142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7975 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_7975  Cu/Zn superoxide dismutase-like protein  100 
 
 
226 aa  439  9.999999999999999e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102706  normal  0.114926 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2767  superoxide dismutase copper/zinc binding protein  53.66 
 
 
204 aa  164  6.9999999999999995e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.238721 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2380  superoxide dismutase copper/zinc binding protein  46.84 
 
 
220 aa  137  1e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4059  superoxide dismutase copper/zinc binding  43.46 
 
 
214 aa  134  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.453641  normal  0.169503 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3343  superoxide dismutase copper/zinc binding protein  43.56 
 
 
210 aa  125  5e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0409606 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0735  superoxide dismutase, copper/zinc binding  40.18 
 
 
235 aa  125  8.000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10437  periplasmic superoxide dismutase [Cu-Zn] sodC  36.82 
 
 
240 aa  123  2e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0336347  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0572  superoxide dismutase, copper/zinc binding protein  41.42 
 
 
228 aa  119  3e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0584  superoxide dismutase, copper/zinc binding  41.42 
 
 
228 aa  119  3e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.327335  hitchhiker  0.00792141 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0562  superoxide dismutase, copper/zinc binding  41.42 
 
 
228 aa  119  3e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.751022 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0172  superoxide dismutase, copper/zinc binding  41.92 
 
 
236 aa  119  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.509734 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0664  superoxide dismutase copper/zinc binding protein  37.84 
 
 
218 aa  115  7.999999999999999e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2345  superoxide dismutase  41.24 
 
 
178 aa  114  8.999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0211561  normal  0.0730316 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3728  superoxide dismutase copper/zinc binding protein  33.74 
 
 
244 aa  105  6e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4070  superoxide dismutase copper/zinc binding  38.51 
 
 
171 aa  89.4  4e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.273253  normal  0.944661 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3067  Superoxide dismutase  34.68 
 
 
175 aa  86.7  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00079657 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1782  copper/Zinc superoxide dismutase  32.94 
 
 
156 aa  85.1  9e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2865  superoxide dismutase copper/zinc binding  33.94 
 
 
172 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3597  superoxide dismutase, copper/zinc binding  34.48 
 
 
169 aa  83.2  0.000000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.592346  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3011  superoxide dismutase copper/zinc binding protein  32.57 
 
 
174 aa  83.2  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3819  superoxide dismutase copper/zinc binding  34.97 
 
 
179 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.130006  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0817  superoxide dismutase, copper/zinc binding  35.84 
 
 
226 aa  78.6  0.00000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.509975  decreased coverage  0.0003056 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4195  superoxide dismutase copper/zinc binding  35.76 
 
 
210 aa  78.6  0.00000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2796  copper/Zinc superoxide dismutase  31.79 
 
 
169 aa  77  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.914684 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3135  superoxide dismutase, copper/zinc binding  33.92 
 
 
191 aa  77.4  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.310957  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0122  superoxide dismutase copper/zinc binding  30.9 
 
 
179 aa  77.4  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.542638  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2872  superoxide dismutase copper/zinc binding  32.16 
 
 
169 aa  77  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0217452 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4679  superoxide dismutase copper/zinc binding  30.85 
 
 
201 aa  76.3  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.841473 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4195  superoxide dismutase, copper/zinc binding protein  37.35 
 
 
219 aa  76.6  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.177234  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4261  superoxide dismutase, copper/zinc binding  37.35 
 
 
219 aa  76.6  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.871501  normal  0.596639 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4422  superoxide dismutase, copper/zinc binding  37.35 
 
 
219 aa  76.6  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.342214  normal  0.255666 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4310  superoxide dismutase copper/zinc binding  30.85 
 
 
201 aa  76.3  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.366806  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3220  superoxide dismutase, copper/zinc binding  30.36 
 
 
173 aa  75.9  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0488  superoxide dismutase, copper/zinc binding  29.21 
 
 
172 aa  75.5  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0733  superoxide dismutase copper/zinc binding  34.78 
 
 
175 aa  75.5  0.0000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000189816  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0224  superoxide dismutase copper/zinc binding  29.82 
 
 
172 aa  75.5  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.504945  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3518  superoxide dismutase copper/zinc binding  31.58 
 
 
180 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08070  superoxide dismutase (Cu-Zn)  38.89 
 
 
158 aa  72.4  0.000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000475437  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1989  superoxide dismutase, copper/zinc binding  41.54 
 
 
268 aa  72.4  0.000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1801  superoxide dismutase  33.33 
 
 
172 aa  70.5  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0159903  normal  0.0303591 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3942  superoxide dismutase copper/zinc binding  31.88 
 
 
212 aa  70.1  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379903  normal  0.128954 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4827  superoxide dismutase copper/zinc binding  28.57 
 
 
201 aa  69.7  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.661461  normal  0.600787 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2125  superoxide dismutase, copper/zinc binding  32.52 
 
 
170 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0013475  normal  0.0132534 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2024  superoxide dismutase, copper/zinc binding  32.52 
 
 
170 aa  68.9  0.00000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000023752  hitchhiker  0.00000198076 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1951  superoxide dismutase, copper/zinc binding protein  32.52 
 
 
170 aa  68.9  0.00000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0285693  hitchhiker  0.00191784 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2653  superoxide dismutase, copper/zinc binding  32.1 
 
 
182 aa  68.2  0.00000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.792961  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1561  superoxide dismutase copper/zinc binding  28.65 
 
 
172 aa  67  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.639151  normal  0.731272 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1796  putative copper/Zinc superoxide dismutase  29.73 
 
 
185 aa  65.9  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.749298  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1838  superoxide dismutase  33.54 
 
 
173 aa  66.2  0.0000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.159694  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1880  superoxide dismutase copper/zinc binding  32.95 
 
 
175 aa  65.5  0.0000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2057  superoxide dismutase, copper/zinc binding  32.95 
 
 
175 aa  65.5  0.0000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0494601  normal  0.319354 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2833  superoxide dismutase copper/zinc binding  30 
 
 
177 aa  65.5  0.0000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0916793  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01616  superoxide dismutase, Cu, Zn  33.54 
 
 
173 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00181178  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1994  Superoxide dismutase  33.54 
 
 
173 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000374216  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01606  hypothetical protein  33.54 
 
 
173 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00112048  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2358  superoxide dismutase  33.54 
 
 
173 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000359959  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3827  superoxide dismutase  31.43 
 
 
173 aa  64.7  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1723  superoxide dismutase  33.54 
 
 
173 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.335611  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1857  superoxide dismutase  33.54 
 
 
173 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.195407  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1983  superoxide dismutase  33.54 
 
 
178 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0141955  hitchhiker  0.00119703 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1552  superoxide dismutase  33.54 
 
 
173 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0496165  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2599  superoxide dismutase, copper/zinc binding  32.42 
 
 
239 aa  63.9  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00595972  normal  0.45771 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1186  superoxide dismutase, Cu-Zn  31.9 
 
 
171 aa  63.9  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2485  superoxide dismutase  29.57 
 
 
171 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.841642  normal  0.166633 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0442  superoxide dismutase, copper/zinc binding  28.65 
 
 
185 aa  63.2  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.039325  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2378  superoxide dismutase copper/zinc binding  28.49 
 
 
177 aa  63.5  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4681  Superoxide dismutase  26.55 
 
 
208 aa  62.8  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.179058 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1610  superoxide dismutase  31.65 
 
 
173 aa  62.8  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.815221 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0454  superoxide dismutase, copper/zinc binding  29.67 
 
 
190 aa  62.4  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.101401  normal  0.041937 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2368  superoxide dismutase Cu-Zn precursor protein  29.96 
 
 
182 aa  62  0.000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0422357 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1347  superoxide dismutase, copper/zinc binding  32.85 
 
 
183 aa  62.4  0.000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3554  superoxide dismutase  31.87 
 
 
171 aa  62  0.000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642978  normal  0.247145 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0703  superoxide dismutase, Cu-Zn  29.69 
 
 
173 aa  61.2  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3449  superoxide dismutase, copper/zinc binding  32.94 
 
 
180 aa  61.6  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  0.00000937306 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0659  superoxide dismutase, Cu-Zn  29.69 
 
 
173 aa  61.2  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5018  superoxide dismutase, Cu-Zn  31.18 
 
 
165 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1537  superoxide dismutase  31.01 
 
 
173 aa  60.5  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.19125  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1903  superoxide dismutase  31.01 
 
 
173 aa  60.5  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.292339  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3163  superoxide dismutase (Cu-Zn)  33.12 
 
 
174 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.315078  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2101  superoxide dismutase copper/zinc binding  29.89 
 
 
174 aa  60.8  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.651227  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1550  superoxide dismutase  31.01 
 
 
173 aa  60.5  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5046  superoxide dismutase, Cu-Zn  31.18 
 
 
179 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2943  copper/Zinc superoxide dismutase  27.65 
 
 
172 aa  60.1  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.171551  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1734  superoxide dismutase  31.01 
 
 
173 aa  60.1  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0827551  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5039  superoxide dismutase, Cu-Zn  30.64 
 
 
179 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.792086  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2022  superoxide dismutase (Cu-Zn)  33.13 
 
 
170 aa  60.1  0.00000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4729  superoxide dismutase copper/zinc binding  31.18 
 
 
179 aa  60.1  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1338  superoxide dismutase, Cu-Zn  33.09 
 
 
172 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2210  superoxide dismutase  31.16 
 
 
173 aa  59.7  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0109092  hitchhiker  0.000454174 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4777  superoxide dismutase, Cu-Zn  31.18 
 
 
179 aa  58.9  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4617  superoxide dismutase, Cu-Zn  31.18 
 
 
179 aa  58.9  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4639  superoxide dismutase, Cu-Zn  31.18 
 
 
179 aa  58.9  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5139  superoxide dismutase, Cu-Zn  31.18 
 
 
179 aa  58.9  0.00000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5051  superoxide dismutase, Cu-Zn  31.18 
 
 
179 aa  58.9  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3315  copper/zinc superoxide dismutase  28.65 
 
 
195 aa  58.9  0.00000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.151154  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06578  hypothetical protein  32.3 
 
 
170 aa  58.9  0.00000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0659  superoxide dismutase, Cu-Zn  31.9 
 
 
174 aa  58.5  0.00000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3445  superoxide dismutase  28.65 
 
 
201 aa  58.5  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1634  superoxide dismutase, copper/zinc binding  31.4 
 
 
165 aa  57.8  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.725775 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0978  copper/zinc superoxide dismutase  31.39 
 
 
189 aa  57.8  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>