202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2496 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007912  Sde_2496  glyoxylase I family protein  100 
 
 
127 aa  259  6e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0610  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  73.81 
 
 
128 aa  195  2.0000000000000003e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0012737  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001198  glyoxylase family protein  74.6 
 
 
127 aa  195  2.0000000000000003e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0348  glyoxylase I family protein  73.23 
 
 
127 aa  194  3e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1309  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  71.54 
 
 
128 aa  188  2e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.35828  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2137  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  69.84 
 
 
127 aa  189  2e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2213  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  69.84 
 
 
127 aa  189  2e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.859727 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1233  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  70.87 
 
 
127 aa  183  7e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0668602  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2155  glyoxalase family protein  69.05 
 
 
127 aa  182  1.0000000000000001e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2034  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  68.5 
 
 
127 aa  181  3e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2304  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  68.5 
 
 
127 aa  181  3e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.866853  normal  0.0730884 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2291  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  68.5 
 
 
127 aa  181  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2080  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  68.5 
 
 
127 aa  181  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.422814  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4160  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  69.29 
 
 
151 aa  180  6e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00679  glyoxylase I family protein  65.87 
 
 
127 aa  179  1e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.878559  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3532  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  66.67 
 
 
127 aa  178  2e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00853134 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2825  glyoxylase family protein  67.46 
 
 
128 aa  178  2.9999999999999997e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.090794  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04140  Glyoxalase/Bleomycin resistance/Dioxygenase superfamily protein  65.87 
 
 
152 aa  176  7e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2600  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  65.87 
 
 
134 aa  176  9e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000115728  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2533  lactoylglutathione lyase  64.29 
 
 
129 aa  174  3e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.42336  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0453  glyoxalase family protein  68.8 
 
 
130 aa  174  4e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2315  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  68.64 
 
 
142 aa  173  6e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00458  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0444  glyoxalase I  68.8 
 
 
132 aa  173  8e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0282289  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3746  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  63.2 
 
 
128 aa  171  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1024  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  64.57 
 
 
127 aa  171  2.9999999999999996e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.808514  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3321  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  64 
 
 
128 aa  171  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0257  hypothetical protein  60.8 
 
 
129 aa  167  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0262  hypothetical protein  60.8 
 
 
129 aa  167  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.199971  normal  0.575944 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0276  hypothetical protein  60.8 
 
 
129 aa  167  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0257  hypothetical protein  60.8 
 
 
129 aa  167  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.74773 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3795  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  63.93 
 
 
128 aa  167  6e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0273  hypothetical protein  60 
 
 
129 aa  166  7e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.356475  normal  0.381632 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3163  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  62.3 
 
 
128 aa  166  1e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3148  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  64 
 
 
129 aa  164  4e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2439  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  60.8 
 
 
129 aa  164  5e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.509697 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4693  glyoxylase family protein  64.23 
 
 
128 aa  163  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.133333  hitchhiker  0.000000000000906955 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2963  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  62.4 
 
 
129 aa  161  3e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0574  glyoxylase family protein  63.41 
 
 
128 aa  160  7e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0607  glyoxylase family protein  63.41 
 
 
128 aa  160  7e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0521  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  63.41 
 
 
128 aa  159  8.000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0645  glyoxylase family protein  63.41 
 
 
128 aa  159  1e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.109943  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0518  lactoylglutathione lyase (glyoxylase I)  62.6 
 
 
128 aa  158  3e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3416  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  60 
 
 
129 aa  157  4e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0197  hypothetical protein  60 
 
 
129 aa  157  4e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0180  hypothetical protein  60 
 
 
129 aa  157  4e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0191  hypothetical protein  60 
 
 
129 aa  157  4e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3473  hypothetical protein  60 
 
 
129 aa  157  4e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.815895  normal  0.571058 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0198  hypothetical protein  60 
 
 
129 aa  157  4e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0675  glyoxylase family protein  61.79 
 
 
128 aa  157  5e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0734  glyoxylase family protein  61.79 
 
 
136 aa  157  5e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.784175  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0518  lactoylglutathione lyase (glyoxylase I)  62.6 
 
 
128 aa  156  8e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0725  hypothetical protein  60 
 
 
129 aa  156  9e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.542377  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00185  predicted lyase  59.2 
 
 
129 aa  156  1e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.931309  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00184  hypothetical protein  59.2 
 
 
129 aa  156  1e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.883797  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2924  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  68.8 
 
 
134 aa  155  1e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4919  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  60.8 
 
 
129 aa  155  2e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.206926  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0189  hypothetical protein  59.2 
 
 
129 aa  154  3e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.735348  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3770  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  56.8 
 
 
133 aa  154  4e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0196484  normal  0.0212812 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0958  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  58.59 
 
 
129 aa  151  2e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3386  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  63.11 
 
 
129 aa  150  7e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.27488  normal  0.335444 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2496  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  64 
 
 
129 aa  149  1e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.130416 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3343  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  57.6 
 
 
129 aa  149  2e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1030  glyoxalase family protein  60.8 
 
 
132 aa  142  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3418  hypothetical protein  60.8 
 
 
132 aa  142  2e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1083  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  60.8 
 
 
132 aa  142  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0667  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  65.08 
 
 
138 aa  134  3.0000000000000003e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0382094  normal  0.0155955 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1254  lactoylglutathione lyase or related lyase  52.67 
 
 
131 aa  133  8e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.351089  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0663  glyoxylase family protein  61.39 
 
 
102 aa  126  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35908e-32 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0962  glyoxylase family protein  50.37 
 
 
137 aa  123  1e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.023462  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0380  lactoylglutathione lyase related lyase  47.54 
 
 
130 aa  115  9.999999999999999e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0158704  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01792  glyoxylase I family protein  56.6 
 
 
55 aa  74.3  0.0000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.41298  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0572  hypothetical protein  33.33 
 
 
146 aa  60.8  0.000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.985503  normal  0.0152096 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1155  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.06 
 
 
124 aa  59.7  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3818  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.83 
 
 
146 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.475756 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1275  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.08 
 
 
127 aa  57.8  0.00000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0498  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28 
 
 
135 aa  57  0.00000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2816  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.5 
 
 
318 aa  56.2  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6102  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.12 
 
 
136 aa  56.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.614364 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0971  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.84 
 
 
154 aa  55.5  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.380458  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2682  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.26 
 
 
165 aa  55.8  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0832367  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27002  predicted protein  30.53 
 
 
142 aa  56.2  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00346607  normal  0.11675 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1766  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.77 
 
 
196 aa  53.9  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.252016  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1288  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.25 
 
 
123 aa  53.5  0.0000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0782  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.58 
 
 
148 aa  52.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1428  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.06 
 
 
129 aa  53.5  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.111191  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2201  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.61 
 
 
139 aa  53.1  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0809  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.58 
 
 
167 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0449  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.63 
 
 
139 aa  53.1  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.474975  normal  0.391309 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1251  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.93 
 
 
143 aa  53.1  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2154  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.31 
 
 
127 aa  52.4  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2686  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.16 
 
 
367 aa  52.8  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3147  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.13 
 
 
130 aa  51.2  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00122819 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1979  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.23 
 
 
126 aa  50.4  0.000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.120543 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1250  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.47 
 
 
152 aa  50.4  0.000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1860  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.79 
 
 
180 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.715022  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4638  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.41 
 
 
133 aa  49.7  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.103381  normal  0.0181586 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1423  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.82 
 
 
160 aa  48.9  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.682407  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4259  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.33 
 
 
151 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.925226 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2046  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.82 
 
 
126 aa  49.3  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.33743e-17 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2213  hypothetical protein  32.54 
 
 
162 aa  48.9  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.666826 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>