210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0200 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_0200  methylmalonyl-CoA epimerase  100 
 
 
140 aa  288  2e-77  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000715247  normal  0.843381 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3306  methylmalonyl-CoA epimerase  60.77 
 
 
135 aa  160  4.0000000000000004e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.369567  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3258  methylmalonyl-CoA epimerase  54.2 
 
 
134 aa  149  1e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000316472  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1282  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  50 
 
 
134 aa  142  1e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3303  methylmalonyl-CoA epimerase  51.91 
 
 
134 aa  142  2e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000981467  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0306  methylmalonyl-CoA epimerase  48.53 
 
 
141 aa  138  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0522  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  49.62 
 
 
134 aa  138  3e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000014865  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3253  methylmalonyl-CoA epimerase  51.15 
 
 
134 aa  135  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000018375  hitchhiker  3.27573e-17 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0655  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  48.09 
 
 
134 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195436  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2285  methylmalonyl-CoA epimerase  50 
 
 
140 aa  134  4e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000102737  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0571  methylmalonyl-CoA epimerase  47.33 
 
 
137 aa  134  4e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.82853e-18 
 
 
-
 
NC_002950  PG1613  glyoxalase family protein  51.15 
 
 
134 aa  133  7.000000000000001e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0558  methylmalonyl-CoA epimerase  46.56 
 
 
137 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000977172  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4223  methylmalonyl-CoA epimerase  48.82 
 
 
133 aa  127  7.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4198  methylmalonyl-CoA epimerase  47.69 
 
 
134 aa  125  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.152541  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0228  methylmalonyl-CoA epimerase  48.46 
 
 
132 aa  123  8.000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3197  methylmalonyl-CoA epimerase  46.56 
 
 
134 aa  122  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4074  methylmalonyl-CoA epimerase  47.2 
 
 
133 aa  121  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0584893  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0349  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  44.36 
 
 
134 aa  121  3e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0717499  normal  0.143694 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5823  methylmalonyl-CoA epimerase  48.09 
 
 
135 aa  121  4e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.609352 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1852  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  45.04 
 
 
133 aa  118  1.9999999999999998e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0586  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  48.06 
 
 
135 aa  118  3e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0659  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  47.33 
 
 
134 aa  117  3.9999999999999996e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00502246  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0152  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  39.39 
 
 
134 aa  117  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0455  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  44.27 
 
 
134 aa  117  6e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.571993 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0080  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  43.61 
 
 
135 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0425619  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2006  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.24 
 
 
140 aa  115  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09410  methylmalonyl-CoA epimerase  40.46 
 
 
145 aa  115  1.9999999999999998e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.990135  normal  0.273906 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0480  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.64 
 
 
134 aa  115  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1316  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  46.51 
 
 
135 aa  115  3e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1170  methylmalonyl-CoA epimerase  45.86 
 
 
135 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.107967  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1564  methylmalonyl-CoA epimerase  46.15 
 
 
134 aa  114  6e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.395959 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03285  Lactoylglutathione lyase and related lyase  44.27 
 
 
135 aa  114  6e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.275732  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1488  methylmalonyl-CoA epimerase  41.67 
 
 
134 aa  112  1.0000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.383789  normal  0.131397 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0356  methylmalonyl-CoA epimerase  41.91 
 
 
192 aa  111  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2395  methylmalonyl-CoA epimerase  42.34 
 
 
147 aa  111  3e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.754558  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1289  lactoylglutathione lyase  47.73 
 
 
137 aa  111  4.0000000000000004e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0290  methylmalonyl-CoA epimerase  40.62 
 
 
133 aa  108  3e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2364  methylmalonyl-CoA epimerase  44.62 
 
 
135 aa  108  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3891  methylmalonyl-CoA epimerase  43.48 
 
 
145 aa  108  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.394666  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5865  methylmalonyl-CoA epimerase  38.93 
 
 
136 aa  107  4.0000000000000004e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0552  methylmalonyl-CoA epimerase  40.31 
 
 
134 aa  107  5e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0871  methylmalonyl-CoA epimerase  43.61 
 
 
135 aa  107  7.000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0953  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  40 
 
 
131 aa  106  1e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0254493 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1258  methylmalonyl-CoA epimerase  41.91 
 
 
147 aa  105  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1175  methylmalonyl-CoA epimerase  42.11 
 
 
134 aa  103  5e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0281042 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2781  methylmalonyl-CoA epimerase  40.44 
 
 
141 aa  102  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1790  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  39.42 
 
 
158 aa  102  2e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2507  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  40.44 
 
 
141 aa  102  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0106102  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1167  methylmalonyl-CoA epimerase  41.48 
 
 
135 aa  101  4e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.217696  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2339  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.93 
 
 
168 aa  99.8  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.630848  normal  0.527959 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1773  glyoxalase family protein  35.29 
 
 
139 aa  99  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00831345  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0981  methylmalonyl-CoA epimerase  36.09 
 
 
139 aa  99.4  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0245792  normal  0.390705 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1910  glyoxalase family protein  35.29 
 
 
139 aa  99  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000915588  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4306  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.24 
 
 
161 aa  99  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.725625 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0877  methylmalonyl-CoA epimerase  40.6 
 
 
134 aa  98.2  3e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.157449  normal  0.0450617 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3611  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.81 
 
 
157 aa  98.2  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1774  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.29 
 
 
139 aa  97.8  4e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000533955  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3428  glyoxalase family protein  35.29 
 
 
139 aa  97.8  4e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0993579  hitchhiker  0.000000357721 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1995  glyoxalase family protein  35.29 
 
 
139 aa  97.8  5e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00316995  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1752  glyoxalase family protein  35.29 
 
 
139 aa  97.4  6e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000441097  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1730  glyoxalase family protein  35.29 
 
 
139 aa  97.4  6e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00522629  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1946  glyoxalase family protein  35.29 
 
 
139 aa  97.4  6e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5587800000000002e-23 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3993  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.92 
 
 
159 aa  97.1  8e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00061687 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6000  methylmalonyl-CoA epimerase  37.21 
 
 
143 aa  96.7  9e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0251153 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1796  methylmalonyl-CoA epimerase  36.84 
 
 
170 aa  96.3  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2017  glyoxalase family protein  34.56 
 
 
139 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000114361  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3865  methylmalonyl-CoA epimerase  35.29 
 
 
156 aa  95.9  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.241683  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3939  methylmalonyl-CoA epimerase  35.29 
 
 
156 aa  95.9  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.368557  normal  0.0232297 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3851  methylmalonyl-CoA epimerase  35.29 
 
 
156 aa  95.5  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00602371 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4113  methylmalonyl-CoA epimerase  37.68 
 
 
162 aa  95.1  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0776501  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0230  methylmalonyl-CoA epimerase  35.29 
 
 
142 aa  94.7  4e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1916  glyoxalase family protein  34.56 
 
 
139 aa  94.7  4e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.037102  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1126  hypothetical protein  41.91 
 
 
135 aa  94.4  5e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6105  methylmalonyl-CoA epimerase  36.03 
 
 
146 aa  93.6  8e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1282  methylmalonyl-CoA epimerase  35.82 
 
 
142 aa  93.6  8e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.922944  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0104  methylmalonyl-CoA epimerase  35.38 
 
 
137 aa  93.2  1e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0680  methylmalonyl-CoA epimerase  40.31 
 
 
131 aa  92.4  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.227621  normal  0.151437 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0916  methylmalonyl-CoA epimerase  34.06 
 
 
140 aa  91.3  4e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.311023 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3104  methylmalonyl-CoA epimerase  40.62 
 
 
163 aa  90.1  9e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000698993  hitchhiker  0.0000492352 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0639  methylmalonyl-CoA epimerase  32.58 
 
 
140 aa  90.1  1e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.237468  normal  0.259775 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1361  methylmalonyl-CoA epimerase  36.84 
 
 
129 aa  89.7  1e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  2.7651e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1623  methylmalonyl-CoA epimerase  31.25 
 
 
136 aa  89.4  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1989  methylmalonyl-CoA epimerase  36.92 
 
 
127 aa  89.4  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1013  methylmalonyl-CoA epimerase  36.15 
 
 
128 aa  88.6  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.752457  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28560  methylmalonyl-CoA epimerase  35.25 
 
 
153 aa  88.6  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.215327 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0555  methylmalonyl-CoA epimerase  36.43 
 
 
127 aa  88.6  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2348  methylmalonyl-CoA epimerase  39.69 
 
 
131 aa  87.8  4e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1696  methylmalonyl-CoA epimerase  33.82 
 
 
140 aa  87.8  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.019096  normal  0.134039 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2887  methylmalonyl-CoA epimerase  38.17 
 
 
129 aa  85.9  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.228803  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4406  methylmalonyl-CoA epimerase  39.1 
 
 
134 aa  84  6e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.865386  normal  0.62826 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11354  hypothetical protein  32.33 
 
 
151 aa  84  6e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.498935  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2892  methylmalonyl-CoA epimerase  36.76 
 
 
141 aa  84  7e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.20735 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0810  methylmalonyl-CoA epimerase  35.21 
 
 
146 aa  82.8  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1277  methylmalonyl-CoA epimerase  38.35 
 
 
134 aa  82  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.149828  normal  0.902197 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4142  methylmalonyl-CoA epimerase  39.26 
 
 
134 aa  82  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.65243  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1341  methylmalonyl-CoA epimerase  33.07 
 
 
136 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.886384  normal  0.16528 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1369  methylmalonyl-CoA epimerase  38.35 
 
 
134 aa  80.9  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1869  methylmalonyl-CoA epimerase  31.3 
 
 
134 aa  80.9  0.000000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.441583  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2407  methylmalonyl-CoA epimerase  37.4 
 
 
134 aa  80.9  0.000000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.914364  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>