 296 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.327735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1630  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.55 
 
 		 296 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1656  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.55 
 
 		 296 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0538  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.22 
 
 		 296 aa  159  4e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.390763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0545  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.22 
 
 		 296 aa  159  5e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3046  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.82 
 
 		 298 aa  158  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0342349  unclonable  0.000000641858 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0587  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.89 
 
 		 296 aa  157  3e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0675  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.89 
 
 		 296 aa  157  3e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1659  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.89 
 
 		 296 aa  156  4e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.569022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1715  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.89 
 
 		 296 aa  156  4e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.104829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0921  Biphenyl-2,3-diol 1,2-dioxygenase  35.93 
 
 		 303 aa  152  5.9999999999999996e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1335  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.9 
 
 		 295 aa  152  7e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00028013 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13601  biphenyl-2,3-diol-1,2-dioxygenase bphC  33.22 
 
 		 300 aa  151  1e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.389978 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2876  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.47 
 
 		 291 aa  149  6e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0656635 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3843  Biphenyl-2,3-diol 1,2-dioxygenase  33.33 
 
 		 301 aa  144  2e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.724858  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2669  biphenyl-2,3-diol 1,2-dioxygenase  32.2 
 
 		 299 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00955472  normal  0.0761655 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4182  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.45 
 
 		 323 aa  140  3e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.246336 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2458  biphenyl-2,3-diol 1,2-dioxygenase  32.37 
 
 		 291 aa  140  3e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.064994  normal  0.508219 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5092  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.88 
 
 		 299 aa  138  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.389389 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0327  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.54 
 
 		 302 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.234924 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0317  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.54 
 
 		 302 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.174667  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0308  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.54 
 
 		 302 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4793  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.54 
 
 		 299 aa  136  4e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2891  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.33 
 
 		 302 aa  136  4e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4707  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.54 
 
 		 299 aa  136  4e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0929  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.21 
 
 		 322 aa  135  8e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0894  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.02 
 
 		 313 aa  135  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.114407  normal  0.256671 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0207  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.96 
 
 		 305 aa  134  9.999999999999999e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1465  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.3 
 
 		 295 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2774  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.16 
 
 		 300 aa  133  3.9999999999999996e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4549  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.85 
 
 		 302 aa  132  9e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.379336 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5306  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.51 
 
 		 300 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.230196 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2877  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.23 
 
 		 299 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4413  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.43 
 
 		 298 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3516  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.87 
 
 		 306 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1465  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.19 
 
 		 299 aa  129  7.000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1848  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.85 
 
 		 323 aa  124  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1826  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.48 
 
 		 299 aa  124  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3298  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.98 
 
 		 297 aa  122  8e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0920314 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1686  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.23 
 
 		 234 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.309239  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1921  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.84 
 
 		 304 aa  120  3e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0640  aromatic ring-cleavage dioxygenase  31.75 
 
 		 301 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000774206  normal  0.0582062 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1431  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.87 
 
 		 298 aa  105  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3750  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31 
 
 		 307 aa  105  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3514  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.85 
 
 		 336 aa  104  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01659  oxidoreductase protein  28.47 
 
 		 288 aa  103  5e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.494847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4902  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.29 
 
 		 294 aa  99.8  5e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.671705  normal  0.255308 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2153  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.9 
 
 		 300 aa  98.6  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1557  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.27 
 
 		 298 aa  96.7  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.558327  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3647  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.14 
 
 		 306 aa  95.1  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0591  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.02 
 
 		 327 aa  92.4  8e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1756  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.45 
 
 		 305 aa  72.4  0.000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2896  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.93 
 
 		 312 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.693532  normal  0.428314 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3554  2,3-dihydroxy-p-cumate-3,4-dioxygenase (CmtC)  25.93 
 
 		 314 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.167156  normal  0.573755 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1474  catechol 2,3 dioxygenase  24.82 
 
 		 306 aa  64.3  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4210  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.73 
 
 		 326 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1538  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.63 
 
 		 313 aa  61.2  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000107078  hitchhiker  0.00208557 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2277  metapyrocatechase  22.34 
 
 		 310 aa  57.8  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2931  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.53 
 
 		 332 aa  57  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5584  putative metapyrocatechase (MPC) (CatO2ase) (catechol 2,3- dioxygenase)  24.25 
 
 		 297 aa  56.6  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.932647  normal  0.332055 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2934  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  23.86 
 
 		 295 aa  56.6  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.397052  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3311  extradiol ring-cleavage dioxygenase family protein  21.41 
 
 		 311 aa  53.9  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0713  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  23.9 
 
 		 300 aa  52.8  0.000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3857  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.72 
 
 		 307 aa  51.6  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.541619  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3805  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  23.21 
 
 		 311 aa  51.2  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00564691 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0159  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  23.74 
 
 		 303 aa  50.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0618  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.97 
 
 		 119 aa  49.7  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3109  catechol 2,3 dioxygenase  23.83 
 
 		 309 aa  48.9  0.00009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0110217  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0821  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.84 
 
 		 306 aa  48.9  0.00009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.308895  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2243  catechol 2,3-dioxygenase  21.43 
 
 		 344 aa  48.5  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3789  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  19.37 
 
 		 308 aa  48.5  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  1.01416e-18  hitchhiker  0.00301341 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0529  catechol 2,3 dioxygenase  22.85 
 
 		 304 aa  48.5  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4442  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  23.33 
 
 		 326 aa  48.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.266673 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3415  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.18 
 
 		 300 aa  47.8  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0259566  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2681  catechol 2,3 dioxygenase  24.33 
 
 		 332 aa  47.4  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0886015 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7428  ring-cleavage extradiol dioxygenase  32.58 
 
 		 177 aa  47  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0442338  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4306  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  20.38 
 
 		 311 aa  45.4  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08800  Extradiol ring-cleavage dioxygenase  22.59 
 
 		 308 aa  44.3  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0214  catechol 2,3-dioxygenase  20.45 
 
 		 314 aa  44.3  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.368491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1615  Catechol 2,3-dioxygenase  22.68 
 
 		 315 aa  43.9  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2547  Biphenyl-2,3-diol 1,2-dioxygenase  22.78 
 
 		 342 aa  43.5  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30770  catechol 2,3-dioxygenase, LapB  21.82 
 
 		 309 aa  43.1  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>