166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0906 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



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Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007404  Tbd_0906  superoxide dismutase, Cu/Zn  100 
 
 
192 aa  381  1e-105  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.381444  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3942  superoxide dismutase copper/zinc binding  46.85 
 
 
212 aa  129  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379903  normal  0.128954 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1610  Superoxide dismutase  47.62 
 
 
184 aa  125  5e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2943  copper/Zinc superoxide dismutase  49.3 
 
 
172 aa  123  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.171551  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3449  superoxide dismutase, copper/zinc binding  47.18 
 
 
180 aa  123  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  0.00000937306 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2368  superoxide dismutase Cu-Zn precursor protein  44.3 
 
 
182 aa  122  3e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0422357 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2177  superoxide dismutase copper/zinc binding  43.54 
 
 
183 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.462725  normal  0.0481765 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2581  superoxide dismutase copper/zinc binding  43.54 
 
 
183 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.152888  normal  0.324375 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4681  Superoxide dismutase  46.36 
 
 
208 aa  115  3e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.179058 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3135  superoxide dismutase, copper/zinc binding  43.15 
 
 
191 aa  115  5e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.310957  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2757  superoxide dismutase, copper/zinc binding  45.99 
 
 
191 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00492325  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2057  superoxide dismutase, copper/zinc binding  44.52 
 
 
175 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0494601  normal  0.319354 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1626  superoxide dismutase, copper/zinc binding  36 
 
 
177 aa  110  1.0000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1880  superoxide dismutase copper/zinc binding  44.52 
 
 
175 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3554  superoxide dismutase  39.88 
 
 
171 aa  108  4.0000000000000004e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642978  normal  0.247145 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0124  superoxide dismutase copper/zinc binding  41.06 
 
 
189 aa  108  5e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0952022 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3011  superoxide dismutase copper/zinc binding protein  39.2 
 
 
174 aa  108  7.000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03561  superoxide dismutase  40 
 
 
203 aa  107  1e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0125  superoxide dismutase copper/zinc binding  41.67 
 
 
206 aa  106  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.100957 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3067  Superoxide dismutase  43.02 
 
 
175 aa  105  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00079657 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4761  superoxide dismutase, copper/zinc binding  35.56 
 
 
179 aa  105  6e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.271734  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12203  Copper/Zinc superoxide dismutase  42.36 
 
 
194 aa  104  8e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.348099  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4338  copper/Zinc superoxide dismutase  38.3 
 
 
180 aa  104  8e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3711  superoxide dismutase copper/zinc binding  46.76 
 
 
180 aa  103  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_28559  predicted protein  42.31 
 
 
197 aa  103  2e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000859292  hitchhiker  0.000000574282 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2796  copper/Zinc superoxide dismutase  39.08 
 
 
169 aa  99.8  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.914684 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2865  superoxide dismutase copper/zinc binding  35.96 
 
 
172 aa  100  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2345  superoxide dismutase  40.94 
 
 
178 aa  99.4  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0211561  normal  0.0730316 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1980  superoxide dismutase, copper/zinc binding  43.8 
 
 
183 aa  99.4  3e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0783595 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0224  superoxide dismutase copper/zinc binding  45.53 
 
 
172 aa  97.4  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.504945  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3597  superoxide dismutase, copper/zinc binding  39.6 
 
 
169 aa  95.9  3e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.592346  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2599  superoxide dismutase, copper/zinc binding  43.04 
 
 
239 aa  94.7  6e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00595972  normal  0.45771 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0488  superoxide dismutase, copper/zinc binding  43.2 
 
 
172 aa  94  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4523  superoxide dismutase  40.88 
 
 
510 aa  93.6  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4070  superoxide dismutase copper/zinc binding  41.22 
 
 
171 aa  94.4  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.273253  normal  0.944661 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3220  superoxide dismutase, copper/zinc binding  36.05 
 
 
173 aa  92  5e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03563  superoxide dismutase  39.6 
 
 
200 aa  91.7  7e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND01490  copper zinc superoxide dismutase  42.38 
 
 
154 aa  90.9  1e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.452302  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00241  Superoxide dismutase [Cu-Zn] (EC 1.15.1.1) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q9HEY7]  41.72 
 
 
154 aa  90.1  2e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1782  copper/Zinc superoxide dismutase  41.38 
 
 
156 aa  89  4e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1900  superoxide dismutase, copper/zinc binding  34.81 
 
 
185 aa  88.6  5e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.370601  normal  0.24871 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89018  Superoxide dismutase (Cu-Zn)  40.4 
 
 
154 aa  86.3  2e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.204777  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4777  superoxide dismutase, Cu-Zn  38.76 
 
 
179 aa  85.5  5e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4617  superoxide dismutase, Cu-Zn  38.76 
 
 
179 aa  85.5  5e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4639  superoxide dismutase, Cu-Zn  38.76 
 
 
179 aa  85.5  5e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5139  superoxide dismutase, Cu-Zn  38.76 
 
 
179 aa  85.5  5e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5051  superoxide dismutase, Cu-Zn  38.76 
 
 
179 aa  85.5  5e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5018  superoxide dismutase, Cu-Zn  38.76 
 
 
165 aa  84.7  7e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001207  superoxide dismutase [Cu-Zn] precursor  34.86 
 
 
171 aa  84.7  7e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5046  superoxide dismutase, Cu-Zn  37.21 
 
 
179 aa  84  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1186  superoxide dismutase, Cu-Zn  38.1 
 
 
171 aa  84  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4729  superoxide dismutase copper/zinc binding  37.98 
 
 
179 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0703  superoxide dismutase, Cu-Zn  34.1 
 
 
173 aa  83.2  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5039  superoxide dismutase, Cu-Zn  38.46 
 
 
179 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.792086  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0659  superoxide dismutase, Cu-Zn  34.1 
 
 
173 aa  83.2  0.000000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0195  superoxide dismutase, Cu-Zn  37.21 
 
 
179 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3638  superoxide dismutase, copper/zinc binding  34.42 
 
 
173 aa  82  0.000000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0817  superoxide dismutase, copper/zinc binding  41.46 
 
 
226 aa  80.1  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.509975  decreased coverage  0.0003056 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2125  superoxide dismutase, copper/zinc binding  41.1 
 
 
170 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0013475  normal  0.0132534 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2024  superoxide dismutase, copper/zinc binding  41.1 
 
 
170 aa  79.3  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000023752  hitchhiker  0.00000198076 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1951  superoxide dismutase, copper/zinc binding protein  41.1 
 
 
170 aa  79.3  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0285693  hitchhiker  0.00191784 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06578  hypothetical protein  42.74 
 
 
170 aa  79  0.00000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_15852  predicted protein  40.15 
 
 
138 aa  79  0.00000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0113934  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1347  superoxide dismutase, copper/zinc binding  38.71 
 
 
183 aa  78.6  0.00000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0511  superoxide dismutase [Cu-Zn] precursor  37.04 
 
 
170 aa  78.2  0.00000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.59112  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2297  superoxide dismutase, copper/zinc binding  37.67 
 
 
180 aa  78.2  0.00000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.011982  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30470  CU-Zn Superoxide dismutase  36.17 
 
 
180 aa  76.3  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2022  superoxide dismutase (Cu-Zn)  37.59 
 
 
170 aa  76.3  0.0000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0659  superoxide dismutase, Cu-Zn  37.25 
 
 
174 aa  75.9  0.0000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03307  superoxide dismutase, Cu-Zn  36.43 
 
 
181 aa  76.3  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00782096  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3518  superoxide dismutase copper/zinc binding  35.29 
 
 
180 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1838  superoxide dismutase  33.15 
 
 
173 aa  74.3  0.0000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.159694  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1634  superoxide dismutase, copper/zinc binding  43.27 
 
 
165 aa  74.3  0.0000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.725775 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3343  superoxide dismutase copper/zinc binding protein  36.97 
 
 
210 aa  74.3  0.0000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0409606 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2653  superoxide dismutase, copper/zinc binding  38.52 
 
 
182 aa  74.3  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.792961  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3827  superoxide dismutase  35.94 
 
 
173 aa  73.6  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1507  superoxide dismutase precursor (Cu-Zn)  34.33 
 
 
178 aa  72.8  0.000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.814898  normal  0.841266 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1552  superoxide dismutase  33.15 
 
 
173 aa  72.8  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0496165  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0978  copper/zinc superoxide dismutase  39.84 
 
 
189 aa  72.8  0.000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01616  superoxide dismutase, Cu, Zn  32.61 
 
 
173 aa  72.4  0.000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00181178  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1994  Superoxide dismutase  32.61 
 
 
173 aa  72.4  0.000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000374216  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1154  copper/zinc superoxide dismutase  38.71 
 
 
177 aa  72.4  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2358  superoxide dismutase  32.61 
 
 
173 aa  72.4  0.000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000359959  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1082  copper/zinc superoxide dismutase  38.71 
 
 
177 aa  72.4  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.302029 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3819  superoxide dismutase copper/zinc binding  34.44 
 
 
179 aa  72  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.130006  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01606  hypothetical protein  32.61 
 
 
173 aa  72.4  0.000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00112048  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3315  copper/zinc superoxide dismutase  39.84 
 
 
195 aa  72.4  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.151154  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1419  copper/zinc superoxide dismutase  38.71 
 
 
177 aa  72.4  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0294455 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1723  superoxide dismutase  32.61 
 
 
173 aa  72.4  0.000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.335611  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1857  superoxide dismutase  32.61 
 
 
173 aa  72.4  0.000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.195407  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3445  superoxide dismutase  39.84 
 
 
201 aa  72  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1983  superoxide dismutase  32.61 
 
 
178 aa  72  0.000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0141955  hitchhiker  0.00119703 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32550  copper/zinc superoxide dismutase-like protein  34.57 
 
 
189 aa  72  0.000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2872  superoxide dismutase copper/zinc binding  37.1 
 
 
169 aa  72  0.000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0217452 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0538  superoxide dismutase copper/zinc binding  39.84 
 
 
178 aa  72  0.000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0765812  n/a   
 
 
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NC_007434  BURPS1710b_1214  superoxide dismutase, Cu-Zn  38.19 
 
 
179 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009074  BURPS668_1056  copper/zinc superoxide dismutase  38.19 
 
 
179 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009076  BURPS1106A_1062  copper/zinc superoxide dismutase  38.19 
 
 
179 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.7887  n/a   
 
 
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NC_008599  CFF8240_1330  copper/zinc superoxide dismutase  37.39 
 
 
186 aa  71.2  0.000000000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.236149  n/a   
 
 
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NC_011080  SNSL254_A1550  superoxide dismutase  39.02 
 
 
173 aa  70.5  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
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