162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1338 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1338  superoxide dismutase, Cu-Zn  100 
 
 		 172 aa  338  2e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1154  copper/Zinc superoxide dismutase  90.7 
 
 		 172 aa  306  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.744174 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2210  superoxide dismutase  75.8 
 
 		 173 aa  239  1e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0109092  hitchhiker  0.000454174 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3163  superoxide dismutase (Cu-Zn)  64.16 
 
 		 174 aa  216  1e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.315078  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1200  putative superoxide dismutase  68.39 
 
 		 219 aa  213  9.999999999999999e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2101  superoxide dismutase copper/zinc binding  64.74 
 
 		 174 aa  211  4.9999999999999996e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.651227  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30470  CU-Zn Superoxide dismutase  59.3 
 
 		 180 aa  205  3e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1154  copper/zinc superoxide dismutase  62.43 
 
 		 177 aa  203  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1082  copper/zinc superoxide dismutase  62.43 
 
 		 177 aa  203  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.302029 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1419  copper/zinc superoxide dismutase  62.43 
 
 		 177 aa  203  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0294455 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3315  copper/zinc superoxide dismutase  68.83 
 
 		 195 aa  202  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.151154  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0978  copper/zinc superoxide dismutase  68.83 
 
 		 189 aa  202  2e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3445  superoxide dismutase  68.83 
 
 		 201 aa  202  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1903  superoxide dismutase  63.23 
 
 		 173 aa  194  7e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.292339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1537  superoxide dismutase  63.23 
 
 		 173 aa  192  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.19125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1550  superoxide dismutase  63.23 
 
 		 173 aa  192  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01616  superoxide dismutase, Cu, Zn  58.72 
 
 		 173 aa  192  2e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00181178  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1994  Superoxide dismutase  58.72 
 
 		 173 aa  192  2e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000374216  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0659  superoxide dismutase, Cu-Zn  64.29 
 
 		 174 aa  192  2e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01606  hypothetical protein  58.72 
 
 		 173 aa  192  2e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00112048  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2358  superoxide dismutase  58.72 
 
 		 173 aa  192  2e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000359959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1723  superoxide dismutase  58.72 
 
 		 173 aa  192  2e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.335611  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1857  superoxide dismutase  58.72 
 
 		 173 aa  192  2e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.195407  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1983  superoxide dismutase  58.05 
 
 		 178 aa  192  3e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0141955  hitchhiker  0.00119703 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1552  superoxide dismutase  58.14 
 
 		 173 aa  191  3e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0496165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1610  superoxide dismutase  62.58 
 
 		 173 aa  191  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.815221 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1734  superoxide dismutase  62.58 
 
 		 173 aa  191  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0827551  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1838  superoxide dismutase  58.14 
 
 		 173 aa  191  5e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.159694  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2125  superoxide dismutase, copper/zinc binding  57.93 
 
 		 170 aa  191  6e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0013475  normal  0.0132534 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1186  superoxide dismutase, Cu-Zn  56.07 
 
 		 171 aa  185  2e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2024  superoxide dismutase, copper/zinc binding  60.26 
 
 		 170 aa  185  3e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000023752  hitchhiker  0.00000198076 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1951  superoxide dismutase, copper/zinc binding protein  60.26 
 
 		 170 aa  185  3e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0285693  hitchhiker  0.00191784 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3827  superoxide dismutase  56.9 
 
 		 173 aa  182  2.0000000000000003e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1801  superoxide dismutase  58.08 
 
 		 172 aa  182  3e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0159903  normal  0.0303591 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1347  superoxide dismutase, copper/zinc binding  53.71 
 
 		 183 aa  176  2e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2485  superoxide dismutase  53.76 
 
 		 171 aa  174  5e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.841642  normal  0.166633 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0397  superoxide dismutase, copper/zinc binding  57.69 
 
 		 176 aa  173  9.999999999999999e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0511  superoxide dismutase [Cu-Zn] precursor  51.45 
 
 		 170 aa  167  9e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.59112  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06578  hypothetical protein  59.42 
 
 		 170 aa  166  2e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03307  superoxide dismutase, Cu-Zn  49.73 
 
 		 181 aa  164  5.9999999999999996e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00782096  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001207  superoxide dismutase [Cu-Zn] precursor  57.14 
 
 		 171 aa  164  6.9999999999999995e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0161  copper/zinc superoxide dismutase  55.26 
 
 		 178 aa  160  5.0000000000000005e-39  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00000919214  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0703  superoxide dismutase, Cu-Zn  50.58 
 
 		 173 aa  157  5e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0659  superoxide dismutase, Cu-Zn  50.58 
 
 		 173 aa  157  5e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1507  superoxide dismutase precursor (Cu-Zn)  51.48 
 
 		 178 aa  157  7e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.814898  normal  0.841266 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2022  superoxide dismutase (Cu-Zn)  52.05 
 
 		 170 aa  157  7e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2297  superoxide dismutase, copper/zinc binding  49.18 
 
 		 180 aa  155  2e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.011982  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3638  superoxide dismutase, copper/zinc binding  52.9 
 
 		 173 aa  156  2e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0788  copper/zinc superoxide dismutase  52.63 
 
 		 178 aa  150  8.999999999999999e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0982  putative superoxide dismutase  47.16 
 
 		 175 aa  149  1e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  decreased coverage  0.000174344  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2653  superoxide dismutase, copper/zinc binding  48.75 
 
 		 182 aa  148  4e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.792961  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0122  superoxide dismutase (Cu/Zn)  49.39 
 
 		 179 aa  147  6e-35  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.291157  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1330  copper/zinc superoxide dismutase  52.32 
 
 		 186 aa  145  3e-34  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.236149  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2270  superoxide dismutase [Cu-Zn] precursor  48.17 
 
 		 162 aa  145  4.0000000000000006e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0538  superoxide dismutase copper/zinc binding  50 
 
 		 178 aa  144  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0765812  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2297  superoxide dismutase [Cu-Zn] precursor  48.17 
 
 		 162 aa  143  1e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0442  superoxide dismutase, copper/zinc binding  40.4 
 
 		 185 aa  87.4  9e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.039325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1796  putative copper/Zinc superoxide dismutase  39.74 
 
 		 185 aa  86.3  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.749298  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1634  superoxide dismutase, copper/zinc binding  37.08 
 
 		 165 aa  86.3  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.725775 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2599  superoxide dismutase, copper/zinc binding  37.66 
 
 		 239 aa  83.6  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00595972  normal  0.45771 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3067  Superoxide dismutase  40.27 
 
 		 175 aa  83.6  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00079657 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3343  superoxide dismutase copper/zinc binding protein  38.1 
 
 		 210 aa  82.8  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0409606 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0454  superoxide dismutase, copper/zinc binding  36.88 
 
 		 190 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.101401  normal  0.041937 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1009  superoxide dismutase copper/zinc binding  39.07 
 
 		 171 aa  79  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.814161 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1161  superoxide dismutase copper/zinc binding  37.75 
 
 		 171 aa  75.9  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.552065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4681  Superoxide dismutase  35.57 
 
 		 208 aa  73.2  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.179058 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2380  superoxide dismutase copper/zinc binding protein  34.76 
 
 		 220 aa  72.8  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3011  superoxide dismutase copper/zinc binding protein  33.12 
 
 		 174 aa  73.2  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0122  superoxide dismutase copper/zinc binding  33.95 
 
 		 179 aa  72  0.000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.542638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3449  superoxide dismutase, copper/zinc binding  34.59 
 
 		 180 aa  71.2  0.000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000937306 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2581  superoxide dismutase copper/zinc binding  36.67 
 
 		 183 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.152888  normal  0.324375 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4338  copper/Zinc superoxide dismutase  34.06 
 
 		 180 aa  70.1  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2796  copper/Zinc superoxide dismutase  32.22 
 
 		 169 aa  69.7  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.914684 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2177  superoxide dismutase copper/zinc binding  38 
 
 		 183 aa  69.7  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.462725  normal  0.0481765 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0224  superoxide dismutase copper/zinc binding  38.89 
 
 		 172 aa  69.3  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.504945  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2865  superoxide dismutase copper/zinc binding  31.21 
 
 		 172 aa  68.6  0.00000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4059  superoxide dismutase copper/zinc binding  34.48 
 
 		 214 aa  67.8  0.00000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.453641  normal  0.169503 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3728  superoxide dismutase copper/zinc binding protein  34.29 
 
 		 244 aa  67  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2943  copper/Zinc superoxide dismutase  38.3 
 
 		 172 aa  67.4  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.171551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4523  superoxide dismutase  33.99 
 
 		 510 aa  67  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2057  superoxide dismutase, copper/zinc binding  34.04 
 
 		 175 aa  67  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0494601  normal  0.319354 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1880  superoxide dismutase copper/zinc binding  34.04 
 
 		 175 aa  66.6  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03561  superoxide dismutase  38.57 
 
 		 203 aa  66.6  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3135  superoxide dismutase, copper/zinc binding  34.01 
 
 		 191 aa  65.9  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.310957  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3554  superoxide dismutase  34.44 
 
 		 171 aa  65.9  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642978  normal  0.247145 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1610  Superoxide dismutase  34.53 
 
 		 184 aa  65.1  0.0000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1699  superoxide dismutase copper/zinc binding  36.49 
 
 		 176 aa  64.7  0.0000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000210654  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0906  superoxide dismutase, Cu/Zn  36.89 
 
 		 192 aa  64.3  0.0000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.381444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2872  superoxide dismutase copper/zinc binding  32.69 
 
 		 169 aa  64.3  0.0000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0217452 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3597  superoxide dismutase, copper/zinc binding  37.06 
 
 		 169 aa  63.9  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.592346  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1900  superoxide dismutase, copper/zinc binding  31.33 
 
 		 185 aa  63.2  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.370601  normal  0.24871 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3220  superoxide dismutase, copper/zinc binding  31.82 
 
 		 173 aa  62.8  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0733  superoxide dismutase copper/zinc binding  32.21 
 
 		 175 aa  63.2  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000189816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0124  superoxide dismutase copper/zinc binding  36.36 
 
 		 189 aa  62.4  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0952022 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1980  superoxide dismutase, copper/zinc binding  32.68 
 
 		 183 aa  62.4  0.000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0783595 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0488  superoxide dismutase, copper/zinc binding  34.84 
 
 		 172 aa  61.6  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3942  superoxide dismutase copper/zinc binding  36.69 
 
 		 212 aa  61.2  0.000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379903  normal  0.128954 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2368  superoxide dismutase Cu-Zn precursor protein  38.98 
 
 		 182 aa  60.8  0.000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0422357 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1626  superoxide dismutase, copper/zinc binding  32.18 
 
 		 177 aa  60.8  0.000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1782  copper/Zinc superoxide dismutase  30.87 
 
 		 156 aa  59.3  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>