93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3021 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3021  putative catechol 2,3-dioxygenase  100 
 
 		 304 aa  627  1e-179  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3747  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  99.34 
 
 		 304 aa  624  1e-178  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5687  catechol 2,3-dioxygenase  28.09 
 
 		 314 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.581242  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2789  catechol 2,3-dioxygenase  28.76 
 
 		 314 aa  110  3e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.33846 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1538  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.58 
 
 		 313 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000107078  hitchhiker  0.00208557 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4624  catechol 2,3 dioxygenase  28.09 
 
 		 314 aa  109  5e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3548  catechol 2,3 dioxygenase  28.09 
 
 		 314 aa  109  5e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.15689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3805  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.76 
 
 		 311 aa  105  8e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00564691 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1324  catechol 2,3-dioxygenase  27.45 
 
 		 314 aa  103  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.173325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3356  catechol 2,3 dioxygenase  27.68 
 
 		 314 aa  103  4e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0218  catechol 2,3-dioxygenase  29.23 
 
 		 303 aa  102  6e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2964  catechol 2,3-dioxygenase  28.96 
 
 		 314 aa  101  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0413409  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08800  Extradiol ring-cleavage dioxygenase  31.51 
 
 		 308 aa  99.8  5e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3789  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.47 
 
 		 308 aa  99.4  6e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  1.01416e-18  hitchhiker  0.00301341 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3109  catechol 2,3 dioxygenase  28.62 
 
 		 309 aa  97.1  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0110217  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0214  catechol 2,3-dioxygenase  26.42 
 
 		 314 aa  96.3  6e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.368491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3093  catechol 2,3 dioxygenase  27.62 
 
 		 309 aa  94.4  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.396841  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2776  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.86 
 
 		 309 aa  93.2  5e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00387931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4282  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  27.81 
 
 		 306 aa  92.8  6e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.594556  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30770  catechol 2,3-dioxygenase, LapB  28.67 
 
 		 309 aa  92.8  7e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1705  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase HpaD  28.01 
 
 		 325 aa  90.9  3e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.159333  normal  0.870304 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1182  catechol 2,3-dioxygenase  29.04 
 
 		 314 aa  89.4  7e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0804011 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0866  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  31.84 
 
 		 363 aa  89.4  8e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0669494  normal  0.20827 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3592  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase HpaD  27.01 
 
 		 325 aa  88.2  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.318937  normal  0.834201 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08720  Catechol 2,3 dioxygenase, XylE  28.12 
 
 		 307 aa  87.8  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0444  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.18 
 
 		 320 aa  85.5  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.399259  decreased coverage  0.00429579 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4442  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  29.11 
 
 		 326 aa  84.3  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.266673 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1474  catechol 2,3 dioxygenase  25.44 
 
 		 306 aa  84  0.000000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2681  catechol 2,3 dioxygenase  28.8 
 
 		 332 aa  84  0.000000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0886015 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3311  extradiol ring-cleavage dioxygenase family protein  25.55 
 
 		 311 aa  84  0.000000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3523  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  28.43 
 
 		 361 aa  82.8  0.000000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0688  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.91 
 
 		 309 aa  82.4  0.000000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3502  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase HpaD  27.62 
 
 		 327 aa  81.6  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00320908 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3611  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  28.43 
 
 		 363 aa  82  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2931  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.47 
 
 		 332 aa  80.5  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3467  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase HpaD  26.2 
 
 		 326 aa  78.2  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1615  Catechol 2,3-dioxygenase  24.45 
 
 		 315 aa  77.8  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0529  catechol 2,3 dioxygenase  26.99 
 
 		 304 aa  77.8  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20010  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  29.32 
 
 		 388 aa  78.2  0.0000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2570  catechol 2,3-dioxygenase  28.04 
 
 		 335 aa  77.4  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.734645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3112  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  29.37 
 
 		 327 aa  75.9  0.0000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2413  catechol 2,3-dioxygenase  26.87 
 
 		 335 aa  75.5  0.0000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2641  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  28.89 
 
 		 351 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.67921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1775  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  27.65 
 
 		 314 aa  75.1  0.000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0882804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3857  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.06 
 
 		 307 aa  73.9  0.000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.541619  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2506  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  28.84 
 
 		 326 aa  73.6  0.000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.445473  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0199  catechol 2,3-dioxygenase  25.08 
 
 		 324 aa  73.2  0.000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0824837  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2612  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase HpaD  30.04 
 
 		 289 aa  72.4  0.000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.537215  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2656  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  30.04 
 
 		 289 aa  72.4  0.000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.185638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0340  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  25.4 
 
 		 328 aa  71.2  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0240  Catechol 2,3-dioxygenase  26.27 
 
 		 362 aa  70.9  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2934  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.64 
 
 		 295 aa  70.5  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.397052  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2031  catechol 2,3 dioxygenase  24.91 
 
 		 326 aa  70.5  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4306  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.2 
 
 		 311 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0159  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.34 
 
 		 303 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3544  Catechol 2,3-dioxygenase  25.09 
 
 		 339 aa  69.3  0.00000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0713  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.61 
 
 		 300 aa  68.2  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2277  metapyrocatechase  24.57 
 
 		 310 aa  67  0.0000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2314  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  25.4 
 
 		 322 aa  66.6  0.0000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0967  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  28.83 
 
 		 327 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2547  Biphenyl-2,3-diol 1,2-dioxygenase  23.81 
 
 		 342 aa  64.7  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3415  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.07 
 
 		 300 aa  62.8  0.000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0259566  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2419  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase HpaD  25.08 
 
 		 325 aa  62.4  0.000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1680  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.21 
 
 		 301 aa  61.2  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.750023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1330  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  24.92 
 
 		 323 aa  60.5  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00370431  normal  0.041902 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5584  putative metapyrocatechase (MPC) (CatO2ase) (catechol 2,3- dioxygenase)  25.19 
 
 		 297 aa  60.1  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.932647  normal  0.332055 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3554  2,3-dihydroxy-p-cumate-3,4-dioxygenase (CmtC)  24.42 
 
 		 314 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.167156  normal  0.573755 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0821  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.18 
 
 		 306 aa  59.7  0.00000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.308895  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2243  catechol 2,3-dioxygenase  25.98 
 
 		 344 aa  58.9  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2896  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  23.51 
 
 		 312 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.693532  normal  0.428314 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0995  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  27.49 
 
 		 308 aa  55.8  0.0000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0341301  normal  0.0115779 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4021  Catechol 2,3-dioxygenase  23.6 
 
 		 319 aa  54.3  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.686433  normal  0.0157574 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5318  oxidoreductase  25 
 
 		 299 aa  54.3  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1756  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  23.57 
 
 		 305 aa  53.5  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5488  Glyoxalase/bleomycin resistance  23.23 
 
 		 315 aa  48.1  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.181906  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1548  Catechol 2,3-dioxygenase  22.27 
 
 		 330 aa  47.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.46473  normal  0.832189 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1979  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.46 
 
 		 126 aa  47.8  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.120543 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5525  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.27 
 
 		 299 aa  47.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000313604 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5079  oxidoreductase  23.3 
 
 		 299 aa  46.2  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.976387  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0348  glyoxylase I family protein  28.35 
 
 		 127 aa  45.4  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4633  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  22.97 
 
 		 320 aa  45.4  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0207462  normal  0.0759343 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4501  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  22.97 
 
 		 320 aa  45.4  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.183527  normal  0.639433 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1487  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.2 
 
 		 201 aa  44.3  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4570  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.23 
 
 		 137 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.623689  normal  0.46324 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1033  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  23.75 
 
 		 307 aa  44.3  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0380289  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4704  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.23 
 
 		 139 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.435252  normal  0.0441285 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1113  putative dioxygenase  30.7 
 
 		 309 aa  43.9  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4705  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.23 
 
 		 137 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00068361 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5200  putative glyoxalase/bleomycin resistance protein/dihydroxybiphenyl dioxygenase  27.78 
 
 		 201 aa  43.9  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000172312  normal  0.0747764 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4824  metallothiol transferase FosB  26.19 
 
 		 140 aa  43.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0728  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.23 
 
 		 137 aa  43.1  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.570083  normal  0.0191793 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20240  putative ring-cleaving dioxygenase  32.23 
 
 		 137 aa  42.7  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.504368  normal  0.859939 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0588  hypothetical protein  28.46 
 
 		 136 aa  42.7  0.008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>