80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1548 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



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Alignment on homolog gene
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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1548  Catechol 2,3-dioxygenase  100 
 
 		 330 aa  679    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.46473  normal  0.832189 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2570  catechol 2,3-dioxygenase  32.51 
 
 		 335 aa  168  1e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.734645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2413  catechol 2,3-dioxygenase  32.86 
 
 		 335 aa  166  5e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2243  catechol 2,3-dioxygenase  34.95 
 
 		 344 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2031  catechol 2,3 dioxygenase  33.22 
 
 		 326 aa  162  8.000000000000001e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2681  catechol 2,3 dioxygenase  36.86 
 
 		 332 aa  162  8.000000000000001e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0886015 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0199  catechol 2,3-dioxygenase  36.17 
 
 		 324 aa  154  2e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0824837  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4021  Catechol 2,3-dioxygenase  30.54 
 
 		 319 aa  147  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.686433  normal  0.0157574 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1615  Catechol 2,3-dioxygenase  30.48 
 
 		 315 aa  142  7e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0444  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.28 
 
 		 320 aa  138  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.399259  decreased coverage  0.00429579 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3544  Catechol 2,3-dioxygenase  32.14 
 
 		 339 aa  133  3e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2547  Biphenyl-2,3-diol 1,2-dioxygenase  31.51 
 
 		 342 aa  131  2.0000000000000002e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0240  Catechol 2,3-dioxygenase  30.24 
 
 		 362 aa  117  3e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2277  metapyrocatechase  28.98 
 
 		 310 aa  95.5  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3093  catechol 2,3 dioxygenase  28.62 
 
 		 309 aa  93.2  5e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.396841  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0340  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  25.32 
 
 		 328 aa  93.2  6e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2776  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.74 
 
 		 309 aa  90.9  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00387931  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08720  Catechol 2,3 dioxygenase, XylE  28.92 
 
 		 307 aa  87.4  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3109  catechol 2,3 dioxygenase  27.86 
 
 		 309 aa  82  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0110217  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08800  Extradiol ring-cleavage dioxygenase  28.37 
 
 		 308 aa  80.9  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30770  catechol 2,3-dioxygenase, LapB  28.04 
 
 		 309 aa  78.6  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3789  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.18 
 
 		 308 aa  79  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  1.01416e-18  hitchhiker  0.00301341 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0995  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  26.56 
 
 		 308 aa  78.2  0.0000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0341301  normal  0.0115779 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4442  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  26.14 
 
 		 326 aa  77  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.266673 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3112  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  25.77 
 
 		 327 aa  76.3  0.0000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3592  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase HpaD  25.38 
 
 		 325 aa  75.5  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.318937  normal  0.834201 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1705  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase HpaD  24.52 
 
 		 325 aa  73.9  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.159333  normal  0.870304 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4282  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  25.75 
 
 		 306 aa  73.9  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.594556  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1775  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  23.61 
 
 		 314 aa  73.9  0.000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0882804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3467  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase HpaD  25.45 
 
 		 326 aa  73.2  0.000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3502  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase HpaD  27.12 
 
 		 327 aa  72.4  0.000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00320908 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0967  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  25.66 
 
 		 327 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3805  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.55 
 
 		 311 aa  71.2  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00564691 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3311  extradiol ring-cleavage dioxygenase family protein  26.74 
 
 		 311 aa  70.9  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2506  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  26.13 
 
 		 326 aa  70.9  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.445473  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3611  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  22.44 
 
 		 363 aa  70.5  0.00000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3857  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  23.89 
 
 		 307 aa  70.1  0.00000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.541619  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3523  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  22.33 
 
 		 361 aa  68.6  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0218  catechol 2,3-dioxygenase  25.35 
 
 		 303 aa  67.4  0.0000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20010  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  24.25 
 
 		 388 aa  66.2  0.0000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2641  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  23.26 
 
 		 351 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.67921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0713  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.17 
 
 		 300 aa  64.7  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4624  catechol 2,3 dioxygenase  24.83 
 
 		 314 aa  64.3  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3548  catechol 2,3 dioxygenase  24.83 
 
 		 314 aa  64.3  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.15689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5687  catechol 2,3-dioxygenase  25.52 
 
 		 314 aa  64.3  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.581242  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1330  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  23.33 
 
 		 323 aa  62  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00370431  normal  0.041902 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2419  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase HpaD  25.46 
 
 		 325 aa  60.5  0.00000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5525  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.62 
 
 		 299 aa  60.1  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000313604 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2656  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  22.44 
 
 		 289 aa  59.3  0.00000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.185638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2612  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase HpaD  22.44 
 
 		 289 aa  59.3  0.00000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.537215  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4210  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  23.21 
 
 		 326 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2314  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  23.77 
 
 		 322 aa  58.5  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0688  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.16 
 
 		 309 aa  58.2  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0214  catechol 2,3-dioxygenase  21.98 
 
 		 314 aa  58.5  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.368491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1324  catechol 2,3-dioxygenase  22.34 
 
 		 314 aa  58.2  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.173325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2964  catechol 2,3-dioxygenase  23.97 
 
 		 314 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0413409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1539  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.48 
 
 		 306 aa  57  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0866  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  22.62 
 
 		 363 aa  57  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0669494  normal  0.20827 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5079  oxidoreductase  28.52 
 
 		 299 aa  56.2  0.0000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.976387  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2789  catechol 2,3-dioxygenase  22.79 
 
 		 314 aa  55.8  0.0000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.33846 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3356  catechol 2,3 dioxygenase  22.43 
 
 		 314 aa  54.7  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2459  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.54 
 
 		 315 aa  54.7  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.280374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0529  catechol 2,3 dioxygenase  22.93 
 
 		 304 aa  54.3  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1756  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.09 
 
 		 305 aa  53.9  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5318  oxidoreductase  28.26 
 
 		 299 aa  52.4  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1474  catechol 2,3 dioxygenase  24.62 
 
 		 306 aa  52.4  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1182  catechol 2,3-dioxygenase  23.31 
 
 		 314 aa  51.2  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0804011 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3554  2,3-dihydroxy-p-cumate-3,4-dioxygenase (CmtC)  23.76 
 
 		 314 aa  50.8  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.167156  normal  0.573755 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2896  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.44 
 
 		 312 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.693532  normal  0.428314 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0892  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.1 
 
 		 159 aa  48.1  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.088352 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3021  putative catechol 2,3-dioxygenase  22.27 
 
 		 304 aa  47.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3415  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.62 
 
 		 300 aa  47  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0259566  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3747  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  22.27 
 
 		 304 aa  47  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1033  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.08 
 
 		 307 aa  46.2  0.0007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0380289  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5584  putative metapyrocatechase (MPC) (CatO2ase) (catechol 2,3- dioxygenase)  23.05 
 
 		 297 aa  45.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.932647  normal  0.332055 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3062  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.35 
 
 		 171 aa  43.9  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0224113  normal  0.0364236 
 
 
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NC_008578  Acel_1455  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.68 
 
 		 173 aa  43.5  0.005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010681  Bphyt_1487  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.21 
 
 		 201 aa  43.5  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010623  Bphy_3527  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.35 
 
 		 304 aa  42.7  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.610793  normal  1 
 
 
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NC_008463  PA14_20240  putative ring-cleaving dioxygenase  28.69 
 
 		 137 aa  42.7  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.504368  normal  0.859939 
 
 
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