155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A1082 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011083  SeHA_C1154  copper/zinc superoxide dismutase  100 
 
 
177 aa  355  2.9999999999999997e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1419  copper/zinc superoxide dismutase  100 
 
 
177 aa  355  2.9999999999999997e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0294455 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1082  copper/zinc superoxide dismutase  100 
 
 
177 aa  355  2.9999999999999997e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.302029 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0978  copper/zinc superoxide dismutase  72.25 
 
 
189 aa  255  2e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3445  superoxide dismutase  78.57 
 
 
201 aa  253  7e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3315  copper/zinc superoxide dismutase  77.92 
 
 
195 aa  252  2.0000000000000002e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.151154  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2101  superoxide dismutase copper/zinc binding  69.32 
 
 
174 aa  249  1e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.651227  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2210  superoxide dismutase  62.8 
 
 
173 aa  214  5e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0109092  hitchhiker  0.000454174 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3163  superoxide dismutase (Cu-Zn)  61.14 
 
 
174 aa  213  8e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.315078  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1154  copper/Zinc superoxide dismutase  68.63 
 
 
172 aa  205  2e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.744174 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1338  superoxide dismutase, Cu-Zn  62.43 
 
 
172 aa  203  1e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1200  putative superoxide dismutase  58.76 
 
 
219 aa  203  1e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1734  superoxide dismutase  59.06 
 
 
173 aa  201  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0827551  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1903  superoxide dismutase  58.48 
 
 
173 aa  199  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.292339  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1550  superoxide dismutase  58.48 
 
 
173 aa  198  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1537  superoxide dismutase  58.48 
 
 
173 aa  198  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.19125  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0703  superoxide dismutase, Cu-Zn  62.2 
 
 
173 aa  196  1.0000000000000001e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1610  superoxide dismutase  57.89 
 
 
173 aa  196  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.815221 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0659  superoxide dismutase, Cu-Zn  62.2 
 
 
173 aa  196  1.0000000000000001e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1347  superoxide dismutase, copper/zinc binding  53.49 
 
 
183 aa  193  1e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2485  superoxide dismutase  53.53 
 
 
171 aa  191  4e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.841642  normal  0.166633 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0659  superoxide dismutase, Cu-Zn  60.53 
 
 
174 aa  189  2e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01616  superoxide dismutase, Cu, Zn  55.56 
 
 
173 aa  188  4e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00181178  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1994  Superoxide dismutase  55.56 
 
 
173 aa  188  4e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000374216  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2358  superoxide dismutase  55.56 
 
 
173 aa  188  4e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000359959  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1723  superoxide dismutase  55.56 
 
 
173 aa  188  4e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.335611  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1857  superoxide dismutase  55.56 
 
 
173 aa  188  4e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.195407  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01606  hypothetical protein  55.56 
 
 
173 aa  188  4e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00112048  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1983  superoxide dismutase  55.56 
 
 
178 aa  187  5e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0141955  hitchhiker  0.00119703 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1552  superoxide dismutase  55.56 
 
 
173 aa  187  5e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0496165  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1838  superoxide dismutase  54.97 
 
 
173 aa  186  1e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.159694  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3827  superoxide dismutase  55.88 
 
 
173 aa  185  3e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1801  superoxide dismutase  55.29 
 
 
172 aa  184  8e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0159903  normal  0.0303591 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2125  superoxide dismutase, copper/zinc binding  55.43 
 
 
170 aa  183  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0013475  normal  0.0132534 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2024  superoxide dismutase, copper/zinc binding  59.87 
 
 
170 aa  180  8.000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000023752  hitchhiker  0.00000198076 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1951  superoxide dismutase, copper/zinc binding protein  59.87 
 
 
170 aa  180  8.000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0285693  hitchhiker  0.00191784 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0397  superoxide dismutase, copper/zinc binding  57.89 
 
 
176 aa  179  1e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30470  CU-Zn Superoxide dismutase  50.59 
 
 
180 aa  178  4e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2022  superoxide dismutase (Cu-Zn)  53.41 
 
 
170 aa  175  2e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0122  superoxide dismutase (Cu/Zn)  57.05 
 
 
179 aa  173  9.999999999999999e-43  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.291157  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1186  superoxide dismutase, Cu-Zn  51.72 
 
 
171 aa  172  1.9999999999999998e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06578  hypothetical protein  52.27 
 
 
170 aa  172  1.9999999999999998e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001207  superoxide dismutase [Cu-Zn] precursor  52.05 
 
 
171 aa  171  3.9999999999999995e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2653  superoxide dismutase, copper/zinc binding  54.72 
 
 
182 aa  170  9e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.792961  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03307  superoxide dismutase, Cu-Zn  49.19 
 
 
181 aa  164  8e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00782096  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2297  superoxide dismutase, copper/zinc binding  48.9 
 
 
180 aa  163  1.0000000000000001e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.011982  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0788  copper/zinc superoxide dismutase  52.29 
 
 
178 aa  160  1e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0538  superoxide dismutase copper/zinc binding  51.45 
 
 
178 aa  157  6e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0765812  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3638  superoxide dismutase, copper/zinc binding  57.66 
 
 
173 aa  156  1e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1330  copper/zinc superoxide dismutase  51.3 
 
 
186 aa  155  3e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.236149  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0511  superoxide dismutase [Cu-Zn] precursor  44.97 
 
 
170 aa  154  6e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.59112  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0161  copper/zinc superoxide dismutase  46.41 
 
 
178 aa  153  1e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00000919214  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0982  putative superoxide dismutase  46.55 
 
 
175 aa  149  3e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  decreased coverage  0.000174344  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1507  superoxide dismutase precursor (Cu-Zn)  48.78 
 
 
178 aa  148  4e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.814898  normal  0.841266 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2270  superoxide dismutase [Cu-Zn] precursor  45.76 
 
 
162 aa  125  4.0000000000000003e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2297  superoxide dismutase [Cu-Zn] precursor  51.82 
 
 
162 aa  124  6e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2599  superoxide dismutase, copper/zinc binding  38.82 
 
 
239 aa  95.9  3e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00595972  normal  0.45771 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3067  Superoxide dismutase  36.46 
 
 
175 aa  84.3  9e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00079657 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4523  superoxide dismutase  33.12 
 
 
510 aa  81.6  0.000000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3011  superoxide dismutase copper/zinc binding protein  34.97 
 
 
174 aa  79.7  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2872  superoxide dismutase copper/zinc binding  33.7 
 
 
169 aa  80.1  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0217452 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2796  copper/Zinc superoxide dismutase  32.78 
 
 
169 aa  77  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.914684 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3135  superoxide dismutase, copper/zinc binding  32.24 
 
 
191 aa  76.3  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.310957  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3343  superoxide dismutase copper/zinc binding protein  35.63 
 
 
210 aa  76.3  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0409606 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2865  superoxide dismutase copper/zinc binding  33.15 
 
 
172 aa  75.5  0.0000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1782  copper/Zinc superoxide dismutase  38.82 
 
 
156 aa  75.1  0.0000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4059  superoxide dismutase copper/zinc binding  34.74 
 
 
214 aa  73.9  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.453641  normal  0.169503 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3554  superoxide dismutase  35.91 
 
 
171 aa  73.2  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642978  normal  0.247145 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0224  superoxide dismutase copper/zinc binding  34.64 
 
 
172 aa  73.2  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.504945  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2943  copper/Zinc superoxide dismutase  39.01 
 
 
172 aa  72.4  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.171551  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0906  superoxide dismutase, Cu/Zn  38.71 
 
 
192 aa  72.4  0.000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.381444  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1634  superoxide dismutase, copper/zinc binding  33.92 
 
 
165 aa  70.5  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.725775 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3597  superoxide dismutase, copper/zinc binding  34.21 
 
 
169 aa  69.7  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.592346  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3449  superoxide dismutase, copper/zinc binding  32.5 
 
 
180 aa  69.7  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  0.00000937306 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0122  superoxide dismutase copper/zinc binding  32.26 
 
 
179 aa  69.7  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.542638  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1796  putative copper/Zinc superoxide dismutase  35.57 
 
 
185 aa  67  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.749298  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0442  superoxide dismutase, copper/zinc binding  35.57 
 
 
185 aa  67.4  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.039325  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4681  Superoxide dismutase  33.33 
 
 
208 aa  67.4  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.179058 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0488  superoxide dismutase, copper/zinc binding  30.52 
 
 
172 aa  66.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1900  superoxide dismutase, copper/zinc binding  31.54 
 
 
185 aa  66.6  0.0000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.370601  normal  0.24871 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1980  superoxide dismutase, copper/zinc binding  31.33 
 
 
183 aa  66.2  0.0000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0783595 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1561  superoxide dismutase copper/zinc binding  29.61 
 
 
172 aa  66.6  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.639151  normal  0.731272 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2767  superoxide dismutase copper/zinc binding protein  33.33 
 
 
204 aa  65.9  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.238721 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1626  superoxide dismutase, copper/zinc binding  31.21 
 
 
177 aa  65.9  0.0000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4070  superoxide dismutase copper/zinc binding  36.6 
 
 
171 aa  65.9  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.273253  normal  0.944661 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08070  superoxide dismutase (Cu-Zn)  33.33 
 
 
158 aa  64.3  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000475437  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4338  copper/Zinc superoxide dismutase  32.45 
 
 
180 aa  63.9  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2345  superoxide dismutase  30.81 
 
 
178 aa  63.9  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0211561  normal  0.0730316 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1610  Superoxide dismutase  31.39 
 
 
184 aa  64.3  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0664  superoxide dismutase copper/zinc binding protein  35.57 
 
 
218 aa  63.5  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1880  superoxide dismutase copper/zinc binding  36.8 
 
 
175 aa  63.5  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2057  superoxide dismutase, copper/zinc binding  36.8 
 
 
175 aa  63.2  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0494601  normal  0.319354 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1699  superoxide dismutase copper/zinc binding  33.11 
 
 
176 aa  62  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000210654  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3942  superoxide dismutase copper/zinc binding  36.8 
 
 
212 aa  62.4  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379903  normal  0.128954 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0454  superoxide dismutase, copper/zinc binding  34.9 
 
 
190 aa  62  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.101401  normal  0.041937 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2380  superoxide dismutase copper/zinc binding protein  32.35 
 
 
220 aa  61.2  0.000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3220  superoxide dismutase, copper/zinc binding  30.56 
 
 
173 aa  60.8  0.000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4195  superoxide dismutase copper/zinc binding  34.4 
 
 
210 aa  60.1  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0124  superoxide dismutase copper/zinc binding  29.95 
 
 
189 aa  60.1  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0952022 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2581  superoxide dismutase copper/zinc binding  37.07 
 
 
183 aa  60.1  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.152888  normal  0.324375 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>