163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0454 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0454  superoxide dismutase, copper/zinc binding  100 
 
 
190 aa  383  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.101401  normal  0.041937 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1796  putative copper/Zinc superoxide dismutase  78.92 
 
 
185 aa  279  2e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.749298  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0442  superoxide dismutase, copper/zinc binding  78.92 
 
 
185 aa  276  2e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.039325  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1634  superoxide dismutase, copper/zinc binding  53.59 
 
 
165 aa  168  5e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.725775 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1009  superoxide dismutase copper/zinc binding  54.17 
 
 
171 aa  166  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.814161 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1161  superoxide dismutase copper/zinc binding  52.78 
 
 
171 aa  163  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.552065  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0702  superoxide dismutase copper/zinc binding  56.64 
 
 
172 aa  162  3e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.123655  normal  0.846065 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3220  superoxide dismutase, copper/zinc binding  42.38 
 
 
173 aa  121  8e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0224  superoxide dismutase copper/zinc binding  48.28 
 
 
172 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.504945  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3597  superoxide dismutase, copper/zinc binding  43.33 
 
 
169 aa  115  3e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.592346  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3011  superoxide dismutase copper/zinc binding protein  40.65 
 
 
174 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0122  superoxide dismutase copper/zinc binding  42.67 
 
 
179 aa  108  6e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.542638  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2796  copper/Zinc superoxide dismutase  38.78 
 
 
169 aa  105  4e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.914684 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0488  superoxide dismutase, copper/zinc binding  42.18 
 
 
172 aa  105  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4681  Superoxide dismutase  45.58 
 
 
208 aa  105  5e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.179058 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1561  superoxide dismutase copper/zinc binding  35.9 
 
 
172 aa  103  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.639151  normal  0.731272 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2865  superoxide dismutase copper/zinc binding  40.14 
 
 
172 aa  100  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3554  superoxide dismutase  40.3 
 
 
171 aa  100  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642978  normal  0.247145 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3067  Superoxide dismutase  41.5 
 
 
175 aa  100  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00079657 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3711  superoxide dismutase copper/zinc binding  40.46 
 
 
180 aa  99.4  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2599  superoxide dismutase, copper/zinc binding  40.25 
 
 
239 aa  99  4e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00595972  normal  0.45771 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4338  copper/Zinc superoxide dismutase  41.3 
 
 
180 aa  98.6  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1782  copper/Zinc superoxide dismutase  43.06 
 
 
156 aa  98.6  5e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1900  superoxide dismutase, copper/zinc binding  34.59 
 
 
185 aa  96.7  2e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.370601  normal  0.24871 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1980  superoxide dismutase, copper/zinc binding  38.78 
 
 
183 aa  96.3  2e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0783595 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2581  superoxide dismutase copper/zinc binding  36.9 
 
 
183 aa  96.3  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.152888  normal  0.324375 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2872  superoxide dismutase copper/zinc binding  37.06 
 
 
169 aa  95.9  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0217452 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2057  superoxide dismutase, copper/zinc binding  39.69 
 
 
175 aa  95.1  5e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0494601  normal  0.319354 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1699  superoxide dismutase copper/zinc binding  39.86 
 
 
176 aa  95.5  5e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000210654  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2833  superoxide dismutase copper/zinc binding  35.47 
 
 
177 aa  94.7  6e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0916793  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1880  superoxide dismutase copper/zinc binding  39.69 
 
 
175 aa  95.1  6e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0125  superoxide dismutase copper/zinc binding  38.06 
 
 
206 aa  94.7  7e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.100957 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4679  superoxide dismutase copper/zinc binding  35.84 
 
 
201 aa  92.4  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.841473 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2177  superoxide dismutase copper/zinc binding  35.11 
 
 
183 aa  92.4  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.462725  normal  0.0481765 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4310  superoxide dismutase copper/zinc binding  35.84 
 
 
201 aa  92.4  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.366806  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2378  superoxide dismutase copper/zinc binding  34.48 
 
 
177 aa  92  5e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4827  superoxide dismutase copper/zinc binding  32.76 
 
 
201 aa  88.6  6e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.661461  normal  0.600787 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1626  superoxide dismutase, copper/zinc binding  43.09 
 
 
177 aa  87.8  8e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4070  superoxide dismutase copper/zinc binding  40 
 
 
171 aa  87.8  8e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.273253  normal  0.944661 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0124  superoxide dismutase copper/zinc binding  41.67 
 
 
189 aa  87.8  9e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0952022 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5039  superoxide dismutase, Cu-Zn  34.21 
 
 
179 aa  87  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.792086  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3518  superoxide dismutase copper/zinc binding  35.57 
 
 
180 aa  87  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2368  superoxide dismutase Cu-Zn precursor protein  40.5 
 
 
182 aa  86.3  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0422357 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5018  superoxide dismutase, Cu-Zn  36.43 
 
 
165 aa  85.9  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4777  superoxide dismutase, Cu-Zn  36.43 
 
 
179 aa  85.5  4e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4617  superoxide dismutase, Cu-Zn  36.43 
 
 
179 aa  85.5  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4639  superoxide dismutase, Cu-Zn  36.43 
 
 
179 aa  85.5  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5051  superoxide dismutase, Cu-Zn  36.43 
 
 
179 aa  85.5  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5139  superoxide dismutase, Cu-Zn  36.43 
 
 
179 aa  85.5  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2922  superoxide dismutase copper/zinc binding  34.93 
 
 
183 aa  85.1  5e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.719659  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3942  superoxide dismutase copper/zinc binding  39.02 
 
 
212 aa  84.7  7e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379903  normal  0.128954 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03563  superoxide dismutase  35.86 
 
 
200 aa  84.7  8e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4523  superoxide dismutase  39.6 
 
 
510 aa  84  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2345  superoxide dismutase  36.88 
 
 
178 aa  83.6  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0211561  normal  0.0730316 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03561  superoxide dismutase  37.12 
 
 
203 aa  83.2  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0195  superoxide dismutase, Cu-Zn  35 
 
 
179 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3135  superoxide dismutase, copper/zinc binding  35.33 
 
 
191 aa  82.8  0.000000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.310957  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2757  superoxide dismutase, copper/zinc binding  44.14 
 
 
191 aa  82.8  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00492325  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3819  superoxide dismutase copper/zinc binding  35.86 
 
 
179 aa  81.6  0.000000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.130006  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1338  superoxide dismutase, Cu-Zn  36.88 
 
 
172 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2210  superoxide dismutase  36.11 
 
 
173 aa  80.1  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0109092  hitchhiker  0.000454174 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5046  superoxide dismutase, Cu-Zn  33.57 
 
 
179 aa  79.3  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1154  copper/Zinc superoxide dismutase  36.25 
 
 
172 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.744174 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4729  superoxide dismutase copper/zinc binding  33.57 
 
 
179 aa  79.3  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2943  copper/Zinc superoxide dismutase  40.38 
 
 
172 aa  77.8  0.00000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.171551  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08070  superoxide dismutase (Cu-Zn)  33.79 
 
 
158 aa  77  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000475437  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1610  Superoxide dismutase  37.12 
 
 
184 aa  77  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12203  Copper/Zinc superoxide dismutase  30.05 
 
 
194 aa  76.6  0.0000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.348099  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06578  hypothetical protein  36.55 
 
 
170 aa  76.6  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4059  superoxide dismutase copper/zinc binding  33.85 
 
 
214 aa  76.6  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.453641  normal  0.169503 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0733  superoxide dismutase copper/zinc binding  32.64 
 
 
175 aa  75.1  0.0000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000189816  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2022  superoxide dismutase (Cu-Zn)  34.27 
 
 
170 aa  74.3  0.000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3163  superoxide dismutase (Cu-Zn)  36.26 
 
 
174 aa  73.2  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.315078  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3827  superoxide dismutase  34.72 
 
 
173 aa  73.6  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2380  superoxide dismutase copper/zinc binding protein  31.18 
 
 
220 aa  73.2  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2297  superoxide dismutase [Cu-Zn] precursor  37.04 
 
 
162 aa  72.4  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2024  superoxide dismutase, copper/zinc binding  36.55 
 
 
170 aa  72.4  0.000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000023752  hitchhiker  0.00000198076 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1951  superoxide dismutase, copper/zinc binding protein  36.55 
 
 
170 aa  72.4  0.000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0285693  hitchhiker  0.00191784 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2125  superoxide dismutase, copper/zinc binding  36.55 
 
 
170 aa  72.4  0.000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0013475  normal  0.0132534 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2270  superoxide dismutase [Cu-Zn] precursor  37.04 
 
 
162 aa  72  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2653  superoxide dismutase, copper/zinc binding  35.14 
 
 
182 aa  72  0.000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.792961  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1186  superoxide dismutase, Cu-Zn  34.93 
 
 
171 aa  71.6  0.000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3449  superoxide dismutase, copper/zinc binding  32.61 
 
 
180 aa  70.9  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  0.00000937306 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001207  superoxide dismutase [Cu-Zn] precursor  35.76 
 
 
171 aa  70.9  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0703  superoxide dismutase, Cu-Zn  33.33 
 
 
173 aa  70.1  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0659  superoxide dismutase, Cu-Zn  35.86 
 
 
174 aa  69.7  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0817  superoxide dismutase, copper/zinc binding  34.69 
 
 
226 aa  70.5  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.509975  decreased coverage  0.0003056 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0511  superoxide dismutase [Cu-Zn] precursor  33.79 
 
 
170 aa  69.7  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.59112  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0659  superoxide dismutase, Cu-Zn  33.33 
 
 
173 aa  70.1  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0906  superoxide dismutase, Cu/Zn  34.36 
 
 
192 aa  69.7  0.00000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.381444  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4195  superoxide dismutase copper/zinc binding  32.41 
 
 
210 aa  68.9  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0852  superoxide dismutase, copper/zinc binding  37.06 
 
 
183 aa  68.2  0.00000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.260138 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2101  superoxide dismutase copper/zinc binding  34.9 
 
 
174 aa  67.4  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.651227  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03307  superoxide dismutase, Cu-Zn  34.27 
 
 
181 aa  67.4  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00782096  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2297  superoxide dismutase, copper/zinc binding  36.92 
 
 
180 aa  66.6  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.011982  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2485  superoxide dismutase  32.26 
 
 
171 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.841642  normal  0.166633 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3728  superoxide dismutase copper/zinc binding protein  29.41 
 
 
244 aa  66.2  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1200  putative superoxide dismutase  33.53 
 
 
219 aa  65.1  0.0000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1347  superoxide dismutase, copper/zinc binding  31.76 
 
 
183 aa  65.1  0.0000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30470  CU-Zn Superoxide dismutase  35.17 
 
 
180 aa  63.5  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>