142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_3532 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_3532  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  100 
 
 
127 aa  265  2e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00853134 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0610  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  64.57 
 
 
128 aa  177  4e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0012737  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2825  glyoxylase family protein  64.29 
 
 
128 aa  172  1.9999999999999998e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.090794  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2155  glyoxalase family protein  64.57 
 
 
127 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2600  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  65.08 
 
 
134 aa  172  1.9999999999999998e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000115728  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2137  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  64.57 
 
 
127 aa  171  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2213  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  64.57 
 
 
127 aa  171  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.859727 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00679  glyoxylase I family protein  63.78 
 
 
127 aa  168  2e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.878559  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2034  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  62.99 
 
 
127 aa  167  5e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2304  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  62.99 
 
 
127 aa  167  5e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.866853  normal  0.0730884 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2291  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  62.99 
 
 
127 aa  166  8e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2080  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  62.99 
 
 
127 aa  166  8e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.422814  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1233  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  64.52 
 
 
127 aa  166  1e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0668602  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0348  glyoxylase I family protein  62.9 
 
 
127 aa  165  2e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001198  glyoxylase family protein  62.9 
 
 
127 aa  164  2.9999999999999998e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1024  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  63.49 
 
 
127 aa  164  4e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.808514  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2496  glyoxylase I family protein  66.67 
 
 
127 aa  163  5.9999999999999996e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4160  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  61.9 
 
 
151 aa  162  1.0000000000000001e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3746  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  58.4 
 
 
128 aa  159  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1309  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  61.79 
 
 
128 aa  157  5e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.35828  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2315  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  62.18 
 
 
142 aa  156  8e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00458  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3795  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  59.5 
 
 
128 aa  155  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3163  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  60.33 
 
 
128 aa  155  3e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2439  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  58.73 
 
 
129 aa  152  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.509697 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04140  Glyoxalase/Bleomycin resistance/Dioxygenase superfamily protein  58.4 
 
 
152 aa  151  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0453  glyoxalase family protein  57.94 
 
 
130 aa  149  1e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4693  glyoxylase family protein  58.54 
 
 
128 aa  149  1e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.133333  hitchhiker  0.000000000000906955 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0444  glyoxalase I  58.4 
 
 
132 aa  148  3e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0282289  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4919  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  59.2 
 
 
129 aa  147  4e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.206926  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3770  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  56.35 
 
 
133 aa  147  4e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0196484  normal  0.0212812 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0645  glyoxylase family protein  58.54 
 
 
128 aa  146  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.109943  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0518  lactoylglutathione lyase (glyoxylase I)  57.72 
 
 
128 aa  144  3e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2533  lactoylglutathione lyase  56 
 
 
129 aa  144  3e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.42336  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3321  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  55.2 
 
 
128 aa  142  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3386  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  58.54 
 
 
129 aa  142  2e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.27488  normal  0.335444 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0734  glyoxylase family protein  56.91 
 
 
136 aa  142  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.784175  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0518  lactoylglutathione lyase (glyoxylase I)  56.91 
 
 
128 aa  141  3e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0521  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  56.56 
 
 
128 aa  139  9e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1030  glyoxalase family protein  59.52 
 
 
132 aa  139  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3418  hypothetical protein  59.52 
 
 
132 aa  139  9.999999999999999e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1083  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  59.52 
 
 
132 aa  139  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0273  hypothetical protein  54.4 
 
 
129 aa  139  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.356475  normal  0.381632 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0675  glyoxylase family protein  56.1 
 
 
128 aa  138  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0574  glyoxylase family protein  56.1 
 
 
128 aa  138  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0607  glyoxylase family protein  56.1 
 
 
128 aa  138  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0257  hypothetical protein  54.4 
 
 
129 aa  139  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0262  hypothetical protein  54.4 
 
 
129 aa  139  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.199971  normal  0.575944 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0276  hypothetical protein  54.4 
 
 
129 aa  138  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0257  hypothetical protein  54.4 
 
 
129 aa  138  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.74773 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2924  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  56.35 
 
 
134 aa  137  7e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0725  hypothetical protein  53.66 
 
 
129 aa  136  8.999999999999999e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.542377  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2963  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  54.4 
 
 
129 aa  134  5e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0189  hypothetical protein  53.6 
 
 
129 aa  133  7.000000000000001e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.735348  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0191  hypothetical protein  53.6 
 
 
129 aa  133  7.000000000000001e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3473  hypothetical protein  53.6 
 
 
129 aa  133  7.000000000000001e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.815895  normal  0.571058 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0180  hypothetical protein  53.6 
 
 
129 aa  133  7.000000000000001e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0197  hypothetical protein  53.6 
 
 
129 aa  133  7.000000000000001e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3416  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  53.6 
 
 
129 aa  133  8e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00185  predicted lyase  53.6 
 
 
129 aa  132  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.931309  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00184  hypothetical protein  53.6 
 
 
129 aa  132  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.883797  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3148  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  53.6 
 
 
129 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0958  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  52.38 
 
 
129 aa  130  3.9999999999999996e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0198  hypothetical protein  52.8 
 
 
129 aa  131  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3343  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  53.17 
 
 
129 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2496  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  53.97 
 
 
129 aa  128  3e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.130416 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0667  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  55.12 
 
 
138 aa  123  7e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0382094  normal  0.0155955 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0380  lactoylglutathione lyase related lyase  47.11 
 
 
130 aa  112  1.0000000000000001e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0158704  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1254  lactoylglutathione lyase or related lyase  43.51 
 
 
131 aa  112  1.0000000000000001e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.351089  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0962  glyoxylase family protein  48.53 
 
 
137 aa  111  3e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.023462  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0663  glyoxylase family protein  53.92 
 
 
102 aa  111  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35908e-32 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01792  glyoxylase I family protein  50 
 
 
55 aa  68.2  0.00000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.41298  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0498  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.54 
 
 
135 aa  60.5  0.000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0572  hypothetical protein  30.6 
 
 
146 aa  52  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.985503  normal  0.0152096 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2686  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.56 
 
 
367 aa  52  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2046  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.31 
 
 
126 aa  51.2  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.33743e-17 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27002  predicted protein  33.33 
 
 
142 aa  51.2  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00346607  normal  0.11675 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1251  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.26 
 
 
143 aa  51.2  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2649  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.47 
 
 
126 aa  50.8  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000551252  normal  0.306748 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3818  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.08 
 
 
146 aa  50.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.475756 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0408  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.95 
 
 
191 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.322497  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0209  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.87 
 
 
123 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1384  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.24 
 
 
317 aa  48.5  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00603992  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1487  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.08 
 
 
201 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1155  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.69 
 
 
124 aa  48.1  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2709  lactoylglutathione lyase  28.68 
 
 
127 aa  47.8  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2154  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.71 
 
 
127 aa  47.8  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0332  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.29 
 
 
191 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0205  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.23 
 
 
123 aa  47  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00140373 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2682  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.03 
 
 
165 aa  47  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0832367  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0809  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.83 
 
 
167 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5575  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.61 
 
 
168 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0782  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.83 
 
 
148 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000260  lactoylglutathione lyase  28.91 
 
 
128 aa  46.2  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10278  hypothetical protein  26.97 
 
 
207 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00492026  normal  0.278062 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0365  ABC transporter periplasmic protein  27.34 
 
 
316 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.722785  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0971  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.37 
 
 
154 aa  45.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.380458  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5194  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.61 
 
 
168 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5283  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.61 
 
 
168 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2177  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.54 
 
 
126 aa  45.4  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.66024  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1275  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.97 
 
 
127 aa  45.4  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>