145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0122 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



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Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_0122  superoxide dismutase copper/zinc binding  100 
 
 
179 aa  361  2e-99  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.542638  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2872  superoxide dismutase copper/zinc binding  53.1 
 
 
169 aa  162  3e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0217452 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3819  superoxide dismutase copper/zinc binding  56 
 
 
179 aa  160  1e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.130006  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1561  superoxide dismutase copper/zinc binding  50.89 
 
 
172 aa  156  2e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.639151  normal  0.731272 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4679  superoxide dismutase copper/zinc binding  57.04 
 
 
201 aa  153  1e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.841473 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4310  superoxide dismutase copper/zinc binding  57.04 
 
 
201 aa  153  1e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.366806  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4827  superoxide dismutase copper/zinc binding  55.63 
 
 
201 aa  144  6e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.661461  normal  0.600787 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1699  superoxide dismutase copper/zinc binding  50.99 
 
 
176 aa  140  9.999999999999999e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000210654  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2378  superoxide dismutase copper/zinc binding  45.2 
 
 
177 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2865  superoxide dismutase copper/zinc binding  45.09 
 
 
172 aa  131  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3220  superoxide dismutase, copper/zinc binding  41.48 
 
 
173 aa  130  1.0000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2833  superoxide dismutase copper/zinc binding  45.51 
 
 
177 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0916793  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2922  superoxide dismutase copper/zinc binding  49.02 
 
 
183 aa  126  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.719659  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2345  superoxide dismutase  41.9 
 
 
178 aa  122  2e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0211561  normal  0.0730316 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3011  superoxide dismutase copper/zinc binding protein  46.76 
 
 
174 aa  123  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3518  superoxide dismutase copper/zinc binding  40.71 
 
 
180 aa  122  3e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1796  putative copper/Zinc superoxide dismutase  44.44 
 
 
185 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.749298  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0442  superoxide dismutase, copper/zinc binding  44.44 
 
 
185 aa  118  6e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.039325  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5046  superoxide dismutase, Cu-Zn  42.36 
 
 
179 aa  117  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0195  superoxide dismutase, Cu-Zn  41.67 
 
 
179 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4729  superoxide dismutase copper/zinc binding  41.67 
 
 
179 aa  114  5e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5039  superoxide dismutase, Cu-Zn  40.97 
 
 
179 aa  114  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.792086  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3067  Superoxide dismutase  43.42 
 
 
175 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00079657 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4777  superoxide dismutase, Cu-Zn  40.28 
 
 
179 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4617  superoxide dismutase, Cu-Zn  40.28 
 
 
179 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4639  superoxide dismutase, Cu-Zn  40.28 
 
 
179 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5139  superoxide dismutase, Cu-Zn  40.28 
 
 
179 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5018  superoxide dismutase, Cu-Zn  40.28 
 
 
165 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5051  superoxide dismutase, Cu-Zn  40.28 
 
 
179 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4070  superoxide dismutase copper/zinc binding  42.57 
 
 
171 aa  112  3e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.273253  normal  0.944661 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0488  superoxide dismutase, copper/zinc binding  38.99 
 
 
172 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0454  superoxide dismutase, copper/zinc binding  42.67 
 
 
190 aa  107  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.101401  normal  0.041937 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1634  superoxide dismutase, copper/zinc binding  40.36 
 
 
165 aa  105  4e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.725775 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2796  copper/Zinc superoxide dismutase  37.5 
 
 
169 aa  104  5e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.914684 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3597  superoxide dismutase, copper/zinc binding  39.6 
 
 
169 aa  104  5e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.592346  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0224  superoxide dismutase copper/zinc binding  39.6 
 
 
172 aa  104  7e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.504945  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3135  superoxide dismutase, copper/zinc binding  38 
 
 
191 aa  100  8e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.310957  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0702  superoxide dismutase copper/zinc binding  43.97 
 
 
172 aa  99.8  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.123655  normal  0.846065 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1161  superoxide dismutase copper/zinc binding  38.22 
 
 
171 aa  97.1  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.552065  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2599  superoxide dismutase, copper/zinc binding  36.02 
 
 
239 aa  95.1  5e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00595972  normal  0.45771 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1009  superoxide dismutase copper/zinc binding  38.61 
 
 
171 aa  94.7  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.814161 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4681  Superoxide dismutase  42.14 
 
 
208 aa  94.4  8e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.179058 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0817  superoxide dismutase, copper/zinc binding  37.04 
 
 
226 aa  88.6  4e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.509975  decreased coverage  0.0003056 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1782  copper/Zinc superoxide dismutase  40.48 
 
 
156 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2943  copper/Zinc superoxide dismutase  34.29 
 
 
172 aa  79  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.171551  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0852  superoxide dismutase, copper/zinc binding  43.38 
 
 
183 aa  79.3  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.260138 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1610  Superoxide dismutase  37.04 
 
 
184 aa  78.6  0.00000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2653  superoxide dismutase, copper/zinc binding  35.37 
 
 
182 aa  77.8  0.00000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.792961  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2380  superoxide dismutase copper/zinc binding protein  33.13 
 
 
220 aa  77  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03307  superoxide dismutase, Cu-Zn  34.57 
 
 
181 aa  75.5  0.0000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00782096  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2767  superoxide dismutase copper/zinc binding protein  32.42 
 
 
204 aa  75.1  0.0000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.238721 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0703  superoxide dismutase, Cu-Zn  31.11 
 
 
173 aa  74.7  0.0000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_004578  PSPTO_1338  superoxide dismutase, Cu-Zn  34.62 
 
 
172 aa  74.7  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0659  superoxide dismutase, Cu-Zn  31.11 
 
 
173 aa  74.7  0.0000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30470  CU-Zn Superoxide dismutase  33.71 
 
 
180 aa  74.3  0.0000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_7975  Cu/Zn superoxide dismutase-like protein  29.31 
 
 
226 aa  74.3  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102706  normal  0.114926 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2022  superoxide dismutase (Cu-Zn)  29.71 
 
 
170 aa  74.3  0.0000000000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2270  superoxide dismutase [Cu-Zn] precursor  32.69 
 
 
162 aa  73.9  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_008228  Patl_2297  superoxide dismutase, copper/zinc binding  36.5 
 
 
180 aa  73.9  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.011982  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1801  superoxide dismutase  33.33 
 
 
172 aa  73.9  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0159903  normal  0.0303591 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2297  superoxide dismutase [Cu-Zn] precursor  32.22 
 
 
162 aa  73.6  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3554  superoxide dismutase  31.43 
 
 
171 aa  72.4  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642978  normal  0.247145 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1347  superoxide dismutase, copper/zinc binding  30.51 
 
 
183 aa  72.4  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1980  superoxide dismutase, copper/zinc binding  36.15 
 
 
183 aa  72.8  0.000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0783595 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1880  superoxide dismutase copper/zinc binding  35.22 
 
 
175 aa  72.4  0.000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1154  copper/Zinc superoxide dismutase  33.7 
 
 
172 aa  72.4  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.744174 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2057  superoxide dismutase, copper/zinc binding  35.26 
 
 
175 aa  72  0.000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0494601  normal  0.319354 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3638  superoxide dismutase, copper/zinc binding  30.36 
 
 
173 aa  71.2  0.000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0125  superoxide dismutase copper/zinc binding  36.36 
 
 
206 aa  71.6  0.000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.100957 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4338  copper/Zinc superoxide dismutase  30.99 
 
 
180 aa  71.2  0.000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1900  superoxide dismutase, copper/zinc binding  30.86 
 
 
185 aa  70.5  0.00000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.370601  normal  0.24871 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3449  superoxide dismutase, copper/zinc binding  33.33 
 
 
180 aa  70.5  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  0.00000937306 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4523  superoxide dismutase  30.95 
 
 
510 aa  70.5  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12203  Copper/Zinc superoxide dismutase  33.33 
 
 
194 aa  70.1  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.348099  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1082  copper/zinc superoxide dismutase  32.26 
 
 
177 aa  69.7  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.302029 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2125  superoxide dismutase, copper/zinc binding  33.78 
 
 
170 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0013475  normal  0.0132534 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1154  copper/zinc superoxide dismutase  32.26 
 
 
177 aa  69.7  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1419  copper/zinc superoxide dismutase  32.26 
 
 
177 aa  69.7  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0294455 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2024  superoxide dismutase, copper/zinc binding  33.78 
 
 
170 aa  68.9  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000023752  hitchhiker  0.00000198076 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1951  superoxide dismutase, copper/zinc binding protein  33.78 
 
 
170 aa  68.9  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0285693  hitchhiker  0.00191784 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001207  superoxide dismutase [Cu-Zn] precursor  30.56 
 
 
171 aa  68.9  0.00000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1838  superoxide dismutase  30.43 
 
 
173 aa  68.9  0.00000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.159694  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01616  superoxide dismutase, Cu, Zn  30.43 
 
 
173 aa  68.6  0.00000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00181178  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1994  Superoxide dismutase  30.43 
 
 
173 aa  68.6  0.00000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000374216  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2358  superoxide dismutase  30.43 
 
 
173 aa  68.6  0.00000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000359959  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1186  superoxide dismutase, Cu-Zn  30.98 
 
 
171 aa  68.6  0.00000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01606  hypothetical protein  30.43 
 
 
173 aa  68.6  0.00000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00112048  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1723  superoxide dismutase  30.43 
 
 
173 aa  68.6  0.00000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.335611  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1857  superoxide dismutase  30.43 
 
 
173 aa  68.6  0.00000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.195407  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1983  superoxide dismutase  30.43 
 
 
178 aa  68.2  0.00000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0141955  hitchhiker  0.00119703 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1552  superoxide dismutase  30.43 
 
 
173 aa  68.6  0.00000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0496165  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4195  superoxide dismutase copper/zinc binding  32.26 
 
 
210 aa  68.2  0.00000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2485  superoxide dismutase  31.51 
 
 
171 aa  67.8  0.00000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.841642  normal  0.166633 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06578  hypothetical protein  31.18 
 
 
170 aa  67  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2368  superoxide dismutase Cu-Zn precursor protein  34.39 
 
 
182 aa  66.6  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0422357 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3343  superoxide dismutase copper/zinc binding protein  31.93 
 
 
210 aa  66.2  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0409606 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2210  superoxide dismutase  32.43 
 
 
173 aa  66.2  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0109092  hitchhiker  0.000454174 
 
 
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NC_013441  Gbro_0664  superoxide dismutase copper/zinc binding protein  32.89 
 
 
218 aa  65.9  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009441  Fjoh_4761  superoxide dismutase, copper/zinc binding  32.12 
 
 
179 aa  65.9  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.271734  n/a   
 
 
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NC_012791  Vapar_3711  superoxide dismutase copper/zinc binding  34.78 
 
 
180 aa  65.1  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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