165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1154 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_1154  copper/Zinc superoxide dismutase  100 
 
 
172 aa  338  2e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.744174 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1338  superoxide dismutase, Cu-Zn  90.7 
 
 
172 aa  306  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2210  superoxide dismutase  71.18 
 
 
173 aa  241  3e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0109092  hitchhiker  0.000454174 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3163  superoxide dismutase (Cu-Zn)  64.16 
 
 
174 aa  222  2e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.315078  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1200  putative superoxide dismutase  69.03 
 
 
219 aa  218  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2101  superoxide dismutase copper/zinc binding  64.74 
 
 
174 aa  212  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.651227  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3445  superoxide dismutase  70.78 
 
 
201 aa  209  2e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3315  copper/zinc superoxide dismutase  70.78 
 
 
195 aa  209  2e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.151154  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0978  copper/zinc superoxide dismutase  70.78 
 
 
189 aa  208  3e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1154  copper/zinc superoxide dismutase  68.63 
 
 
177 aa  205  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1419  copper/zinc superoxide dismutase  68.63 
 
 
177 aa  205  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0294455 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1082  copper/zinc superoxide dismutase  68.63 
 
 
177 aa  205  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.302029 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0659  superoxide dismutase, Cu-Zn  66.46 
 
 
174 aa  204  7e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30470  CU-Zn Superoxide dismutase  58.14 
 
 
180 aa  202  2e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2125  superoxide dismutase, copper/zinc binding  62.2 
 
 
170 aa  201  5e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0013475  normal  0.0132534 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01616  superoxide dismutase, Cu, Zn  60.47 
 
 
173 aa  199  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00181178  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1994  Superoxide dismutase  60.47 
 
 
173 aa  199  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000374216  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2358  superoxide dismutase  60.47 
 
 
173 aa  199  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000359959  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1983  superoxide dismutase  60.47 
 
 
178 aa  199  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0141955  hitchhiker  0.00119703 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1723  superoxide dismutase  60.47 
 
 
173 aa  199  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.335611  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1857  superoxide dismutase  60.47 
 
 
173 aa  199  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.195407  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01606  hypothetical protein  60.47 
 
 
173 aa  199  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00112048  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1552  superoxide dismutase  59.88 
 
 
173 aa  198  3e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0496165  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1838  superoxide dismutase  59.88 
 
 
173 aa  197  3.9999999999999996e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.159694  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1903  superoxide dismutase  63.06 
 
 
173 aa  197  7e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.292339  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1550  superoxide dismutase  63.06 
 
 
173 aa  196  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2024  superoxide dismutase, copper/zinc binding  64.9 
 
 
170 aa  196  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000023752  hitchhiker  0.00000198076 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1951  superoxide dismutase, copper/zinc binding protein  64.9 
 
 
170 aa  196  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0285693  hitchhiker  0.00191784 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1537  superoxide dismutase  63.06 
 
 
173 aa  196  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.19125  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1610  superoxide dismutase  62.42 
 
 
173 aa  194  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.815221 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1734  superoxide dismutase  62.42 
 
 
173 aa  194  5.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0827551  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1186  superoxide dismutase, Cu-Zn  57.23 
 
 
171 aa  189  2e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1801  superoxide dismutase  57.56 
 
 
172 aa  187  5e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0159903  normal  0.0303591 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2485  superoxide dismutase  57.23 
 
 
171 aa  185  3e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.841642  normal  0.166633 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3827  superoxide dismutase  55.75 
 
 
173 aa  182  2.0000000000000003e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1347  superoxide dismutase, copper/zinc binding  53.45 
 
 
183 aa  179  1e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06578  hypothetical protein  63.77 
 
 
170 aa  176  1e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0397  superoxide dismutase, copper/zinc binding  58.44 
 
 
176 aa  173  9.999999999999999e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3638  superoxide dismutase, copper/zinc binding  56.13 
 
 
173 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0703  superoxide dismutase, Cu-Zn  54.65 
 
 
173 aa  171  3.9999999999999995e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0659  superoxide dismutase, Cu-Zn  54.65 
 
 
173 aa  171  3.9999999999999995e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001207  superoxide dismutase [Cu-Zn] precursor  53.22 
 
 
171 aa  171  3.9999999999999995e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0511  superoxide dismutase [Cu-Zn] precursor  53.18 
 
 
170 aa  169  1e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.59112  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2022  superoxide dismutase (Cu-Zn)  54.39 
 
 
170 aa  166  2e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0161  copper/zinc superoxide dismutase  51.41 
 
 
178 aa  163  1.0000000000000001e-39  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00000919214  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03307  superoxide dismutase, Cu-Zn  49.73 
 
 
181 aa  162  2.0000000000000002e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00782096  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1507  superoxide dismutase precursor (Cu-Zn)  50.89 
 
 
178 aa  156  2e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.814898  normal  0.841266 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0122  superoxide dismutase (Cu/Zn)  57.97 
 
 
179 aa  155  4e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.291157  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2297  superoxide dismutase, copper/zinc binding  48.35 
 
 
180 aa  154  8e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.011982  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0788  copper/zinc superoxide dismutase  56.52 
 
 
178 aa  152  2.9999999999999998e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0982  putative superoxide dismutase  47.73 
 
 
175 aa  151  5e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  decreased coverage  0.000174344  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0538  superoxide dismutase copper/zinc binding  51.28 
 
 
178 aa  148  4e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0765812  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2653  superoxide dismutase, copper/zinc binding  48.75 
 
 
182 aa  147  7e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.792961  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2270  superoxide dismutase [Cu-Zn] precursor  47.56 
 
 
162 aa  147  9e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2297  superoxide dismutase [Cu-Zn] precursor  47.56 
 
 
162 aa  145  4.0000000000000006e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1330  copper/zinc superoxide dismutase  52.98 
 
 
186 aa  142  3e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.236149  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2599  superoxide dismutase, copper/zinc binding  38.31 
 
 
239 aa  87.4  8e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00595972  normal  0.45771 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0442  superoxide dismutase, copper/zinc binding  40.4 
 
 
185 aa  86.7  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.039325  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1796  putative copper/Zinc superoxide dismutase  39.74 
 
 
185 aa  85.5  4e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.749298  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1634  superoxide dismutase, copper/zinc binding  36.52 
 
 
165 aa  81.6  0.000000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.725775 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3067  Superoxide dismutase  42.28 
 
 
175 aa  81.6  0.000000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00079657 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0454  superoxide dismutase, copper/zinc binding  36.25 
 
 
190 aa  79  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.101401  normal  0.041937 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1009  superoxide dismutase copper/zinc binding  36.67 
 
 
171 aa  76.3  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.814161 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4523  superoxide dismutase  34.64 
 
 
510 aa  75.5  0.0000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3343  superoxide dismutase copper/zinc binding protein  38.69 
 
 
210 aa  74.7  0.0000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0409606 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2796  copper/Zinc superoxide dismutase  34.81 
 
 
169 aa  74.7  0.0000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.914684 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4681  Superoxide dismutase  37.96 
 
 
208 aa  74.3  0.0000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.179058 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1161  superoxide dismutase copper/zinc binding  35.33 
 
 
171 aa  73.6  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.552065  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0224  superoxide dismutase copper/zinc binding  39.58 
 
 
172 aa  71.2  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.504945  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3011  superoxide dismutase copper/zinc binding protein  31.55 
 
 
174 aa  71.2  0.000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0122  superoxide dismutase copper/zinc binding  34.16 
 
 
179 aa  70.1  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.542638  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2865  superoxide dismutase copper/zinc binding  31.03 
 
 
172 aa  69.7  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4338  copper/Zinc superoxide dismutase  34.06 
 
 
180 aa  69.3  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2872  superoxide dismutase copper/zinc binding  35.26 
 
 
169 aa  68.6  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0217452 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2581  superoxide dismutase copper/zinc binding  38 
 
 
183 aa  67  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.152888  normal  0.324375 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3135  superoxide dismutase, copper/zinc binding  35.37 
 
 
191 aa  67  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.310957  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3449  superoxide dismutase, copper/zinc binding  33.96 
 
 
180 aa  67  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  0.00000937306 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3597  superoxide dismutase, copper/zinc binding  38.46 
 
 
169 aa  65.5  0.0000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.592346  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2943  copper/Zinc superoxide dismutase  38.3 
 
 
172 aa  65.1  0.0000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.171551  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2057  superoxide dismutase, copper/zinc binding  38.66 
 
 
175 aa  65.1  0.0000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0494601  normal  0.319354 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1880  superoxide dismutase copper/zinc binding  38.66 
 
 
175 aa  64.7  0.0000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1900  superoxide dismutase, copper/zinc binding  32.69 
 
 
185 aa  64.3  0.0000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.370601  normal  0.24871 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2380  superoxide dismutase copper/zinc binding protein  34.15 
 
 
220 aa  63.9  0.0000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3554  superoxide dismutase  35.46 
 
 
171 aa  63.9  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642978  normal  0.247145 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3220  superoxide dismutase, copper/zinc binding  34.62 
 
 
173 aa  63.5  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2177  superoxide dismutase copper/zinc binding  36.91 
 
 
183 aa  63.5  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.462725  normal  0.0481765 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1610  Superoxide dismutase  36.62 
 
 
184 aa  63.5  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0488  superoxide dismutase, copper/zinc binding  35.71 
 
 
172 aa  63.2  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0906  superoxide dismutase, Cu/Zn  35 
 
 
192 aa  62  0.000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.381444  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3942  superoxide dismutase copper/zinc binding  37.41 
 
 
212 aa  62  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379903  normal  0.128954 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4059  superoxide dismutase copper/zinc binding  35.06 
 
 
214 aa  61.2  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.453641  normal  0.169503 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0124  superoxide dismutase copper/zinc binding  39.34 
 
 
189 aa  61.2  0.000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0952022 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3728  superoxide dismutase copper/zinc binding protein  33.71 
 
 
244 aa  60.8  0.000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2368  superoxide dismutase Cu-Zn precursor protein  38.98 
 
 
182 aa  60.5  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0422357 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2757  superoxide dismutase, copper/zinc binding  34.48 
 
 
191 aa  60.5  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00492325  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1699  superoxide dismutase copper/zinc binding  35.81 
 
 
176 aa  60.8  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000210654  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3819  superoxide dismutase copper/zinc binding  33.95 
 
 
179 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.130006  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08070  superoxide dismutase (Cu-Zn)  33.33 
 
 
158 aa  60.5  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000475437  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0733  superoxide dismutase copper/zinc binding  30.87 
 
 
175 aa  59.3  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000189816  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03561  superoxide dismutase  33.8 
 
 
203 aa  59.7  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>