146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3819 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3819  superoxide dismutase copper/zinc binding  100 
 
 
179 aa  360  5.0000000000000005e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.130006  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4679  superoxide dismutase copper/zinc binding  72.62 
 
 
201 aa  241  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.841473 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4310  superoxide dismutase copper/zinc binding  72.62 
 
 
201 aa  241  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.366806  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4827  superoxide dismutase copper/zinc binding  71.86 
 
 
201 aa  238  4e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.661461  normal  0.600787 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2378  superoxide dismutase copper/zinc binding  63.33 
 
 
177 aa  221  4e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2833  superoxide dismutase copper/zinc binding  72.3 
 
 
177 aa  218  3e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0916793  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0122  superoxide dismutase copper/zinc binding  56 
 
 
179 aa  160  8.000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.542638  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2922  superoxide dismutase copper/zinc binding  56.52 
 
 
183 aa  159  2e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.719659  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2872  superoxide dismutase copper/zinc binding  50 
 
 
169 aa  138  4.999999999999999e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0217452 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1561  superoxide dismutase copper/zinc binding  47.83 
 
 
172 aa  137  7.999999999999999e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.639151  normal  0.731272 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1699  superoxide dismutase copper/zinc binding  44.44 
 
 
176 aa  121  5e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000210654  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0195  superoxide dismutase, Cu-Zn  43.71 
 
 
179 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5039  superoxide dismutase, Cu-Zn  42.86 
 
 
179 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.792086  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3011  superoxide dismutase copper/zinc binding protein  44.3 
 
 
174 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2865  superoxide dismutase copper/zinc binding  43.66 
 
 
172 aa  114  5e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4777  superoxide dismutase, Cu-Zn  43.05 
 
 
179 aa  114  6e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4617  superoxide dismutase, Cu-Zn  43.05 
 
 
179 aa  114  6e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4639  superoxide dismutase, Cu-Zn  43.05 
 
 
179 aa  114  6e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5139  superoxide dismutase, Cu-Zn  43.05 
 
 
179 aa  114  6e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5018  superoxide dismutase, Cu-Zn  43.05 
 
 
165 aa  114  6e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5051  superoxide dismutase, Cu-Zn  43.05 
 
 
179 aa  114  6e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5046  superoxide dismutase, Cu-Zn  42.21 
 
 
179 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4729  superoxide dismutase copper/zinc binding  40 
 
 
179 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3518  superoxide dismutase copper/zinc binding  41.38 
 
 
180 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4070  superoxide dismutase copper/zinc binding  43.45 
 
 
171 aa  108  5e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.273253  normal  0.944661 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0488  superoxide dismutase, copper/zinc binding  39.07 
 
 
172 aa  105  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0224  superoxide dismutase copper/zinc binding  40.69 
 
 
172 aa  105  4e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.504945  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3135  superoxide dismutase, copper/zinc binding  37.16 
 
 
191 aa  104  6e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.310957  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3067  Superoxide dismutase  40.97 
 
 
175 aa  101  5e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00079657 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2345  superoxide dismutase  38.71 
 
 
178 aa  99.4  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0211561  normal  0.0730316 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2796  copper/Zinc superoxide dismutase  37.66 
 
 
169 aa  99.4  3e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.914684 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3220  superoxide dismutase, copper/zinc binding  35.63 
 
 
173 aa  99  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3597  superoxide dismutase, copper/zinc binding  39.47 
 
 
169 aa  96.7  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.592346  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0817  superoxide dismutase, copper/zinc binding  44.17 
 
 
226 aa  93.6  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.509975  decreased coverage  0.0003056 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1796  putative copper/Zinc superoxide dismutase  35.62 
 
 
185 aa  90.9  9e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.749298  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0442  superoxide dismutase, copper/zinc binding  35.62 
 
 
185 aa  89.7  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.039325  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2943  copper/Zinc superoxide dismutase  44.17 
 
 
172 aa  89.4  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.171551  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1161  superoxide dismutase copper/zinc binding  37.42 
 
 
171 aa  88.2  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.552065  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1009  superoxide dismutase copper/zinc binding  37.42 
 
 
171 aa  87  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.814161 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0454  superoxide dismutase, copper/zinc binding  35.09 
 
 
190 aa  84  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.101401  normal  0.041937 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03561  superoxide dismutase  41.78 
 
 
203 aa  84  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4681  Superoxide dismutase  36.3 
 
 
208 aa  83.2  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.179058 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0125  superoxide dismutase copper/zinc binding  39.85 
 
 
206 aa  82  0.000000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.100957 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1610  Superoxide dismutase  40.34 
 
 
184 aa  81.6  0.000000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1782  copper/Zinc superoxide dismutase  37.5 
 
 
156 aa  81.3  0.000000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0702  superoxide dismutase copper/zinc binding  39.16 
 
 
172 aa  81.3  0.000000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.123655  normal  0.846065 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1634  superoxide dismutase, copper/zinc binding  39.02 
 
 
165 aa  81.3  0.000000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.725775 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7975  Cu/Zn superoxide dismutase-like protein  35.71 
 
 
226 aa  80.5  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102706  normal  0.114926 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3449  superoxide dismutase, copper/zinc binding  41.53 
 
 
180 aa  78.6  0.00000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  0.00000937306 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4338  copper/Zinc superoxide dismutase  38.35 
 
 
180 aa  78.2  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3343  superoxide dismutase copper/zinc binding protein  32.12 
 
 
210 aa  77  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0409606 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0124  superoxide dismutase copper/zinc binding  39.17 
 
 
189 aa  75.5  0.0000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0952022 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2757  superoxide dismutase, copper/zinc binding  42.34 
 
 
191 aa  75.1  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00492325  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2057  superoxide dismutase, copper/zinc binding  42.5 
 
 
175 aa  73.6  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0494601  normal  0.319354 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3554  superoxide dismutase  37.88 
 
 
171 aa  73.2  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642978  normal  0.247145 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1880  superoxide dismutase copper/zinc binding  42.5 
 
 
175 aa  73.6  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0906  superoxide dismutase, Cu/Zn  34.44 
 
 
192 aa  72.4  0.000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.381444  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1347  superoxide dismutase, copper/zinc binding  33.95 
 
 
183 aa  71.6  0.000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3711  superoxide dismutase copper/zinc binding  39.5 
 
 
180 aa  71.2  0.000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03563  superoxide dismutase  33.76 
 
 
200 aa  71.2  0.000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3942  superoxide dismutase copper/zinc binding  36.97 
 
 
212 aa  71.2  0.000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379903  normal  0.128954 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2368  superoxide dismutase Cu-Zn precursor protein  37.4 
 
 
182 aa  70.1  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0422357 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3638  superoxide dismutase, copper/zinc binding  34.29 
 
 
173 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2380  superoxide dismutase copper/zinc binding protein  32.87 
 
 
220 aa  68.9  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0852  superoxide dismutase, copper/zinc binding  36.88 
 
 
183 aa  68.9  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.260138 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2297  superoxide dismutase, copper/zinc binding  37.24 
 
 
180 aa  68.2  0.00000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.011982  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30470  CU-Zn Superoxide dismutase  33.93 
 
 
180 aa  67  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1626  superoxide dismutase, copper/zinc binding  36.04 
 
 
177 aa  67  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4761  superoxide dismutase, copper/zinc binding  31.37 
 
 
179 aa  67.4  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.271734  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2177  superoxide dismutase copper/zinc binding  37.98 
 
 
183 aa  67.4  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.462725  normal  0.0481765 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03307  superoxide dismutase, Cu-Zn  40 
 
 
181 aa  65.9  0.0000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00782096  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2767  superoxide dismutase copper/zinc binding protein  31.52 
 
 
204 aa  65.5  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.238721 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1186  superoxide dismutase, Cu-Zn  36.05 
 
 
171 aa  65.5  0.0000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0735  superoxide dismutase, copper/zinc binding  32.16 
 
 
235 aa  64.7  0.0000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2581  superoxide dismutase copper/zinc binding  37.98 
 
 
183 aa  64.7  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.152888  normal  0.324375 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1801  superoxide dismutase  36.67 
 
 
172 aa  63.9  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0159903  normal  0.0303591 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0572  superoxide dismutase, copper/zinc binding protein  32.14 
 
 
228 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2024  superoxide dismutase, copper/zinc binding  35.81 
 
 
170 aa  62.8  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000023752  hitchhiker  0.00000198076 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1951  superoxide dismutase, copper/zinc binding protein  35.81 
 
 
170 aa  62.8  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0285693  hitchhiker  0.00191784 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2125  superoxide dismutase, copper/zinc binding  35.81 
 
 
170 aa  62.8  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0013475  normal  0.0132534 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0584  superoxide dismutase, copper/zinc binding  32.14 
 
 
228 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.327335  hitchhiker  0.00792141 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2653  superoxide dismutase, copper/zinc binding  34.18 
 
 
182 aa  62.8  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.792961  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0562  superoxide dismutase, copper/zinc binding  32.14 
 
 
228 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.751022 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06578  hypothetical protein  34.23 
 
 
170 aa  62.4  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12203  Copper/Zinc superoxide dismutase  31.01 
 
 
194 aa  61.6  0.000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.348099  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2599  superoxide dismutase, copper/zinc binding  31.29 
 
 
239 aa  61.6  0.000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00595972  normal  0.45771 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3163  superoxide dismutase (Cu-Zn)  31.41 
 
 
174 aa  61.2  0.000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.315078  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1610  superoxide dismutase  37.09 
 
 
173 aa  60.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.815221 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1900  superoxide dismutase, copper/zinc binding  30 
 
 
185 aa  60.8  0.00000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.370601  normal  0.24871 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1200  putative superoxide dismutase  30.37 
 
 
219 aa  60.5  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0161  copper/zinc superoxide dismutase  30.32 
 
 
178 aa  60.5  0.00000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00000919214  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2485  superoxide dismutase  34.69 
 
 
171 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.841642  normal  0.166633 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1154  copper/Zinc superoxide dismutase  33.54 
 
 
172 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.744174 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1903  superoxide dismutase  37.09 
 
 
173 aa  59.7  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.292339  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2297  superoxide dismutase [Cu-Zn] precursor  32.68 
 
 
162 aa  59.3  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2270  superoxide dismutase [Cu-Zn] precursor  32.68 
 
 
162 aa  59.3  0.00000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1507  superoxide dismutase precursor (Cu-Zn)  32.65 
 
 
178 aa  59.3  0.00000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.814898  normal  0.841266 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1537  superoxide dismutase  37.09 
 
 
173 aa  58.9  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.19125  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1550  superoxide dismutase  37.09 
 
 
173 aa  58.9  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3827  superoxide dismutase  30.95 
 
 
173 aa  58.9  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>