151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1347 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



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Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009439  Pmen_1347  superoxide dismutase, copper/zinc binding  100 
 
 
183 aa  368  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30470  CU-Zn Superoxide dismutase  58.86 
 
 
180 aa  204  6e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0659  superoxide dismutase, Cu-Zn  66.23 
 
 
174 aa  197  7e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2101  superoxide dismutase copper/zinc binding  54.86 
 
 
174 aa  197  7.999999999999999e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.651227  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1200  putative superoxide dismutase  54.29 
 
 
219 aa  196  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3163  superoxide dismutase (Cu-Zn)  55.36 
 
 
174 aa  196  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.315078  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001207  superoxide dismutase [Cu-Zn] precursor  58.64 
 
 
171 aa  195  3e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1154  copper/zinc superoxide dismutase  53.49 
 
 
177 aa  193  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1419  copper/zinc superoxide dismutase  53.49 
 
 
177 aa  193  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0294455 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1082  copper/zinc superoxide dismutase  53.49 
 
 
177 aa  193  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.302029 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2125  superoxide dismutase, copper/zinc binding  56 
 
 
170 aa  189  2e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0013475  normal  0.0132534 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1186  superoxide dismutase, Cu-Zn  52.3 
 
 
171 aa  189  2.9999999999999997e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2485  superoxide dismutase  55.62 
 
 
171 aa  187  7e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.841642  normal  0.166633 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2024  superoxide dismutase, copper/zinc binding  61.44 
 
 
170 aa  187  8e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000023752  hitchhiker  0.00000198076 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1951  superoxide dismutase, copper/zinc binding protein  61.44 
 
 
170 aa  187  8e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0285693  hitchhiker  0.00191784 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2210  superoxide dismutase  54.29 
 
 
173 aa  186  1e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0109092  hitchhiker  0.000454174 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0978  copper/zinc superoxide dismutase  53.75 
 
 
189 aa  187  1e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3445  superoxide dismutase  53.75 
 
 
201 aa  186  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3315  copper/zinc superoxide dismutase  53.75 
 
 
195 aa  185  3e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.151154  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1154  copper/Zinc superoxide dismutase  53.45 
 
 
172 aa  179  1e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.744174 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06578  hypothetical protein  53.57 
 
 
170 aa  180  1e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3638  superoxide dismutase, copper/zinc binding  53.7 
 
 
173 aa  177  1e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1338  superoxide dismutase, Cu-Zn  53.71 
 
 
172 aa  176  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01616  superoxide dismutase, Cu, Zn  51.7 
 
 
173 aa  174  6e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00181178  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1994  Superoxide dismutase  51.7 
 
 
173 aa  174  6e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000374216  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2358  superoxide dismutase  51.7 
 
 
173 aa  174  6e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000359959  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1723  superoxide dismutase  51.7 
 
 
173 aa  174  6e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.335611  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1857  superoxide dismutase  51.7 
 
 
173 aa  174  6e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.195407  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01606  hypothetical protein  51.7 
 
 
173 aa  174  6e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00112048  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1983  superoxide dismutase  51.7 
 
 
178 aa  174  7e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0141955  hitchhiker  0.00119703 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1552  superoxide dismutase  51.7 
 
 
173 aa  174  7e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0496165  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0511  superoxide dismutase [Cu-Zn] precursor  57.86 
 
 
170 aa  174  8e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.59112  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1838  superoxide dismutase  51.14 
 
 
173 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.159694  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3827  superoxide dismutase  50.29 
 
 
173 aa  169  1e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1610  superoxide dismutase  51.7 
 
 
173 aa  169  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.815221 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1903  superoxide dismutase  51.7 
 
 
173 aa  169  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.292339  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1550  superoxide dismutase  51.7 
 
 
173 aa  169  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1537  superoxide dismutase  51.7 
 
 
173 aa  169  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.19125  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1734  superoxide dismutase  51.7 
 
 
173 aa  169  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0827551  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2022  superoxide dismutase (Cu-Zn)  51.15 
 
 
170 aa  168  4e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0122  superoxide dismutase (Cu/Zn)  50.63 
 
 
179 aa  167  1e-40  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.291157  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0703  superoxide dismutase, Cu-Zn  52.56 
 
 
173 aa  166  2e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0397  superoxide dismutase, copper/zinc binding  56.08 
 
 
176 aa  166  2e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0659  superoxide dismutase, Cu-Zn  52.56 
 
 
173 aa  166  2e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2653  superoxide dismutase, copper/zinc binding  50.64 
 
 
182 aa  164  8e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.792961  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03307  superoxide dismutase, Cu-Zn  48.85 
 
 
181 aa  161  4.0000000000000004e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00782096  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2297  superoxide dismutase, copper/zinc binding  53.57 
 
 
180 aa  161  5.0000000000000005e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.011982  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1801  superoxide dismutase  49.14 
 
 
172 aa  159  3e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0159903  normal  0.0303591 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0161  copper/zinc superoxide dismutase  48.73 
 
 
178 aa  158  4e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00000919214  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0788  copper/zinc superoxide dismutase  42.08 
 
 
178 aa  154  6e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1330  copper/zinc superoxide dismutase  44.2 
 
 
186 aa  154  9e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.236149  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2297  superoxide dismutase [Cu-Zn] precursor  51.09 
 
 
162 aa  134  8e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1507  superoxide dismutase precursor (Cu-Zn)  44.07 
 
 
178 aa  132  1.9999999999999998e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.814898  normal  0.841266 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2270  superoxide dismutase [Cu-Zn] precursor  50.36 
 
 
162 aa  131  6e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0538  superoxide dismutase copper/zinc binding  43.58 
 
 
178 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0765812  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0982  putative superoxide dismutase  41.57 
 
 
175 aa  126  1.0000000000000001e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  decreased coverage  0.000174344  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2599  superoxide dismutase, copper/zinc binding  34.69 
 
 
239 aa  87.8  8e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00595972  normal  0.45771 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2872  superoxide dismutase copper/zinc binding  34.46 
 
 
169 aa  83.2  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0217452 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2796  copper/Zinc superoxide dismutase  30.73 
 
 
169 aa  82  0.000000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.914684 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4761  superoxide dismutase, copper/zinc binding  30.16 
 
 
179 aa  80.5  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.271734  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3011  superoxide dismutase copper/zinc binding protein  32 
 
 
174 aa  79.3  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2865  superoxide dismutase copper/zinc binding  32.93 
 
 
172 aa  79.3  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4523  superoxide dismutase  33.56 
 
 
510 aa  79  0.00000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0906  superoxide dismutase, Cu/Zn  38.71 
 
 
192 aa  78.6  0.00000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.381444  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3449  superoxide dismutase, copper/zinc binding  35.97 
 
 
180 aa  77.8  0.00000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  0.00000937306 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3343  superoxide dismutase copper/zinc binding protein  35.52 
 
 
210 aa  77  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0409606 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0442  superoxide dismutase, copper/zinc binding  36.55 
 
 
185 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.039325  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1796  putative copper/Zinc superoxide dismutase  35.86 
 
 
185 aa  76.3  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.749298  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3135  superoxide dismutase, copper/zinc binding  32.39 
 
 
191 aa  75.9  0.0000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.310957  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0224  superoxide dismutase copper/zinc binding  32.45 
 
 
172 aa  75.1  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.504945  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0488  superoxide dismutase, copper/zinc binding  31.85 
 
 
172 aa  73.9  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3597  superoxide dismutase, copper/zinc binding  31.79 
 
 
169 aa  72.8  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.592346  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08070  superoxide dismutase (Cu-Zn)  34.62 
 
 
158 aa  72  0.000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000475437  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4679  superoxide dismutase copper/zinc binding  33.33 
 
 
201 aa  71.6  0.000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.841473 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0122  superoxide dismutase copper/zinc binding  32.88 
 
 
179 aa  72  0.000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.542638  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4310  superoxide dismutase copper/zinc binding  33.33 
 
 
201 aa  71.6  0.000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.366806  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3819  superoxide dismutase copper/zinc binding  33.95 
 
 
179 aa  71.2  0.000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.130006  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1634  superoxide dismutase, copper/zinc binding  34.46 
 
 
165 aa  70.9  0.000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.725775 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4681  Superoxide dismutase  32.39 
 
 
208 aa  69.3  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.179058 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2345  superoxide dismutase  30.17 
 
 
178 aa  69.3  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0211561  normal  0.0730316 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1610  Superoxide dismutase  32.64 
 
 
184 aa  68.9  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2943  copper/Zinc superoxide dismutase  35 
 
 
172 aa  68.9  0.00000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.171551  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2378  superoxide dismutase copper/zinc binding  32.2 
 
 
177 aa  68.9  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1880  superoxide dismutase copper/zinc binding  30.36 
 
 
175 aa  68.6  0.00000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4338  copper/Zinc superoxide dismutase  32.37 
 
 
180 aa  68.2  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2057  superoxide dismutase, copper/zinc binding  30.91 
 
 
175 aa  67.8  0.00000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0494601  normal  0.319354 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3067  Superoxide dismutase  30.46 
 
 
175 aa  67  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00079657 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12203  Copper/Zinc superoxide dismutase  29.87 
 
 
194 aa  66.6  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.348099  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2767  superoxide dismutase copper/zinc binding protein  30.95 
 
 
204 aa  66.6  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.238721 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1980  superoxide dismutase, copper/zinc binding  32 
 
 
183 aa  66.2  0.0000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0783595 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1561  superoxide dismutase copper/zinc binding  29.19 
 
 
172 aa  65.5  0.0000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.639151  normal  0.731272 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4827  superoxide dismutase copper/zinc binding  31.41 
 
 
201 aa  65.1  0.0000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.661461  normal  0.600787 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0125  superoxide dismutase copper/zinc binding  33.79 
 
 
206 aa  65.1  0.0000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.100957 
 
 
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NC_009428  Rsph17025_0454  superoxide dismutase, copper/zinc binding  31.76 
 
 
190 aa  65.1  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.101401  normal  0.041937 
 
 
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NC_009921  Franean1_4059  superoxide dismutase copper/zinc binding  33.9 
 
 
214 aa  65.1  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.453641  normal  0.169503 
 
 
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NC_007948  Bpro_3554  superoxide dismutase  29.71 
 
 
171 aa  64.7  0.0000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642978  normal  0.247145 
 
 
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NC_007643  Rru_A1782  copper/Zinc superoxide dismutase  34 
 
 
156 aa  63.9  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_008048  Sala_0817  superoxide dismutase, copper/zinc binding  34.72 
 
 
226 aa  64.3  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.509975  decreased coverage  0.0003056 
 
 
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NC_010718  Nther_0733  superoxide dismutase copper/zinc binding  32.88 
 
 
175 aa  64.3  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000189816  normal 
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_4729  superoxide dismutase copper/zinc binding  29.73 
 
 
179 aa  63.9  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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