88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1324 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1324  catechol 2,3-dioxygenase  100 
 
 		 314 aa  660    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.173325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3356  catechol 2,3 dioxygenase  83.44 
 
 		 314 aa  565  1e-160  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5687  catechol 2,3-dioxygenase  82.48 
 
 		 314 aa  560  1e-158  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.581242  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3548  catechol 2,3 dioxygenase  81.21 
 
 		 314 aa  553  1e-156  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.15689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4624  catechol 2,3 dioxygenase  81.21 
 
 		 314 aa  553  1e-156  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2964  catechol 2,3-dioxygenase  80.57 
 
 		 314 aa  553  1e-156  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0413409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2789  catechol 2,3-dioxygenase  82.17 
 
 		 314 aa  553  1e-156  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.33846 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0214  catechol 2,3-dioxygenase  80.57 
 
 		 314 aa  548  1e-155  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.368491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1182  catechol 2,3-dioxygenase  60.19 
 
 		 314 aa  410  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0804011 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2277  metapyrocatechase  44.94 
 
 		 310 aa  285  5.999999999999999e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0529  catechol 2,3 dioxygenase  45.4 
 
 		 304 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2776  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  47.3 
 
 		 309 aa  273  3e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00387931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3093  catechol 2,3 dioxygenase  46.35 
 
 		 309 aa  272  4.0000000000000004e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.396841  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3311  extradiol ring-cleavage dioxygenase family protein  45.11 
 
 		 311 aa  269  4e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3805  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  47.08 
 
 		 311 aa  264  1e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00564691 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3109  catechol 2,3 dioxygenase  44.13 
 
 		 309 aa  265  1e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0110217  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08720  Catechol 2,3 dioxygenase, XylE  43.17 
 
 		 307 aa  262  4e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3789  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  42.22 
 
 		 308 aa  257  2e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  1.01416e-18  hitchhiker  0.00301341 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30770  catechol 2,3-dioxygenase, LapB  43.99 
 
 		 309 aa  255  6e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1474  catechol 2,3 dioxygenase  44.27 
 
 		 306 aa  251  1e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08800  Extradiol ring-cleavage dioxygenase  41.9 
 
 		 308 aa  242  7e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3857  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  39.17 
 
 		 307 aa  240  2e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.541619  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0218  catechol 2,3-dioxygenase  42.36 
 
 		 303 aa  238  6.999999999999999e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0340  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  30.14 
 
 		 328 aa  135  8e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0444  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.62 
 
 		 320 aa  128  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.399259  decreased coverage  0.00429579 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3544  Catechol 2,3-dioxygenase  29.62 
 
 		 339 aa  127  3e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2031  catechol 2,3 dioxygenase  29.59 
 
 		 326 aa  126  5e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2413  catechol 2,3-dioxygenase  28.85 
 
 		 335 aa  124  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2570  catechol 2,3-dioxygenase  28.52 
 
 		 335 aa  123  4e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.734645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0199  catechol 2,3-dioxygenase  29.9 
 
 		 324 aa  119  7.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0824837  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3523  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  27.24 
 
 		 361 aa  112  9e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1615  Catechol 2,3-dioxygenase  27.15 
 
 		 315 aa  111  1.0000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0967  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  29.21 
 
 		 327 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3611  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  26.55 
 
 		 363 aa  108  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20010  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  27.93 
 
 		 388 aa  106  5e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3112  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  28.18 
 
 		 327 aa  105  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0866  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  27.65 
 
 		 363 aa  104  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0669494  normal  0.20827 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3021  putative catechol 2,3-dioxygenase  27.45 
 
 		 304 aa  103  4e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3747  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.12 
 
 		 304 aa  101  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2681  catechol 2,3 dioxygenase  27.43 
 
 		 332 aa  100  3e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0886015 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2314  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  27.3 
 
 		 322 aa  99.4  7e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1775  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  24.25 
 
 		 314 aa  95.9  8e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0882804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0240  Catechol 2,3-dioxygenase  27.68 
 
 		 362 aa  94  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2641  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  26.55 
 
 		 351 aa  92.8  6e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.67921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2612  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase HpaD  26.55 
 
 		 289 aa  92  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.537215  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2656  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  26.55 
 
 		 289 aa  92  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.185638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1330  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  25.17 
 
 		 323 aa  90.5  3e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00370431  normal  0.041902 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1705  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase HpaD  25.71 
 
 		 325 aa  89  9e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.159333  normal  0.870304 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2419  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase HpaD  25.6 
 
 		 325 aa  87.4  3e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4282  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  26.52 
 
 		 306 aa  87.4  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.594556  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3592  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase HpaD  25.36 
 
 		 325 aa  86.3  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.318937  normal  0.834201 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4021  Catechol 2,3-dioxygenase  24.76 
 
 		 319 aa  85.9  8e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.686433  normal  0.0157574 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0995  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  25.08 
 
 		 308 aa  82.4  0.00000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0341301  normal  0.0115779 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4442  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  26.28 
 
 		 326 aa  79.3  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.266673 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2547  Biphenyl-2,3-diol 1,2-dioxygenase  23.89 
 
 		 342 aa  79  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3467  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase HpaD  24.64 
 
 		 326 aa  76.3  0.0000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3502  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase HpaD  25.34 
 
 		 327 aa  75.5  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00320908 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1538  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.15 
 
 		 313 aa  74.3  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000107078  hitchhiker  0.00208557 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2934  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  23.02 
 
 		 295 aa  73.9  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.397052  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2243  catechol 2,3-dioxygenase  22.59 
 
 		 344 aa  69.3  0.00000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1756  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  23.57 
 
 		 305 aa  68.6  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2931  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  21.15 
 
 		 332 aa  63.5  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2506  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  22.79 
 
 		 326 aa  63.2  0.000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.445473  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1548  Catechol 2,3-dioxygenase  22.34 
 
 		 330 aa  58.2  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.46473  normal  0.832189 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3554  2,3-dihydroxy-p-cumate-3,4-dioxygenase (CmtC)  22.38 
 
 		 314 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.167156  normal  0.573755 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5584  putative metapyrocatechase (MPC) (CatO2ase) (catechol 2,3- dioxygenase)  24.62 
 
 		 297 aa  55.8  0.0000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.932647  normal  0.332055 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2896  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  20.71 
 
 		 312 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.693532  normal  0.428314 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1033  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  21.26 
 
 		 307 aa  48.9  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0380289  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5306  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  22.74 
 
 		 300 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.230196 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3843  Biphenyl-2,3-diol 1,2-dioxygenase  22.38 
 
 		 301 aa  48.1  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.724858  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0640  aromatic ring-cleavage dioxygenase  20.68 
 
 		 301 aa  47.4  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000774206  normal  0.0582062 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5807  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.17 
 
 		 279 aa  47.4  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0159  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  23.26 
 
 		 303 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3865  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  21.38 
 
 		 299 aa  47.4  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0713  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  22.43 
 
 		 300 aa  46.2  0.0006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4707  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  22.38 
 
 		 299 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4793  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  22.38 
 
 		 299 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4306  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.9 
 
 		 311 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0688  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  21.4 
 
 		 309 aa  45.1  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1680  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.83 
 
 		 301 aa  44.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.750023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1465  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  21.66 
 
 		 299 aa  45.1  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1492  glyoxalase family protein  22.07 
 
 		 321 aa  43.9  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4633  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.39 
 
 		 320 aa  43.1  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0207462  normal  0.0759343 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4501  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.39 
 
 		 320 aa  43.1  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.183527  normal  0.639433 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0614  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.05 
 
 		 274 aa  43.1  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5092  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  22.02 
 
 		 299 aa  43.1  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.389389 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0961  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.79 
 
 		 324 aa  42.7  0.009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1921  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  20.42 
 
 		 304 aa  42.4  0.01  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>