168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2297 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



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Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008228  Patl_2297  superoxide dismutase, copper/zinc binding  100 
 
 
180 aa  364  1e-100  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.011982  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03307  superoxide dismutase, Cu-Zn  78.77 
 
 
181 aa  296  2e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00782096  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001207  superoxide dismutase [Cu-Zn] precursor  55.56 
 
 
171 aa  194  6e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1186  superoxide dismutase, Cu-Zn  50 
 
 
171 aa  187  9e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30470  CU-Zn Superoxide dismutase  52.2 
 
 
180 aa  185  2e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06578  hypothetical protein  59.18 
 
 
170 aa  184  7e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0511  superoxide dismutase [Cu-Zn] precursor  52.25 
 
 
170 aa  180  8.000000000000001e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.59112  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3638  superoxide dismutase, copper/zinc binding  58.74 
 
 
173 aa  179  2e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0397  superoxide dismutase, copper/zinc binding  57.76 
 
 
176 aa  175  3e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0659  superoxide dismutase, Cu-Zn  52.66 
 
 
174 aa  174  7e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2125  superoxide dismutase, copper/zinc binding  52.25 
 
 
170 aa  173  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0013475  normal  0.0132534 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2024  superoxide dismutase, copper/zinc binding  58.9 
 
 
170 aa  171  5.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000023752  hitchhiker  0.00000198076 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1951  superoxide dismutase, copper/zinc binding protein  58.9 
 
 
170 aa  171  5.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0285693  hitchhiker  0.00191784 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2653  superoxide dismutase, copper/zinc binding  58.57 
 
 
182 aa  170  1e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.792961  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3163  superoxide dismutase (Cu-Zn)  48 
 
 
174 aa  164  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.315078  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1082  copper/zinc superoxide dismutase  48.9 
 
 
177 aa  163  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.302029 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1419  copper/zinc superoxide dismutase  48.9 
 
 
177 aa  163  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0294455 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1154  copper/zinc superoxide dismutase  48.9 
 
 
177 aa  163  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1347  superoxide dismutase, copper/zinc binding  53.57 
 
 
183 aa  161  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1903  superoxide dismutase  52.05 
 
 
173 aa  158  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.292339  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1537  superoxide dismutase  52.05 
 
 
173 aa  158  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.19125  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1550  superoxide dismutase  52.05 
 
 
173 aa  158  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1734  superoxide dismutase  51.74 
 
 
173 aa  158  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0827551  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3315  copper/zinc superoxide dismutase  45.64 
 
 
195 aa  158  4e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.151154  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0978  copper/zinc superoxide dismutase  46.56 
 
 
189 aa  157  8e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1338  superoxide dismutase, Cu-Zn  49.18 
 
 
172 aa  155  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3445  superoxide dismutase  55 
 
 
201 aa  155  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1610  superoxide dismutase  51.46 
 
 
173 aa  156  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.815221 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1200  putative superoxide dismutase  43.75 
 
 
219 aa  155  2e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2485  superoxide dismutase  46.07 
 
 
171 aa  155  3e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.841642  normal  0.166633 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01616  superoxide dismutase, Cu, Zn  48.35 
 
 
173 aa  155  4e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00181178  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1994  Superoxide dismutase  48.35 
 
 
173 aa  155  4e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000374216  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2358  superoxide dismutase  48.35 
 
 
173 aa  155  4e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000359959  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01606  hypothetical protein  48.35 
 
 
173 aa  155  4e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00112048  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0788  copper/zinc superoxide dismutase  46.49 
 
 
178 aa  155  4e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1723  superoxide dismutase  48.35 
 
 
173 aa  155  4e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.335611  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1857  superoxide dismutase  48.35 
 
 
173 aa  155  4e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.195407  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1983  superoxide dismutase  48.35 
 
 
178 aa  154  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0141955  hitchhiker  0.00119703 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1552  superoxide dismutase  47.8 
 
 
173 aa  154  6e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0496165  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1154  copper/Zinc superoxide dismutase  48.35 
 
 
172 aa  154  9e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.744174 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0122  superoxide dismutase (Cu/Zn)  59.2 
 
 
179 aa  154  9e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.291157  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1838  superoxide dismutase  47.8 
 
 
173 aa  153  1e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.159694  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0161  copper/zinc superoxide dismutase  54.68 
 
 
178 aa  153  1e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00000919214  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2210  superoxide dismutase  53.74 
 
 
173 aa  153  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0109092  hitchhiker  0.000454174 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1801  superoxide dismutase  49.16 
 
 
172 aa  152  2.9999999999999998e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0159903  normal  0.0303591 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3827  superoxide dismutase  49.72 
 
 
173 aa  152  2.9999999999999998e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2101  superoxide dismutase copper/zinc binding  51.43 
 
 
174 aa  150  8e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.651227  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2022  superoxide dismutase (Cu-Zn)  52.14 
 
 
170 aa  146  2.0000000000000003e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0538  superoxide dismutase copper/zinc binding  45.3 
 
 
178 aa  145  3e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0765812  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1507  superoxide dismutase precursor (Cu-Zn)  43.82 
 
 
178 aa  141  4e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.814898  normal  0.841266 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1330  copper/zinc superoxide dismutase  50.71 
 
 
186 aa  141  4e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.236149  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0982  putative superoxide dismutase  46.45 
 
 
175 aa  132  3.9999999999999996e-30  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  decreased coverage  0.000174344  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0703  superoxide dismutase, Cu-Zn  49.29 
 
 
173 aa  130  1.0000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0659  superoxide dismutase, Cu-Zn  49.29 
 
 
173 aa  130  1.0000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2270  superoxide dismutase [Cu-Zn] precursor  42.53 
 
 
162 aa  120  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2297  superoxide dismutase [Cu-Zn] precursor  50 
 
 
162 aa  119  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2796  copper/Zinc superoxide dismutase  35.47 
 
 
169 aa  86.3  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.914684 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2943  copper/Zinc superoxide dismutase  42.5 
 
 
172 aa  82.8  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.171551  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3449  superoxide dismutase, copper/zinc binding  33.55 
 
 
180 aa  82.8  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  0.00000937306 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2599  superoxide dismutase, copper/zinc binding  36.49 
 
 
239 aa  82.4  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00595972  normal  0.45771 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1782  copper/Zinc superoxide dismutase  36.73 
 
 
156 aa  82  0.000000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4523  superoxide dismutase  31.05 
 
 
510 aa  82  0.000000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4338  copper/Zinc superoxide dismutase  32.88 
 
 
180 aa  79.7  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12203  Copper/Zinc superoxide dismutase  38.89 
 
 
194 aa  79  0.00000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.348099  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2177  superoxide dismutase copper/zinc binding  32.11 
 
 
183 aa  79  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.462725  normal  0.0481765 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2368  superoxide dismutase Cu-Zn precursor protein  37.14 
 
 
182 aa  78.2  0.00000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0422357 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1626  superoxide dismutase, copper/zinc binding  37.59 
 
 
177 aa  78.6  0.00000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0906  superoxide dismutase, Cu/Zn  37.67 
 
 
192 aa  78.2  0.00000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.381444  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1610  Superoxide dismutase  35.53 
 
 
184 aa  78.2  0.00000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2581  superoxide dismutase copper/zinc binding  34.69 
 
 
183 aa  77.8  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.152888  normal  0.324375 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3597  superoxide dismutase, copper/zinc binding  36.57 
 
 
169 aa  76.3  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.592346  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03561  superoxide dismutase  39.1 
 
 
203 aa  76.6  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3011  superoxide dismutase copper/zinc binding protein  33.91 
 
 
174 aa  75.9  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1634  superoxide dismutase, copper/zinc binding  35.26 
 
 
165 aa  75.9  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.725775 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4681  Superoxide dismutase  39.58 
 
 
208 aa  74.7  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.179058 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2057  superoxide dismutase, copper/zinc binding  38.81 
 
 
175 aa  74.7  0.0000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0494601  normal  0.319354 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1880  superoxide dismutase copper/zinc binding  38.81 
 
 
175 aa  74.3  0.0000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2872  superoxide dismutase copper/zinc binding  34.46 
 
 
169 aa  73.6  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0217452 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2865  superoxide dismutase copper/zinc binding  35.15 
 
 
172 aa  73.9  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3343  superoxide dismutase copper/zinc binding protein  33.7 
 
 
210 aa  73.6  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0409606 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0122  superoxide dismutase copper/zinc binding  36.5 
 
 
179 aa  73.9  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.542638  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1980  superoxide dismutase, copper/zinc binding  32.26 
 
 
183 aa  73.2  0.000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0783595 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3067  Superoxide dismutase  36 
 
 
175 aa  72.4  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00079657 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0125  superoxide dismutase copper/zinc binding  40 
 
 
206 aa  72.8  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.100957 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4761  superoxide dismutase, copper/zinc binding  27.96 
 
 
179 aa  72  0.000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.271734  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3220  superoxide dismutase, copper/zinc binding  29.67 
 
 
173 aa  71.2  0.000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2757  superoxide dismutase, copper/zinc binding  38.66 
 
 
191 aa  70.9  0.000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00492325  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1900  superoxide dismutase, copper/zinc binding  36.36 
 
 
185 aa  70.9  0.00000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.370601  normal  0.24871 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1161  superoxide dismutase copper/zinc binding  35.66 
 
 
171 aa  70.5  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.552065  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3942  superoxide dismutase copper/zinc binding  33.76 
 
 
212 aa  70.5  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379903  normal  0.128954 
 
 
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NC_011071  Smal_0124  superoxide dismutase copper/zinc binding  36.92 
 
 
189 aa  69.3  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0952022 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3711  superoxide dismutase copper/zinc binding  36.76 
 
 
180 aa  69.7  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009049  Rsph17029_0442  superoxide dismutase, copper/zinc binding  38.46 
 
 
185 aa  69.7  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.039325  normal 
 
 
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NC_007948  Bpro_3554  superoxide dismutase  31.21 
 
 
171 aa  69.3  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642978  normal  0.247145 
 
 
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NC_007958  RPD_0488  superoxide dismutase, copper/zinc binding  32.08 
 
 
172 aa  68.9  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_007493  RSP_1796  putative copper/Zinc superoxide dismutase  37.69 
 
 
185 aa  68.6  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.749298  n/a   
 
 
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NC_009921  Franean1_4059  superoxide dismutase copper/zinc binding  32.29 
 
 
214 aa  68.6  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.453641  normal  0.169503 
 
 
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NC_011369  Rleg2_1009  superoxide dismutase copper/zinc binding  34.88 
 
 
171 aa  68.6  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.814161 
 
 
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NC_009674  Bcer98_3518  superoxide dismutase copper/zinc binding  29.93 
 
 
180 aa  68.2  0.00000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_010505  Mrad2831_3819  superoxide dismutase copper/zinc binding  37.24 
 
 
179 aa  67.8  0.00000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.130006  normal 
 
 
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