168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0852 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



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Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_0852  superoxide dismutase, copper/zinc binding  100 
 
 
183 aa  357  6e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.260138 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3067  Superoxide dismutase  52.08 
 
 
175 aa  155  2e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00079657 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0817  superoxide dismutase, copper/zinc binding  53.38 
 
 
226 aa  145  2.0000000000000003e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.509975  decreased coverage  0.0003056 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3135  superoxide dismutase, copper/zinc binding  52.35 
 
 
191 aa  138  3.9999999999999997e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.310957  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2345  superoxide dismutase  41.38 
 
 
178 aa  137  7e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0211561  normal  0.0730316 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4070  superoxide dismutase copper/zinc binding  48.95 
 
 
171 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.273253  normal  0.944661 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4681  Superoxide dismutase  46.58 
 
 
208 aa  127  6e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.179058 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0488  superoxide dismutase, copper/zinc binding  46.58 
 
 
172 aa  127  8.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3597  superoxide dismutase, copper/zinc binding  50.68 
 
 
169 aa  125  5e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.592346  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2796  copper/Zinc superoxide dismutase  46.05 
 
 
169 aa  124  6e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.914684 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3011  superoxide dismutase copper/zinc binding protein  42 
 
 
174 aa  124  9e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0224  superoxide dismutase copper/zinc binding  47.18 
 
 
172 aa  122  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.504945  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2865  superoxide dismutase copper/zinc binding  42.36 
 
 
172 aa  120  8e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1699  superoxide dismutase copper/zinc binding  45.7 
 
 
176 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000210654  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3220  superoxide dismutase, copper/zinc binding  40 
 
 
173 aa  114  8.999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4729  superoxide dismutase copper/zinc binding  41.55 
 
 
179 aa  112  3e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2599  superoxide dismutase, copper/zinc binding  41.77 
 
 
239 aa  112  4.0000000000000004e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00595972  normal  0.45771 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3518  superoxide dismutase copper/zinc binding  41.96 
 
 
180 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5046  superoxide dismutase, Cu-Zn  40.85 
 
 
179 aa  108  5e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4777  superoxide dismutase, Cu-Zn  41.55 
 
 
179 aa  108  6e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4617  superoxide dismutase, Cu-Zn  41.55 
 
 
179 aa  108  6e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4639  superoxide dismutase, Cu-Zn  41.55 
 
 
179 aa  108  6e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5139  superoxide dismutase, Cu-Zn  41.55 
 
 
179 aa  108  6e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5051  superoxide dismutase, Cu-Zn  41.55 
 
 
179 aa  108  6e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5018  superoxide dismutase, Cu-Zn  40.85 
 
 
165 aa  107  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2872  superoxide dismutase copper/zinc binding  42.76 
 
 
169 aa  107  9.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0217452 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0195  superoxide dismutase, Cu-Zn  40.85 
 
 
179 aa  106  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5039  superoxide dismutase, Cu-Zn  40.14 
 
 
179 aa  105  3e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.792086  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2943  copper/Zinc superoxide dismutase  38.33 
 
 
172 aa  105  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.171551  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0122  superoxide dismutase copper/zinc binding  43.38 
 
 
179 aa  104  8e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.542638  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4338  copper/Zinc superoxide dismutase  46.38 
 
 
180 aa  104  9e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1610  Superoxide dismutase  41.79 
 
 
184 aa  103  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1782  copper/Zinc superoxide dismutase  42.28 
 
 
156 aa  102  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1634  superoxide dismutase, copper/zinc binding  43.71 
 
 
165 aa  102  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.725775 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2368  superoxide dismutase Cu-Zn precursor protein  45.8 
 
 
182 aa  102  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0422357 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2177  superoxide dismutase copper/zinc binding  44.62 
 
 
183 aa  102  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.462725  normal  0.0481765 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1626  superoxide dismutase, copper/zinc binding  41.91 
 
 
177 aa  101  7e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2581  superoxide dismutase copper/zinc binding  43.85 
 
 
183 aa  99.8  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.152888  normal  0.324375 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03561  superoxide dismutase  42.65 
 
 
203 aa  97.1  1e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1009  superoxide dismutase copper/zinc binding  41.18 
 
 
171 aa  96.3  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.814161 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2833  superoxide dismutase copper/zinc binding  39.04 
 
 
177 aa  96.7  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0916793  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0125  superoxide dismutase copper/zinc binding  41.91 
 
 
206 aa  95.5  4e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.100957 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1161  superoxide dismutase copper/zinc binding  40.52 
 
 
171 aa  94.4  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.552065  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2757  superoxide dismutase, copper/zinc binding  43.36 
 
 
191 aa  94.4  9e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00492325  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0124  superoxide dismutase copper/zinc binding  47.62 
 
 
189 aa  93.6  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0952022 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4761  superoxide dismutase, copper/zinc binding  39.1 
 
 
179 aa  94  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.271734  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3819  superoxide dismutase copper/zinc binding  36.55 
 
 
179 aa  92  4e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.130006  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1796  putative copper/Zinc superoxide dismutase  40.69 
 
 
185 aa  92  4e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.749298  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3449  superoxide dismutase, copper/zinc binding  39.55 
 
 
180 aa  92  4e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  0.00000937306 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4523  superoxide dismutase  40.3 
 
 
510 aa  91.7  6e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2380  superoxide dismutase copper/zinc binding protein  38.32 
 
 
220 aa  91.3  7e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3942  superoxide dismutase copper/zinc binding  39.46 
 
 
212 aa  91.3  7e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379903  normal  0.128954 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4679  superoxide dismutase copper/zinc binding  35.42 
 
 
201 aa  90.9  8e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.841473 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4310  superoxide dismutase copper/zinc binding  35.42 
 
 
201 aa  90.9  8e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.366806  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2378  superoxide dismutase copper/zinc binding  36.99 
 
 
177 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0442  superoxide dismutase, copper/zinc binding  40 
 
 
185 aa  90.1  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.039325  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3554  superoxide dismutase  39.73 
 
 
171 aa  88.6  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642978  normal  0.247145 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1561  superoxide dismutase copper/zinc binding  36.72 
 
 
172 aa  87.8  8e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.639151  normal  0.731272 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4827  superoxide dismutase copper/zinc binding  36.11 
 
 
201 aa  87  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.661461  normal  0.600787 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1900  superoxide dismutase, copper/zinc binding  35.46 
 
 
185 aa  86.3  2e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.370601  normal  0.24871 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0906  superoxide dismutase, Cu/Zn  33.52 
 
 
192 aa  85.5  4e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.381444  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1880  superoxide dismutase copper/zinc binding  37.04 
 
 
175 aa  84.7  6e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2057  superoxide dismutase, copper/zinc binding  37.04 
 
 
175 aa  84.7  6e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0494601  normal  0.319354 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12203  Copper/Zinc superoxide dismutase  35.04 
 
 
194 aa  83.6  0.000000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.348099  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0454  superoxide dismutase, copper/zinc binding  37.24 
 
 
190 aa  83.6  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.101401  normal  0.041937 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1980  superoxide dismutase, copper/zinc binding  38.78 
 
 
183 aa  81.6  0.000000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0783595 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03563  superoxide dismutase  43.75 
 
 
200 aa  80.5  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3728  superoxide dismutase copper/zinc binding protein  35.96 
 
 
244 aa  80.9  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3827  superoxide dismutase  34.62 
 
 
173 aa  79.3  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2922  superoxide dismutase copper/zinc binding  38.51 
 
 
183 aa  78.6  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.719659  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0702  superoxide dismutase copper/zinc binding  36.67 
 
 
172 aa  77.8  0.00000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.123655  normal  0.846065 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3343  superoxide dismutase copper/zinc binding protein  35.15 
 
 
210 aa  77.4  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0409606 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0733  superoxide dismutase copper/zinc binding  34.9 
 
 
175 aa  76.6  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000189816  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08070  superoxide dismutase (Cu-Zn)  31.33 
 
 
158 aa  76.6  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000475437  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4195  superoxide dismutase copper/zinc binding  37.39 
 
 
210 aa  74.7  0.0000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3711  superoxide dismutase copper/zinc binding  34.33 
 
 
180 aa  71.6  0.000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7975  Cu/Zn superoxide dismutase-like protein  32.34 
 
 
226 aa  71.2  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102706  normal  0.114926 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4059  superoxide dismutase copper/zinc binding  34.34 
 
 
214 aa  71.2  0.000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.453641  normal  0.169503 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1347  superoxide dismutase, copper/zinc binding  32.89 
 
 
183 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2210  superoxide dismutase  36.13 
 
 
173 aa  69.7  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0109092  hitchhiker  0.000454174 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1338  superoxide dismutase, Cu-Zn  34.01 
 
 
172 aa  68.9  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2485  superoxide dismutase  33.33 
 
 
171 aa  67.8  0.00000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.841642  normal  0.166633 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3163  superoxide dismutase (Cu-Zn)  33.33 
 
 
174 aa  67.8  0.00000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.315078  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0511  superoxide dismutase [Cu-Zn] precursor  31.82 
 
 
170 aa  67.4  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.59112  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0703  superoxide dismutase, Cu-Zn  32.45 
 
 
173 aa  66.6  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1419  copper/zinc superoxide dismutase  33.55 
 
 
177 aa  66.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0294455 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1154  copper/zinc superoxide dismutase  33.55 
 
 
177 aa  66.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0659  superoxide dismutase, Cu-Zn  32.45 
 
 
173 aa  66.6  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1082  copper/zinc superoxide dismutase  33.55 
 
 
177 aa  66.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.302029 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2022  superoxide dismutase (Cu-Zn)  32.88 
 
 
170 aa  66.6  0.0000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1838  superoxide dismutase  33.11 
 
 
173 aa  65.5  0.0000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.159694  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1507  superoxide dismutase precursor (Cu-Zn)  33.12 
 
 
178 aa  65.1  0.0000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.814898  normal  0.841266 
 
 
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NC_009784  VIBHAR_06578  hypothetical protein  32.47 
 
 
170 aa  65.1  0.0000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1154  copper/Zinc superoxide dismutase  32.65 
 
 
172 aa  64.7  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.744174 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30470  CU-Zn Superoxide dismutase  32.68 
 
 
180 aa  65.1  0.0000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1186  superoxide dismutase, Cu-Zn  30.72 
 
 
171 aa  64.7  0.0000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_013457  VEA_001207  superoxide dismutase [Cu-Zn] precursor  32.28 
 
 
171 aa  64.7  0.0000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_006368  lpp2297  superoxide dismutase [Cu-Zn] precursor  33.58 
 
 
162 aa  64.3  0.0000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_006369  lpl2270  superoxide dismutase [Cu-Zn] precursor  34.31 
 
 
162 aa  64.3  0.0000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_012917  PC1_2101  superoxide dismutase copper/zinc binding  32.89 
 
 
174 aa  64.3  0.0000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.651227  n/a   
 
 
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