168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_4523 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_4523  superoxide dismutase  100 
 
 		 510 aa  1022    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2599  superoxide dismutase, copper/zinc binding  60.87 
 
 		 239 aa  219  7e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00595972  normal  0.45771 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3300  superoxide dismutase  38.57 
 
 		 332 aa  148  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0522021  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2064  superoxide dismutase  37.68 
 
 		 322 aa  144  3e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3570  superoxide dismutase  39.86 
 
 		 331 aa  140  6e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3820  superoxide dismutase (sodC), Cu-Zn family  31.96 
 
 		 320 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.673254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0224  superoxide dismutase copper/zinc binding  45.57 
 
 		 172 aa  113  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.504945  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4681  Superoxide dismutase  44.03 
 
 		 208 aa  110  5e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.179058 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3067  Superoxide dismutase  42.21 
 
 		 175 aa  108  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00079657 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3011  superoxide dismutase copper/zinc binding protein  39.05 
 
 		 174 aa  105  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0488  superoxide dismutase, copper/zinc binding  40.49 
 
 		 172 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2368  superoxide dismutase Cu-Zn precursor protein  40.11 
 
 		 182 aa  103  6e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0422357 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2796  copper/Zinc superoxide dismutase  40.35 
 
 		 169 aa  103  6e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.914684 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2345  superoxide dismutase  38.75 
 
 		 178 aa  103  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0211561  normal  0.0730316 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4070  superoxide dismutase copper/zinc binding  40 
 
 		 171 aa  101  3e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.273253  normal  0.944661 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0703  superoxide dismutase, Cu-Zn  37.66 
 
 		 173 aa  98.6  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2581  superoxide dismutase copper/zinc binding  42.31 
 
 		 183 aa  99  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.152888  normal  0.324375 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0659  superoxide dismutase, Cu-Zn  37.66 
 
 		 173 aa  98.6  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2177  superoxide dismutase copper/zinc binding  42.31 
 
 		 183 aa  97.4  5e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.462725  normal  0.0481765 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2865  superoxide dismutase copper/zinc binding  36.59 
 
 		 172 aa  97.4  5e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3597  superoxide dismutase, copper/zinc binding  40.49 
 
 		 169 aa  97.1  7e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.592346  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4965  hypothetical protein  30.39 
 
 		 325 aa  95.9  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1610  Superoxide dismutase  41.91 
 
 		 184 aa  94  5e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0906  superoxide dismutase, Cu/Zn  40.88 
 
 		 192 aa  94  7e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.381444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4338  copper/Zinc superoxide dismutase  38.85 
 
 		 180 aa  93.6  8e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3389  hypothetical protein  33.46 
 
 		 315 aa  92.8  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1980  superoxide dismutase, copper/zinc binding  36.42 
 
 		 183 aa  92.8  1e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0783595 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3220  superoxide dismutase, copper/zinc binding  37.5 
 
 		 173 aa  92.4  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3942  superoxide dismutase copper/zinc binding  40.91 
 
 		 212 aa  92  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379903  normal  0.128954 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2757  superoxide dismutase, copper/zinc binding  43.48 
 
 		 191 aa  91.3  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00492325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2943  copper/Zinc superoxide dismutase  37.06 
 
 		 172 aa  90.5  6e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.171551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1880  superoxide dismutase copper/zinc binding  34.32 
 
 		 175 aa  90.1  8e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4777  superoxide dismutase, Cu-Zn  34.46 
 
 		 179 aa  90.1  9e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4617  superoxide dismutase, Cu-Zn  34.46 
 
 		 179 aa  90.1  9e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4639  superoxide dismutase, Cu-Zn  34.46 
 
 		 179 aa  90.1  9e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5139  superoxide dismutase, Cu-Zn  34.46 
 
 		 179 aa  90.1  9e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2057  superoxide dismutase, copper/zinc binding  36.03 
 
 		 175 aa  90.1  9e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0494601  normal  0.319354 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5051  superoxide dismutase, Cu-Zn  34.46 
 
 		 179 aa  90.1  9e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0442  superoxide dismutase, copper/zinc binding  39.55 
 
 		 185 aa  89.7  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.039325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0365  hypothetical protein  34.29 
 
 		 334 aa  89.7  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4729  superoxide dismutase copper/zinc binding  33.14 
 
 		 179 aa  89  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1796  putative copper/Zinc superoxide dismutase  38.42 
 
 		 185 aa  87.8  4e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.749298  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5018  superoxide dismutase, Cu-Zn  35.06 
 
 		 165 aa  87  7e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5046  superoxide dismutase, Cu-Zn  33.14 
 
 		 179 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5039  superoxide dismutase, Cu-Zn  33.14 
 
 		 179 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.792086  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0195  superoxide dismutase, Cu-Zn  32.77 
 
 		 179 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1782  copper/Zinc superoxide dismutase  37.18 
 
 		 156 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1009  superoxide dismutase copper/zinc binding  37.2 
 
 		 171 aa  85.1  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.814161 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30470  CU-Zn Superoxide dismutase  38.35 
 
 		 180 aa  85.1  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3711  superoxide dismutase copper/zinc binding  40.24 
 
 		 180 aa  84.7  0.000000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0817  superoxide dismutase, copper/zinc binding  35.36 
 
 		 226 aa  84.3  0.000000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.509975  decreased coverage  0.0003056 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3418  hypothetical protein  27.9 
 
 		 326 aa  84.7  0.000000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1161  superoxide dismutase copper/zinc binding  36.59 
 
 		 171 aa  84.3  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.552065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2653  superoxide dismutase, copper/zinc binding  36.49 
 
 		 182 aa  84.3  0.000000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.792961  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2125  superoxide dismutase, copper/zinc binding  36.84 
 
 		 170 aa  83.6  0.000000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0013475  normal  0.0132534 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4761  superoxide dismutase, copper/zinc binding  31.55 
 
 		 179 aa  84  0.000000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.271734  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3518  superoxide dismutase copper/zinc binding  33.97 
 
 		 180 aa  84  0.000000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2024  superoxide dismutase, copper/zinc binding  33.99 
 
 		 170 aa  83.2  0.000000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000023752  hitchhiker  0.00000198076 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1951  superoxide dismutase, copper/zinc binding protein  33.99 
 
 		 170 aa  83.2  0.000000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0285693  hitchhiker  0.00191784 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0454  superoxide dismutase, copper/zinc binding  39.6 
 
 		 190 aa  83.6  0.000000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.101401  normal  0.041937 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3135  superoxide dismutase, copper/zinc binding  39.39 
 
 		 191 aa  82.4  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.310957  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1900  superoxide dismutase, copper/zinc binding  36.69 
 
 		 185 aa  82  0.00000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.370601  normal  0.24871 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2297  superoxide dismutase, copper/zinc binding  31.05 
 
 		 180 aa  82  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.011982  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3827  superoxide dismutase  34.48 
 
 		 173 aa  82.8  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1082  copper/zinc superoxide dismutase  33.12 
 
 		 177 aa  81.6  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.302029 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1419  copper/zinc superoxide dismutase  33.12 
 
 		 177 aa  81.6  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0294455 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0538  superoxide dismutase copper/zinc binding  36.57 
 
 		 178 aa  81.6  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0765812  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1154  copper/zinc superoxide dismutase  33.12 
 
 		 177 aa  81.6  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2872  superoxide dismutase copper/zinc binding  36.08 
 
 		 169 aa  81.6  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0217452 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2101  superoxide dismutase copper/zinc binding  34.76 
 
 		 174 aa  81.3  0.00000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.651227  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3554  superoxide dismutase  34.39 
 
 		 171 aa  81.3  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642978  normal  0.247145 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1634  superoxide dismutase, copper/zinc binding  38.16 
 
 		 165 aa  81.3  0.00000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.725775 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2485  superoxide dismutase  36.84 
 
 		 171 aa  80.9  0.00000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.841642  normal  0.166633 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3449  superoxide dismutase, copper/zinc binding  29.65 
 
 		 180 aa  80.5  0.00000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000937306 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0125  superoxide dismutase copper/zinc binding  38.85 
 
 		 206 aa  80.5  0.00000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.100957 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03307  superoxide dismutase, Cu-Zn  35.61 
 
 		 181 aa  80.1  0.00000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00782096  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0124  superoxide dismutase copper/zinc binding  38.36 
 
 		 189 aa  79.3  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0952022 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1626  superoxide dismutase, copper/zinc binding  38.79 
 
 		 177 aa  78.6  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3638  superoxide dismutase, copper/zinc binding  31.1 
 
 		 173 aa  79  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1347  superoxide dismutase, copper/zinc binding  33.56 
 
 		 183 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06578  hypothetical protein  36.26 
 
 		 170 aa  78.2  0.0000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03561  superoxide dismutase  38.66 
 
 		 203 aa  76.6  0.0000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0511  superoxide dismutase [Cu-Zn] precursor  33.83 
 
 		 170 aa  76.3  0.000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.59112  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1801  superoxide dismutase  31.9 
 
 		 172 aa  76.3  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0159903  normal  0.0303591 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1154  copper/Zinc superoxide dismutase  34.64 
 
 		 172 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.744174 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2210  superoxide dismutase  33.56 
 
 		 173 aa  75.5  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0109092  hitchhiker  0.000454174 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0852  superoxide dismutase, copper/zinc binding  40.3 
 
 		 183 aa  75.1  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.260138 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3163  superoxide dismutase (Cu-Zn)  34.48 
 
 		 174 aa  75.1  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.315078  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3728  superoxide dismutase copper/zinc binding protein  31.18 
 
 		 244 aa  74.7  0.000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1186  superoxide dismutase, Cu-Zn  32.69 
 
 		 171 aa  74.3  0.000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3315  copper/zinc superoxide dismutase  37.4 
 
 		 195 aa  74.3  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.151154  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0978  copper/zinc superoxide dismutase  35.34 
 
 		 189 aa  74.3  0.000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3445  superoxide dismutase  37.4 
 
 		 201 aa  74.3  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0664  superoxide dismutase copper/zinc binding protein  29.69 
 
 		 218 aa  73.9  0.000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0397  superoxide dismutase, copper/zinc binding  36.15 
 
 		 176 aa  73.6  0.000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1200  putative superoxide dismutase  33.79 
 
 		 219 aa  73.2  0.000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1838  superoxide dismutase  32.89 
 
 		 173 aa  72  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.159694  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4195  superoxide dismutase copper/zinc binding  31.47 
 
 		 210 aa  72  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001207  superoxide dismutase [Cu-Zn] precursor  34.07 
 
 		 171 aa  72  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1552  superoxide dismutase  33.56 
 
 		 173 aa  72  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0496165  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>