164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0125 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_0125  superoxide dismutase copper/zinc binding  100 
 
 
206 aa  410  1e-114  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.100957 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03561  superoxide dismutase  67.44 
 
 
203 aa  224  5.0000000000000005e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3942  superoxide dismutase copper/zinc binding  49.49 
 
 
212 aa  179  2.9999999999999997e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379903  normal  0.128954 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1880  superoxide dismutase copper/zinc binding  62.33 
 
 
175 aa  177  1e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2057  superoxide dismutase, copper/zinc binding  62.33 
 
 
175 aa  177  1e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0494601  normal  0.319354 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3554  superoxide dismutase  56.46 
 
 
171 aa  162  3e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642978  normal  0.247145 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4338  copper/Zinc superoxide dismutase  51.77 
 
 
180 aa  149  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0124  superoxide dismutase copper/zinc binding  50 
 
 
189 aa  147  1.0000000000000001e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0952022 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2368  superoxide dismutase Cu-Zn precursor protein  49.68 
 
 
182 aa  142  3e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0422357 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2943  copper/Zinc superoxide dismutase  46.5 
 
 
172 aa  140  9e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.171551  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1626  superoxide dismutase, copper/zinc binding  50.34 
 
 
177 aa  139  1.9999999999999998e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3711  superoxide dismutase copper/zinc binding  48.34 
 
 
180 aa  140  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2757  superoxide dismutase, copper/zinc binding  52.86 
 
 
191 aa  134  7.000000000000001e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00492325  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03563  superoxide dismutase  50 
 
 
200 aa  134  9e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3449  superoxide dismutase, copper/zinc binding  49.66 
 
 
180 aa  132  5e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  0.00000937306 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2177  superoxide dismutase copper/zinc binding  42.42 
 
 
183 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.462725  normal  0.0481765 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1610  Superoxide dismutase  47.62 
 
 
184 aa  128  5.0000000000000004e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2581  superoxide dismutase copper/zinc binding  46.11 
 
 
183 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.152888  normal  0.324375 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4761  superoxide dismutase, copper/zinc binding  44.3 
 
 
179 aa  120  9.999999999999999e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.271734  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4681  Superoxide dismutase  43.05 
 
 
208 aa  115  5e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.179058 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12203  Copper/Zinc superoxide dismutase  43.37 
 
 
194 aa  113  2.0000000000000002e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.348099  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0906  superoxide dismutase, Cu/Zn  41.61 
 
 
192 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.381444  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1980  superoxide dismutase, copper/zinc binding  41.78 
 
 
183 aa  110  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0783595 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3067  Superoxide dismutase  44.97 
 
 
175 aa  107  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00079657 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3597  superoxide dismutase, copper/zinc binding  43.05 
 
 
169 aa  104  8e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.592346  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2796  copper/Zinc superoxide dismutase  41.92 
 
 
169 aa  103  1e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.914684 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0224  superoxide dismutase copper/zinc binding  43.54 
 
 
172 aa  102  5e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.504945  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3135  superoxide dismutase, copper/zinc binding  39.31 
 
 
191 aa  102  6e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.310957  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1900  superoxide dismutase, copper/zinc binding  33.33 
 
 
185 aa  100  2e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.370601  normal  0.24871 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1634  superoxide dismutase, copper/zinc binding  43.12 
 
 
165 aa  99.4  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.725775 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0488  superoxide dismutase, copper/zinc binding  45.24 
 
 
172 aa  99  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1009  superoxide dismutase copper/zinc binding  40.54 
 
 
171 aa  98.6  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.814161 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2345  superoxide dismutase  39.88 
 
 
178 aa  98.2  7e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0211561  normal  0.0730316 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0442  superoxide dismutase, copper/zinc binding  39.76 
 
 
185 aa  98.2  8e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.039325  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4070  superoxide dismutase copper/zinc binding  40.67 
 
 
171 aa  97.4  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.273253  normal  0.944661 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1796  putative copper/Zinc superoxide dismutase  39.16 
 
 
185 aa  96.7  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.749298  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1161  superoxide dismutase copper/zinc binding  40.54 
 
 
171 aa  97.1  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.552065  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3220  superoxide dismutase, copper/zinc binding  36.71 
 
 
173 aa  96.3  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0454  superoxide dismutase, copper/zinc binding  37.97 
 
 
190 aa  95.5  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.101401  normal  0.041937 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3011  superoxide dismutase copper/zinc binding protein  36.18 
 
 
174 aa  94  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2865  superoxide dismutase copper/zinc binding  39.2 
 
 
172 aa  90.1  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2599  superoxide dismutase, copper/zinc binding  37.65 
 
 
239 aa  90.1  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00595972  normal  0.45771 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1018  superoxide dismutase copper/zinc binding  38.82 
 
 
177 aa  88.2  7e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0356333  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3479  putative copper/zinc superoxide dismutase  37.5 
 
 
177 aa  88.2  8e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2872  superoxide dismutase copper/zinc binding  45 
 
 
169 aa  87.4  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0217452 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1782  copper/Zinc superoxide dismutase  41.78 
 
 
156 aa  87  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3518  superoxide dismutase copper/zinc binding  43.07 
 
 
180 aa  85.5  6e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08070  superoxide dismutase (Cu-Zn)  36.91 
 
 
158 aa  84.7  8e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000475437  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4729  superoxide dismutase copper/zinc binding  41.94 
 
 
179 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4523  superoxide dismutase  35.64 
 
 
510 aa  82.8  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4777  superoxide dismutase, Cu-Zn  42.74 
 
 
179 aa  82  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4617  superoxide dismutase, Cu-Zn  42.74 
 
 
179 aa  82  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4639  superoxide dismutase, Cu-Zn  42.74 
 
 
179 aa  82  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5139  superoxide dismutase, Cu-Zn  42.74 
 
 
179 aa  82  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5051  superoxide dismutase, Cu-Zn  42.74 
 
 
179 aa  82  0.000000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3819  superoxide dismutase copper/zinc binding  39.85 
 
 
179 aa  81.6  0.000000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.130006  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0859  superoxide dismutase, Cu-Zn  37.5 
 
 
216 aa  81.6  0.000000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5018  superoxide dismutase, Cu-Zn  42.74 
 
 
165 aa  81.6  0.000000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0195  superoxide dismutase, Cu-Zn  41.94 
 
 
179 aa  81.6  0.000000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5046  superoxide dismutase, Cu-Zn  41.6 
 
 
179 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2188  superoxide dismutase copper/zinc binding  33.33 
 
 
206 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0161821  normal  0.256851 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1214  superoxide dismutase, Cu-Zn  36.18 
 
 
179 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4195  superoxide dismutase copper/zinc binding  33.15 
 
 
210 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1056  copper/zinc superoxide dismutase  36.18 
 
 
179 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1062  copper/zinc superoxide dismutase  36.18 
 
 
179 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.7887  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_28559  predicted protein  39.29 
 
 
197 aa  80.5  0.00000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000859292  hitchhiker  0.000000574282 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4679  superoxide dismutase copper/zinc binding  38.29 
 
 
201 aa  79  0.00000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.841473 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0860  superoxide dismutase copper/zinc binding  36.71 
 
 
178 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0340028  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4310  superoxide dismutase copper/zinc binding  38.29 
 
 
201 aa  79  0.00000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.366806  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0713  superoxide dismutase, Cu-Zn  35.53 
 
 
179 aa  78.2  0.00000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.159007  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5765  copper/Zinc superoxide dismutase  37.34 
 
 
178 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.212202  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2300  superoxide dismutase, Cu-Zn  35.53 
 
 
179 aa  78.2  0.00000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2986  superoxide dismutase, Cu-Zn  35.53 
 
 
179 aa  78.2  0.00000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.228777  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1613  superoxide dismutase, Cu-Zn  35.53 
 
 
179 aa  78.2  0.00000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0712489  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4059  superoxide dismutase copper/zinc binding  34.54 
 
 
214 aa  78.6  0.00000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.453641  normal  0.169503 
 
 
-
 
NC_006686  CND01490  copper zinc superoxide dismutase  41.27 
 
 
154 aa  78.2  0.00000000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.452302  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4827  superoxide dismutase copper/zinc binding  37.29 
 
 
201 aa  77.8  0.00000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.661461  normal  0.600787 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5039  superoxide dismutase, Cu-Zn  40.32 
 
 
179 aa  77.8  0.00000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.792086  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0852  superoxide dismutase, copper/zinc binding  41.91 
 
 
183 aa  77  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.260138 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2347  superoxide dismutase copper/zinc binding  37.34 
 
 
178 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.178903 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2481  superoxide dismutase, copper/zinc binding  37.34 
 
 
178 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3827  superoxide dismutase  34.52 
 
 
173 aa  75.5  0.0000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0702  superoxide dismutase copper/zinc binding  40.94 
 
 
172 aa  75.1  0.0000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.123655  normal  0.846065 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1507  superoxide dismutase precursor (Cu-Zn)  34.97 
 
 
178 aa  75.1  0.0000000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.814898  normal  0.841266 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2297  superoxide dismutase, copper/zinc binding  35.23 
 
 
180 aa  74.7  0.0000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.011982  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1823  superoxide dismutase, copper/zinc binding  36.71 
 
 
178 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0265669  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2439  superoxide dismutase copper/zinc binding  36.71 
 
 
178 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000305746  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2434  superoxide dismutase, copper/zinc binding  36.71 
 
 
178 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0971704  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00241  Superoxide dismutase [Cu-Zn] (EC 1.15.1.1) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q9HEY7]  36.91 
 
 
154 aa  73.6  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0817  superoxide dismutase, copper/zinc binding  41.23 
 
 
226 aa  73.9  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.509975  decreased coverage  0.0003056 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2833  superoxide dismutase copper/zinc binding  35.15 
 
 
177 aa  72.8  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0916793  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3638  superoxide dismutase, copper/zinc binding  31.71 
 
 
173 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0733  superoxide dismutase copper/zinc binding  33.55 
 
 
175 aa  72.4  0.000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000189816  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1561  superoxide dismutase copper/zinc binding  36.48 
 
 
172 aa  72  0.000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.639151  normal  0.731272 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2378  superoxide dismutase copper/zinc binding  36.2 
 
 
177 aa  72  0.000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0122  superoxide dismutase copper/zinc binding  36.07 
 
 
179 aa  72  0.000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.542638  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0703  superoxide dismutase, Cu-Zn  34.13 
 
 
173 aa  70.5  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0659  superoxide dismutase, Cu-Zn  34.13 
 
 
173 aa  70.5  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2022  superoxide dismutase (Cu-Zn)  32.45 
 
 
170 aa  70.5  0.00000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03307  superoxide dismutase, Cu-Zn  37.33 
 
 
181 aa  69.7  0.00000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00782096  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>