78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0240 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0240  Catechol 2,3-dioxygenase  100 
 
 		 362 aa  753    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2413  catechol 2,3-dioxygenase  49.36 
 
 		 335 aa  317  2e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2570  catechol 2,3-dioxygenase  48.72 
 
 		 335 aa  315  6e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.734645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2031  catechol 2,3 dioxygenase  47.12 
 
 		 326 aa  303  4.0000000000000003e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4021  Catechol 2,3-dioxygenase  38.61 
 
 		 319 aa  223  4.9999999999999996e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.686433  normal  0.0157574 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1615  Catechol 2,3-dioxygenase  38.87 
 
 		 315 aa  222  8e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0199  catechol 2,3-dioxygenase  40.95 
 
 		 324 aa  221  9.999999999999999e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0824837  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2681  catechol 2,3 dioxygenase  37 
 
 		 332 aa  205  1e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0886015 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2243  catechol 2,3-dioxygenase  37.02 
 
 		 344 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2547  Biphenyl-2,3-diol 1,2-dioxygenase  35.64 
 
 		 342 aa  178  1e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3544  Catechol 2,3-dioxygenase  30.3 
 
 		 339 aa  167  2.9999999999999998e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0444  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.94 
 
 		 320 aa  135  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.399259  decreased coverage  0.00429579 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2419  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase HpaD  31.78 
 
 		 325 aa  129  1.0000000000000001e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2314  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  31.65 
 
 		 322 aa  118  1.9999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08800  Extradiol ring-cleavage dioxygenase  29.31 
 
 		 308 aa  117  3.9999999999999997e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1548  Catechol 2,3-dioxygenase  30.24 
 
 		 330 aa  117  3.9999999999999997e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.46473  normal  0.832189 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3109  catechol 2,3 dioxygenase  28.9 
 
 		 309 aa  114  3e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0110217  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0866  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  30.63 
 
 		 363 aa  113  6e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0669494  normal  0.20827 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3611  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  29.81 
 
 		 363 aa  112  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3523  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  29.19 
 
 		 361 aa  110  3e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1474  catechol 2,3 dioxygenase  29.71 
 
 		 306 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0529  catechol 2,3 dioxygenase  29.97 
 
 		 304 aa  109  7.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4624  catechol 2,3 dioxygenase  29.07 
 
 		 314 aa  109  9.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3548  catechol 2,3 dioxygenase  29.07 
 
 		 314 aa  109  9.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.15689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1330  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  29.97 
 
 		 323 aa  108  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00370431  normal  0.041902 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4442  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  28.75 
 
 		 326 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.266673 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0340  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  28.92 
 
 		 328 aa  108  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3857  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.89 
 
 		 307 aa  108  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.541619  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3789  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.86 
 
 		 308 aa  105  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  1.01416e-18  hitchhiker  0.00301341 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2277  metapyrocatechase  30.14 
 
 		 310 aa  105  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5687  catechol 2,3-dioxygenase  27.72 
 
 		 314 aa  104  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.581242  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3467  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase HpaD  29.21 
 
 		 326 aa  103  3e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3112  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  27.74 
 
 		 327 aa  101  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2641  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  29.1 
 
 		 351 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.67921  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20010  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  28.48 
 
 		 388 aa  101  2e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0218  catechol 2,3-dioxygenase  28.38 
 
 		 303 aa  100  5e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1775  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  26.28 
 
 		 314 aa  99.8  6e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0882804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3502  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase HpaD  28.53 
 
 		 327 aa  99.8  6e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00320908 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2776  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.77 
 
 		 309 aa  99.4  9e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00387931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4282  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  28.28 
 
 		 306 aa  98.6  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.594556  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3805  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.64 
 
 		 311 aa  99  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00564691 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2612  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase HpaD  29.25 
 
 		 289 aa  99  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.537215  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2656  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  29.25 
 
 		 289 aa  99  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.185638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3356  catechol 2,3 dioxygenase  27.02 
 
 		 314 aa  98.6  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2789  catechol 2,3-dioxygenase  27.02 
 
 		 314 aa  98.6  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.33846 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1182  catechol 2,3-dioxygenase  28.47 
 
 		 314 aa  97.4  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0804011 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30770  catechol 2,3-dioxygenase, LapB  27.3 
 
 		 309 aa  97.1  5e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2964  catechol 2,3-dioxygenase  26.76 
 
 		 314 aa  96.3  7e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0413409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0967  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  24.91 
 
 		 327 aa  95.9  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3592  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase HpaD  28.52 
 
 		 325 aa  94  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.318937  normal  0.834201 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1324  catechol 2,3-dioxygenase  27.68 
 
 		 314 aa  94  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.173325  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08720  Catechol 2,3 dioxygenase, XylE  27.27 
 
 		 307 aa  93.6  5e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1705  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase HpaD  27.59 
 
 		 325 aa  92  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.159333  normal  0.870304 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0214  catechol 2,3-dioxygenase  25.55 
 
 		 314 aa  89.4  9e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.368491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2506  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  26.84 
 
 		 326 aa  88.6  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.445473  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3093  catechol 2,3 dioxygenase  26.6 
 
 		 309 aa  85.9  9e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.396841  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3311  extradiol ring-cleavage dioxygenase family protein  27.12 
 
 		 311 aa  84.7  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0995  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  24.48 
 
 		 308 aa  73.2  0.000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0341301  normal  0.0115779 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3021  putative catechol 2,3-dioxygenase  26.27 
 
 		 304 aa  70.9  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3747  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.27 
 
 		 304 aa  70.1  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5440  hypothetical protein  24.29 
 
 		 279 aa  69.3  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5525  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.52 
 
 		 299 aa  67.8  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000313604 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5079  oxidoreductase  23.1 
 
 		 299 aa  64.7  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.976387  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5318  oxidoreductase  23.29 
 
 		 299 aa  62.4  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0688  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.15 
 
 		 309 aa  60.5  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2934  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  22.96 
 
 		 295 aa  57.8  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.397052  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2931  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  21.15 
 
 		 332 aa  58.2  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1680  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.28 
 
 		 301 aa  55.1  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.750023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1538  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.09 
 
 		 313 aa  55.1  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000107078  hitchhiker  0.00208557 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5584  putative metapyrocatechase (MPC) (CatO2ase) (catechol 2,3- dioxygenase)  23.96 
 
 		 297 aa  53.5  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.932647  normal  0.332055 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4306  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  23.97 
 
 		 311 aa  52  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1033  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  23.77 
 
 		 307 aa  50.8  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0380289  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2459  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.06 
 
 		 315 aa  50.1  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.280374  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0803  glyoxalase family protein  30.16 
 
 		 130 aa  44.7  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3164  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  23.78 
 
 		 323 aa  44.7  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09032  trihydroxytoluene oxygenase (AFU_orthologue; AFUA_8G02470)  23.53 
 
 		 320 aa  44.7  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1756  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.02 
 
 		 305 aa  43.5  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0821  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  23 
 
 		 306 aa  43.5  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.308895  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>