176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0877 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_0877  methylmalonyl-CoA epimerase  100 
 
 
134 aa  270  5.000000000000001e-72  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.157449  normal  0.0450617 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1175  methylmalonyl-CoA epimerase  70.15 
 
 
134 aa  197  5e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0281042 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1170  methylmalonyl-CoA epimerase  55.64 
 
 
135 aa  156  1e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.107967  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0871  methylmalonyl-CoA epimerase  55.64 
 
 
135 aa  153  6e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1126  hypothetical protein  56.39 
 
 
135 aa  153  8e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1289  lactoylglutathione lyase  51.88 
 
 
137 aa  144  4.0000000000000006e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1167  methylmalonyl-CoA epimerase  53.38 
 
 
135 aa  140  5e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.217696  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1852  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  43.61 
 
 
133 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5823  methylmalonyl-CoA epimerase  41.48 
 
 
135 aa  106  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.609352 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1316  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  39.69 
 
 
135 aa  106  1e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0953  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  42.52 
 
 
131 aa  105  3e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0254493 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0586  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.93 
 
 
135 aa  103  7e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3306  methylmalonyl-CoA epimerase  41.67 
 
 
135 aa  103  7e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.369567  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0349  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  39.85 
 
 
134 aa  103  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0717499  normal  0.143694 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03285  Lactoylglutathione lyase and related lyase  40.6 
 
 
135 aa  101  3e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.275732  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4198  methylmalonyl-CoA epimerase  38.93 
 
 
134 aa  101  4e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.152541  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4223  methylmalonyl-CoA epimerase  38.93 
 
 
133 aa  101  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1361  methylmalonyl-CoA epimerase  41.48 
 
 
129 aa  101  4e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  2.7651e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0659  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  40.74 
 
 
134 aa  99.8  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00502246  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3303  methylmalonyl-CoA epimerase  41.3 
 
 
134 aa  99  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000981467  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0306  methylmalonyl-CoA epimerase  36.84 
 
 
141 aa  99  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4074  methylmalonyl-CoA epimerase  38.93 
 
 
133 aa  98.6  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0584893  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0200  methylmalonyl-CoA epimerase  40.6 
 
 
140 aa  98.2  3e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000715247  normal  0.843381 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0655  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  39.85 
 
 
134 aa  96.7  9e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195436  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0290  methylmalonyl-CoA epimerase  36.92 
 
 
133 aa  95.9  2e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2285  methylmalonyl-CoA epimerase  36.84 
 
 
140 aa  95.1  3e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000102737  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1488  methylmalonyl-CoA epimerase  38.81 
 
 
134 aa  95.1  3e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.383789  normal  0.131397 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3197  methylmalonyl-CoA epimerase  39.26 
 
 
134 aa  94.4  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3258  methylmalonyl-CoA epimerase  38.35 
 
 
134 aa  93.6  8e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000316472  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3253  methylmalonyl-CoA epimerase  39.1 
 
 
134 aa  93.6  9e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000018375  hitchhiker  3.27573e-17 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0104  methylmalonyl-CoA epimerase  36.64 
 
 
137 aa  93.6  9e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0228  methylmalonyl-CoA epimerase  39.55 
 
 
132 aa  92.8  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0230  methylmalonyl-CoA epimerase  37.68 
 
 
142 aa  91.7  3e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6000  methylmalonyl-CoA epimerase  37.12 
 
 
143 aa  91.7  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0251153 
 
 
-
 
NC_002950  PG1613  glyoxalase family protein  38.17 
 
 
134 aa  91.3  4e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0552  methylmalonyl-CoA epimerase  36.84 
 
 
134 aa  90.9  6e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1790  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  39.1 
 
 
158 aa  89.4  1e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0522  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.35 
 
 
134 aa  90.1  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000014865  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1564  methylmalonyl-CoA epimerase  37.31 
 
 
134 aa  89.4  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.395959 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0080  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.34 
 
 
135 aa  90.1  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0425619  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3891  methylmalonyl-CoA epimerase  37.86 
 
 
145 aa  89  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.394666  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4306  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.24 
 
 
161 aa  88.6  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.725625 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1341  methylmalonyl-CoA epimerase  35.38 
 
 
136 aa  88.2  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.886384  normal  0.16528 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2407  methylmalonyl-CoA epimerase  38.35 
 
 
134 aa  87.8  4e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.914364  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0455  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.3 
 
 
134 aa  87.4  6e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.571993 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2339  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.96 
 
 
168 aa  87.4  6e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.630848  normal  0.527959 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0558  methylmalonyl-CoA epimerase  35.34 
 
 
137 aa  87  9e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000977172  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0813  methylmalonyl-CoA epimerase  38.24 
 
 
134 aa  86.3  1e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2395  methylmalonyl-CoA epimerase  36.69 
 
 
147 aa  85.9  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.754558  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0571  methylmalonyl-CoA epimerase  36.09 
 
 
137 aa  85.5  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.82853e-18 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2364  methylmalonyl-CoA epimerase  38.93 
 
 
135 aa  86.3  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0384  methylmalonyl-CoA epimerase  38.81 
 
 
133 aa  85.9  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0818  glyoxalase family protein  38.24 
 
 
134 aa  84.7  4e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.688033  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09410  methylmalonyl-CoA epimerase  35.34 
 
 
145 aa  84  6e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.990135  normal  0.273906 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0812  methylmalonyl-CoA epimerase  38.52 
 
 
134 aa  84  7e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4406  methylmalonyl-CoA epimerase  38.69 
 
 
134 aa  84  7e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.865386  normal  0.62826 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3865  methylmalonyl-CoA epimerase  35.51 
 
 
156 aa  83.6  8e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.241683  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3939  methylmalonyl-CoA epimerase  35.51 
 
 
156 aa  83.6  8e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.368557  normal  0.0232297 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2469  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.52 
 
 
134 aa  83.6  8e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.186921 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0906  methylmalonyl-CoA epimerase  34.78 
 
 
134 aa  83.6  8e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.61726  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5865  methylmalonyl-CoA epimerase  33.08 
 
 
136 aa  82.8  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4142  methylmalonyl-CoA epimerase  37.96 
 
 
134 aa  82  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.65243  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2781  methylmalonyl-CoA epimerase  36.23 
 
 
141 aa  82  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1282  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.31 
 
 
134 aa  82.4  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3851  methylmalonyl-CoA epimerase  34.78 
 
 
156 aa  82.4  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00602371 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0368  methylmalonyl-CoA epimerase  37.78 
 
 
134 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.528801  normal  0.892682 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2348  methylmalonyl-CoA epimerase  40.77 
 
 
131 aa  82.4  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3282  methylmalonyl-CoA epimerase  34.81 
 
 
134 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.587333  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1038  methylmalonyl-CoA epimerase  35.56 
 
 
134 aa  81.3  0.000000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00716429  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1623  methylmalonyl-CoA epimerase  33.83 
 
 
136 aa  80.9  0.000000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0637  methylmalonyl-CoA epimerase  36.84 
 
 
134 aa  81.3  0.000000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.355591 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3164  methylmalonyl-CoA epimerase  37.78 
 
 
134 aa  80.1  0.000000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11354  hypothetical protein  34.07 
 
 
151 aa  80.1  0.000000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.498935  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1774  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.58 
 
 
139 aa  80.1  0.000000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000533955  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1733  lactoylglutathione lyase  36.3 
 
 
134 aa  79.7  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.881956  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2630  putative glyoxalase  37.04 
 
 
134 aa  79.7  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0581567 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1277  methylmalonyl-CoA epimerase  37.04 
 
 
134 aa  79.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.149828  normal  0.902197 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3210  methylmalonyl-CoA epimerase  35.56 
 
 
134 aa  79.3  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0791094  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0356  methylmalonyl-CoA epimerase  33.33 
 
 
192 aa  78.2  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4545  methylmalonyl-CoA epimerase  34.07 
 
 
134 aa  78.2  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0847692  normal  0.36006 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2017  glyoxalase family protein  30.08 
 
 
139 aa  78.2  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000114361  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0916  methylmalonyl-CoA epimerase  34.06 
 
 
140 aa  78.2  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.311023 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1773  glyoxalase family protein  30.08 
 
 
139 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00831345  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1910  glyoxalase family protein  30.08 
 
 
139 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000915588  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0639  methylmalonyl-CoA epimerase  30.88 
 
 
140 aa  77.8  0.00000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.237468  normal  0.259775 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1372  methylmalonyl-CoA epimerase  32.59 
 
 
139 aa  77.4  0.00000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0208267 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2178  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.04 
 
 
134 aa  77.4  0.00000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.794327  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1995  glyoxalase family protein  30.08 
 
 
139 aa  77  0.00000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00316995  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2934  methylmalonyl-CoA epimerase  36.3 
 
 
134 aa  77  0.00000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3428  glyoxalase family protein  31.62 
 
 
139 aa  77  0.00000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0993579  hitchhiker  0.000000357721 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1752  glyoxalase family protein  31.62 
 
 
139 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000441097  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1730  glyoxalase family protein  31.62 
 
 
139 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00522629  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2420  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.33 
 
 
134 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.132451  normal  0.0328629 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2204  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.07 
 
 
134 aa  76.3  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.269576  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1869  methylmalonyl-CoA epimerase  32.09 
 
 
134 aa  76.6  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.441583  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1946  glyoxalase family protein  31.62 
 
 
139 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5587800000000002e-23 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3611  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.35 
 
 
157 aa  76.6  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2006  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.83 
 
 
140 aa  76.3  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4617  methylmalonyl-CoA epimerase  35.56 
 
 
134 aa  75.9  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0621953 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1949  methylmalonyl-CoA epimerase  34.07 
 
 
157 aa  75.5  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.331779  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>