160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0659 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_0659  superoxide dismutase, Cu-Zn  100 
 
 		 174 aa  350  8e-96  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2125  superoxide dismutase, copper/zinc binding  67.46 
 
 		 170 aa  230  7.000000000000001e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0013475  normal  0.0132534 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2024  superoxide dismutase, copper/zinc binding  71.71 
 
 		 170 aa  226  9e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000023752  hitchhiker  0.00000198076 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1951  superoxide dismutase, copper/zinc binding protein  71.71 
 
 		 170 aa  226  9e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0285693  hitchhiker  0.00191784 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30470  CU-Zn Superoxide dismutase  60.23 
 
 		 180 aa  212  1.9999999999999998e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001207  superoxide dismutase [Cu-Zn] precursor  58.14 
 
 		 171 aa  207  9e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1154  copper/Zinc superoxide dismutase  66.46 
 
 		 172 aa  204  7e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.744174 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1347  superoxide dismutase, copper/zinc binding  66.23 
 
 		 183 aa  197  6e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0511  superoxide dismutase [Cu-Zn] precursor  55.88 
 
 		 170 aa  197  7.999999999999999e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.59112  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1200  putative superoxide dismutase  58.24 
 
 		 219 aa  197  9e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1186  superoxide dismutase, Cu-Zn  59.01 
 
 		 171 aa  195  3e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3163  superoxide dismutase (Cu-Zn)  56.07 
 
 		 174 aa  192  1e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.315078  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1338  superoxide dismutase, Cu-Zn  64.29 
 
 		 172 aa  192  2e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06578  hypothetical protein  57.99 
 
 		 170 aa  192  2e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2101  superoxide dismutase copper/zinc binding  58.14 
 
 		 174 aa  192  3e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.651227  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3638  superoxide dismutase, copper/zinc binding  58.6 
 
 		 173 aa  191  4e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2210  superoxide dismutase  63.06 
 
 		 173 aa  190  9e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0109092  hitchhiker  0.000454174 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0397  superoxide dismutase, copper/zinc binding  60 
 
 		 176 aa  189  1e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1082  copper/zinc superoxide dismutase  60.53 
 
 		 177 aa  189  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.302029 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1154  copper/zinc superoxide dismutase  60.53 
 
 		 177 aa  189  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1419  copper/zinc superoxide dismutase  60.53 
 
 		 177 aa  189  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0294455 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0978  copper/zinc superoxide dismutase  59.87 
 
 		 189 aa  189  2e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3315  copper/zinc superoxide dismutase  60 
 
 		 195 aa  188  4e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.151154  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3445  superoxide dismutase  60 
 
 		 201 aa  187  4e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2485  superoxide dismutase  56.47 
 
 		 171 aa  181  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.841642  normal  0.166633 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3827  superoxide dismutase  52.6 
 
 		 173 aa  177  4.999999999999999e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0703  superoxide dismutase, Cu-Zn  53.18 
 
 		 173 aa  174  4e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0659  superoxide dismutase, Cu-Zn  53.18 
 
 		 173 aa  174  4e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2297  superoxide dismutase, copper/zinc binding  52.66 
 
 		 180 aa  174  7e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.011982  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1610  superoxide dismutase  53.8 
 
 		 173 aa  172  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.815221 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01616  superoxide dismutase, Cu, Zn  53.22 
 
 		 173 aa  171  5e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00181178  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1994  Superoxide dismutase  53.22 
 
 		 173 aa  171  5e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000374216  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1903  superoxide dismutase  53.22 
 
 		 173 aa  171  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.292339  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01606  hypothetical protein  53.22 
 
 		 173 aa  171  5e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00112048  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2358  superoxide dismutase  53.22 
 
 		 173 aa  171  5e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000359959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1723  superoxide dismutase  53.22 
 
 		 173 aa  171  5e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.335611  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1857  superoxide dismutase  53.22 
 
 		 173 aa  171  5e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.195407  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1983  superoxide dismutase  53.22 
 
 		 178 aa  171  5e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0141955  hitchhiker  0.00119703 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1550  superoxide dismutase  53.22 
 
 		 173 aa  171  6.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1537  superoxide dismutase  53.22 
 
 		 173 aa  171  6.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.19125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1552  superoxide dismutase  53.22 
 
 		 173 aa  170  6.999999999999999e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0496165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1838  superoxide dismutase  52.63 
 
 		 173 aa  170  1e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.159694  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1734  superoxide dismutase  52.63 
 
 		 173 aa  169  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0827551  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03307  superoxide dismutase, Cu-Zn  52.63 
 
 		 181 aa  167  8e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00782096  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1801  superoxide dismutase  52.98 
 
 		 172 aa  166  1e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0159903  normal  0.0303591 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2022  superoxide dismutase (Cu-Zn)  49.15 
 
 		 170 aa  167  1e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1507  superoxide dismutase precursor (Cu-Zn)  51.81 
 
 		 178 aa  159  1e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.814898  normal  0.841266 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2653  superoxide dismutase, copper/zinc binding  55 
 
 		 182 aa  159  2e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.792961  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0538  superoxide dismutase copper/zinc binding  50.28 
 
 		 178 aa  157  5e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0765812  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0982  putative superoxide dismutase  49.7 
 
 		 175 aa  156  1e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  decreased coverage  0.000174344  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0122  superoxide dismutase (Cu/Zn)  50.99 
 
 		 179 aa  155  4e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.291157  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0788  copper/zinc superoxide dismutase  50.33 
 
 		 178 aa  150  8.999999999999999e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0161  copper/zinc superoxide dismutase  55.47 
 
 		 178 aa  149  2e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00000919214  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1330  copper/zinc superoxide dismutase  48.45 
 
 		 186 aa  144  9e-34  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.236149  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2297  superoxide dismutase [Cu-Zn] precursor  47.1 
 
 		 162 aa  131  3.9999999999999996e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2270  superoxide dismutase [Cu-Zn] precursor  46.38 
 
 		 162 aa  130  7.999999999999999e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3343  superoxide dismutase copper/zinc binding protein  39.41 
 
 		 210 aa  84.7  6e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0409606 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4338  copper/Zinc superoxide dismutase  34.78 
 
 		 180 aa  80.9  0.000000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2599  superoxide dismutase, copper/zinc binding  34.01 
 
 		 239 aa  79  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00595972  normal  0.45771 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0224  superoxide dismutase copper/zinc binding  34.01 
 
 		 172 aa  78.6  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.504945  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1634  superoxide dismutase, copper/zinc binding  30.34 
 
 		 165 aa  78.2  0.00000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.725775 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2872  superoxide dismutase copper/zinc binding  36.05 
 
 		 169 aa  78.2  0.00000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0217452 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3067  Superoxide dismutase  35.52 
 
 		 175 aa  77.4  0.00000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00079657 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2865  superoxide dismutase copper/zinc binding  32.18 
 
 		 172 aa  77  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0906  superoxide dismutase, Cu/Zn  37.25 
 
 		 192 aa  75.9  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.381444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2796  copper/Zinc superoxide dismutase  32.43 
 
 		 169 aa  76.3  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.914684 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0442  superoxide dismutase, copper/zinc binding  37.35 
 
 		 185 aa  76.3  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.039325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4059  superoxide dismutase copper/zinc binding  35.12 
 
 		 214 aa  76.3  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.453641  normal  0.169503 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1796  putative copper/Zinc superoxide dismutase  36.75 
 
 		 185 aa  75.1  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.749298  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4681  Superoxide dismutase  33.12 
 
 		 208 aa  73.6  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.179058 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3597  superoxide dismutase, copper/zinc binding  33.78 
 
 		 169 aa  73.9  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.592346  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2581  superoxide dismutase copper/zinc binding  35.06 
 
 		 183 aa  73.6  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.152888  normal  0.324375 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3011  superoxide dismutase copper/zinc binding protein  32.7 
 
 		 174 aa  73.9  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1782  copper/Zinc superoxide dismutase  35.1 
 
 		 156 aa  72.8  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3135  superoxide dismutase, copper/zinc binding  38.41 
 
 		 191 aa  72.8  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.310957  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2057  superoxide dismutase, copper/zinc binding  35.66 
 
 		 175 aa  72.8  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0494601  normal  0.319354 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4761  superoxide dismutase, copper/zinc binding  34.51 
 
 		 179 aa  72.8  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.271734  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1880  superoxide dismutase copper/zinc binding  35.66 
 
 		 175 aa  72.8  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2177  superoxide dismutase copper/zinc binding  35.06 
 
 		 183 aa  72.4  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.462725  normal  0.0481765 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3449  superoxide dismutase, copper/zinc binding  36.5 
 
 		 180 aa  71.6  0.000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000937306 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2943  copper/Zinc superoxide dismutase  35.29 
 
 		 172 aa  71.2  0.000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.171551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3554  superoxide dismutase  31.87 
 
 		 171 aa  69.3  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642978  normal  0.247145 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3220  superoxide dismutase, copper/zinc binding  32.79 
 
 		 173 aa  69.3  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4523  superoxide dismutase  32.53 
 
 		 510 aa  70.1  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0124  superoxide dismutase copper/zinc binding  36.73 
 
 		 189 aa  70.1  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0952022 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1980  superoxide dismutase, copper/zinc binding  34.01 
 
 		 183 aa  69.7  0.00000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0783595 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0454  superoxide dismutase, copper/zinc binding  33.73 
 
 		 190 aa  69.3  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.101401  normal  0.041937 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2368  superoxide dismutase Cu-Zn precursor protein  39.84 
 
 		 182 aa  67.4  0.00000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0422357 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12203  Copper/Zinc superoxide dismutase  30.07 
 
 		 194 aa  67  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.348099  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1699  superoxide dismutase copper/zinc binding  35.14 
 
 		 176 aa  66.6  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000210654  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03561  superoxide dismutase  34.93 
 
 		 203 aa  66.2  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1626  superoxide dismutase, copper/zinc binding  33.33 
 
 		 177 aa  66.6  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0488  superoxide dismutase, copper/zinc binding  31.76 
 
 		 172 aa  65.5  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4679  superoxide dismutase copper/zinc binding  33.99 
 
 		 201 aa  65.9  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.841473 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4310  superoxide dismutase copper/zinc binding  33.99 
 
 		 201 aa  65.9  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.366806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2757  superoxide dismutase, copper/zinc binding  34.75 
 
 		 191 aa  65.5  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00492325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4070  superoxide dismutase copper/zinc binding  35.1 
 
 		 171 aa  65.1  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.273253  normal  0.944661 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0125  superoxide dismutase copper/zinc binding  36.88 
 
 		 206 aa  64.3  0.0000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.100957 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3942  superoxide dismutase copper/zinc binding  33.54 
 
 		 212 aa  63.9  0.0000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379903  normal  0.128954 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1610  Superoxide dismutase  35.04 
 
 		 184 aa  63.5  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>