170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1610 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_1610  Superoxide dismutase  100 
 
 
184 aa  369  1e-101  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3449  superoxide dismutase, copper/zinc binding  59.46 
 
 
180 aa  191  4e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  0.00000937306 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4681  Superoxide dismutase  53.52 
 
 
208 aa  156  1e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.179058 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3942  superoxide dismutase copper/zinc binding  53.47 
 
 
212 aa  151  4e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379903  normal  0.128954 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2943  copper/Zinc superoxide dismutase  47.59 
 
 
172 aa  149  2e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.171551  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4338  copper/Zinc superoxide dismutase  54.29 
 
 
180 aa  145  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1880  superoxide dismutase copper/zinc binding  51.75 
 
 
175 aa  142  2e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3554  superoxide dismutase  44.94 
 
 
171 aa  142  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642978  normal  0.247145 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2057  superoxide dismutase, copper/zinc binding  51.75 
 
 
175 aa  142  2e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0494601  normal  0.319354 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2368  superoxide dismutase Cu-Zn precursor protein  44.13 
 
 
182 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0422357 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2581  superoxide dismutase copper/zinc binding  43.89 
 
 
183 aa  137  7e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.152888  normal  0.324375 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2177  superoxide dismutase copper/zinc binding  43.33 
 
 
183 aa  135  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.462725  normal  0.0481765 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1626  superoxide dismutase, copper/zinc binding  40.66 
 
 
177 aa  132  1.9999999999999998e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03561  superoxide dismutase  48.94 
 
 
203 aa  130  1.0000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0125  superoxide dismutase copper/zinc binding  44.75 
 
 
206 aa  129  3e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.100957 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0906  superoxide dismutase, Cu/Zn  47.62 
 
 
192 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.381444  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2757  superoxide dismutase, copper/zinc binding  51.8 
 
 
191 aa  124  7e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00492325  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3067  Superoxide dismutase  46.58 
 
 
175 aa  124  7e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00079657 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_28559  predicted protein  38.97 
 
 
197 aa  121  5e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000859292  hitchhiker  0.000000574282 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12203  Copper/Zinc superoxide dismutase  37.17 
 
 
194 aa  120  7e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.348099  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND01490  copper zinc superoxide dismutase  45.81 
 
 
154 aa  118  3.9999999999999996e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.452302  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00241  Superoxide dismutase [Cu-Zn] (EC 1.15.1.1) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q9HEY7]  43.87 
 
 
154 aa  114  7.999999999999999e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03563  superoxide dismutase  45 
 
 
200 aa  113  2.0000000000000002e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2599  superoxide dismutase, copper/zinc binding  43.37 
 
 
239 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00595972  normal  0.45771 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3597  superoxide dismutase, copper/zinc binding  43.92 
 
 
169 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.592346  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0124  superoxide dismutase copper/zinc binding  42.05 
 
 
189 aa  109  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0952022 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4761  superoxide dismutase, copper/zinc binding  37.58 
 
 
179 aa  109  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.271734  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89018  Superoxide dismutase (Cu-Zn)  45.81 
 
 
154 aa  108  3e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.204777  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3011  superoxide dismutase copper/zinc binding protein  35.52 
 
 
174 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2345  superoxide dismutase  41.78 
 
 
178 aa  107  7.000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0211561  normal  0.0730316 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2796  copper/Zinc superoxide dismutase  39.86 
 
 
169 aa  105  3e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.914684 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4070  superoxide dismutase copper/zinc binding  41.96 
 
 
171 aa  105  4e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.273253  normal  0.944661 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0224  superoxide dismutase copper/zinc binding  41.55 
 
 
172 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.504945  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1980  superoxide dismutase, copper/zinc binding  39.13 
 
 
183 aa  103  1e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0783595 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3711  superoxide dismutase copper/zinc binding  43.92 
 
 
180 aa  103  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1900  superoxide dismutase, copper/zinc binding  36.76 
 
 
185 aa  100  1e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.370601  normal  0.24871 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0817  superoxide dismutase, copper/zinc binding  42.03 
 
 
226 aa  99.8  2e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.509975  decreased coverage  0.0003056 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0488  superoxide dismutase, copper/zinc binding  39.04 
 
 
172 aa  99  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2865  superoxide dismutase copper/zinc binding  37.88 
 
 
172 aa  98.6  5e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3135  superoxide dismutase, copper/zinc binding  34.86 
 
 
191 aa  97.4  1e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.310957  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0195  superoxide dismutase, Cu-Zn  33.7 
 
 
179 aa  96.7  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4729  superoxide dismutase copper/zinc binding  33.88 
 
 
179 aa  96.7  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5039  superoxide dismutase, Cu-Zn  32.78 
 
 
179 aa  96.3  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.792086  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3518  superoxide dismutase copper/zinc binding  34.71 
 
 
180 aa  96.7  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4777  superoxide dismutase, Cu-Zn  33.7 
 
 
179 aa  95.9  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4617  superoxide dismutase, Cu-Zn  33.7 
 
 
179 aa  95.9  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4639  superoxide dismutase, Cu-Zn  33.7 
 
 
179 aa  95.9  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5139  superoxide dismutase, Cu-Zn  33.7 
 
 
179 aa  95.9  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5051  superoxide dismutase, Cu-Zn  33.7 
 
 
179 aa  95.9  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1018  superoxide dismutase copper/zinc binding  39.46 
 
 
177 aa  95.1  5e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0356333  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4523  superoxide dismutase  38.69 
 
 
510 aa  94.4  8e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5046  superoxide dismutase, Cu-Zn  32.6 
 
 
179 aa  94.4  9e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1009  superoxide dismutase copper/zinc binding  41.06 
 
 
171 aa  94  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.814161 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3479  putative copper/zinc superoxide dismutase  38.78 
 
 
177 aa  94  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1161  superoxide dismutase copper/zinc binding  41.06 
 
 
171 aa  94  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.552065  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2188  superoxide dismutase copper/zinc binding  38.78 
 
 
206 aa  93.2  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0161821  normal  0.256851 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2872  superoxide dismutase copper/zinc binding  41.04 
 
 
169 aa  92.8  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0217452 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5018  superoxide dismutase, Cu-Zn  33.53 
 
 
165 aa  89.7  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1634  superoxide dismutase, copper/zinc binding  36.87 
 
 
165 aa  88.6  5e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.725775 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08070  superoxide dismutase (Cu-Zn)  37.93 
 
 
158 aa  88.2  6e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000475437  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_15852  predicted protein  40.8 
 
 
138 aa  88.2  6e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0113934  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3220  superoxide dismutase, copper/zinc binding  38.06 
 
 
173 aa  87.4  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0859  superoxide dismutase, Cu-Zn  40.4 
 
 
216 aa  85.9  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4195  superoxide dismutase copper/zinc binding  37.06 
 
 
210 aa  85.5  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2653  superoxide dismutase, copper/zinc binding  35.77 
 
 
182 aa  85.1  5e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.792961  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1782  copper/Zinc superoxide dismutase  39.31 
 
 
156 aa  84.3  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1214  superoxide dismutase, Cu-Zn  38.41 
 
 
179 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5765  copper/Zinc superoxide dismutase  40.28 
 
 
178 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.212202  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1056  copper/zinc superoxide dismutase  38.41 
 
 
179 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1062  copper/zinc superoxide dismutase  38.41 
 
 
179 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.7887  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3819  superoxide dismutase copper/zinc binding  40.34 
 
 
179 aa  81.6  0.000000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.130006  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0442  superoxide dismutase, copper/zinc binding  40.5 
 
 
185 aa  81.3  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.039325  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0852  superoxide dismutase, copper/zinc binding  41.79 
 
 
183 aa  81.3  0.000000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.260138 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0713  superoxide dismutase, Cu-Zn  37.75 
 
 
179 aa  81.3  0.000000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.159007  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2481  superoxide dismutase, copper/zinc binding  40.28 
 
 
178 aa  81.3  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2347  superoxide dismutase copper/zinc binding  40.28 
 
 
178 aa  81.3  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.178903 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2300  superoxide dismutase, Cu-Zn  37.75 
 
 
179 aa  81.3  0.000000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2986  superoxide dismutase, Cu-Zn  37.75 
 
 
179 aa  81.3  0.000000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.228777  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1613  superoxide dismutase, Cu-Zn  37.75 
 
 
179 aa  81.3  0.000000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0712489  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1796  putative copper/Zinc superoxide dismutase  35.29 
 
 
185 aa  80.5  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.749298  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1823  superoxide dismutase, copper/zinc binding  40.28 
 
 
178 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0265669  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2439  superoxide dismutase copper/zinc binding  40.28 
 
 
178 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000305746  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2434  superoxide dismutase, copper/zinc binding  40.28 
 
 
178 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0971704  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0860  superoxide dismutase copper/zinc binding  39.58 
 
 
178 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0340028  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03307  superoxide dismutase, Cu-Zn  38 
 
 
181 aa  80.1  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00782096  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3827  superoxide dismutase  32.95 
 
 
173 aa  78.6  0.00000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0122  superoxide dismutase copper/zinc binding  37.04 
 
 
179 aa  77.8  0.00000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.542638  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2297  superoxide dismutase, copper/zinc binding  35.53 
 
 
180 aa  77.8  0.00000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.011982  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0454  superoxide dismutase, copper/zinc binding  38.84 
 
 
190 aa  77.8  0.00000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.101401  normal  0.041937 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01616  superoxide dismutase, Cu, Zn  35.64 
 
 
173 aa  76.3  0.0000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00181178  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1994  Superoxide dismutase  35.64 
 
 
173 aa  76.3  0.0000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000374216  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2358  superoxide dismutase  35.64 
 
 
173 aa  76.3  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000359959  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1983  superoxide dismutase  35.64 
 
 
178 aa  75.9  0.0000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0141955  hitchhiker  0.00119703 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4310  superoxide dismutase copper/zinc binding  35.71 
 
 
201 aa  75.9  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.366806  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01606  hypothetical protein  35.64 
 
 
173 aa  76.3  0.0000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00112048  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4679  superoxide dismutase copper/zinc binding  35.71 
 
 
201 aa  75.9  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.841473 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1723  superoxide dismutase  35.64 
 
 
173 aa  76.3  0.0000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.335611  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1857  superoxide dismutase  35.64 
 
 
173 aa  76.3  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.195407  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1552  superoxide dismutase  35.11 
 
 
173 aa  75.5  0.0000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0496165  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2022  superoxide dismutase (Cu-Zn)  35.88 
 
 
170 aa  75.1  0.0000000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>