149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001207 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013457  VEA_001207  superoxide dismutase [Cu-Zn] precursor  100 
 
 
171 aa  346  7e-95  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1186  superoxide dismutase, Cu-Zn  64.91 
 
 
171 aa  236  1e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06578  hypothetical protein  68.45 
 
 
170 aa  235  3e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0511  superoxide dismutase [Cu-Zn] precursor  63.58 
 
 
170 aa  232  2.0000000000000002e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.59112  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0659  superoxide dismutase, Cu-Zn  58.14 
 
 
174 aa  207  8e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2125  superoxide dismutase, copper/zinc binding  61.73 
 
 
170 aa  196  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0013475  normal  0.0132534 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3638  superoxide dismutase, copper/zinc binding  62.42 
 
 
173 aa  195  3e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1347  superoxide dismutase, copper/zinc binding  58.64 
 
 
183 aa  195  3e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2297  superoxide dismutase, copper/zinc binding  55.56 
 
 
180 aa  194  6e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.011982  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2024  superoxide dismutase, copper/zinc binding  64.67 
 
 
170 aa  193  8.000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000023752  hitchhiker  0.00000198076 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1951  superoxide dismutase, copper/zinc binding protein  64.67 
 
 
170 aa  193  8.000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0285693  hitchhiker  0.00191784 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03307  superoxide dismutase, Cu-Zn  56.71 
 
 
181 aa  193  1e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00782096  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30470  CU-Zn Superoxide dismutase  56.89 
 
 
180 aa  186  2e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2485  superoxide dismutase  59.24 
 
 
171 aa  183  8e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.841642  normal  0.166633 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0397  superoxide dismutase, copper/zinc binding  63.7 
 
 
176 aa  175  3e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3163  superoxide dismutase (Cu-Zn)  57.05 
 
 
174 aa  173  9e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.315078  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0122  superoxide dismutase (Cu/Zn)  55.41 
 
 
179 aa  173  9.999999999999999e-43  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.291157  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1200  putative superoxide dismutase  52.94 
 
 
219 aa  171  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1154  copper/Zinc superoxide dismutase  53.22 
 
 
172 aa  171  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.744174 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1419  copper/zinc superoxide dismutase  52.05 
 
 
177 aa  171  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0294455 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1154  copper/zinc superoxide dismutase  52.05 
 
 
177 aa  171  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1082  copper/zinc superoxide dismutase  52.05 
 
 
177 aa  171  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.302029 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2101  superoxide dismutase copper/zinc binding  51.72 
 
 
174 aa  170  1e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.651227  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0788  copper/zinc superoxide dismutase  54.3 
 
 
178 aa  167  6e-41  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0978  copper/zinc superoxide dismutase  58.27 
 
 
189 aa  167  6e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3315  copper/zinc superoxide dismutase  58.27 
 
 
195 aa  167  8e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.151154  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3445  superoxide dismutase  58.27 
 
 
201 aa  167  8e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0161  copper/zinc superoxide dismutase  53.64 
 
 
178 aa  166  1e-40  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00000919214  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2653  superoxide dismutase, copper/zinc binding  51.92 
 
 
182 aa  165  2.9999999999999998e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.792961  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1338  superoxide dismutase, Cu-Zn  57.14 
 
 
172 aa  164  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2210  superoxide dismutase  58.27 
 
 
173 aa  163  9e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0109092  hitchhiker  0.000454174 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1330  copper/zinc superoxide dismutase  56.34 
 
 
186 aa  158  3e-38  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.236149  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3827  superoxide dismutase  50.29 
 
 
173 aa  154  8e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2022  superoxide dismutase (Cu-Zn)  46.51 
 
 
170 aa  153  1e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1903  superoxide dismutase  48.28 
 
 
173 aa  147  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.292339  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1537  superoxide dismutase  48.28 
 
 
173 aa  147  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.19125  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1550  superoxide dismutase  48.28 
 
 
173 aa  147  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1734  superoxide dismutase  56.12 
 
 
173 aa  147  9e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0827551  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1610  superoxide dismutase  47.7 
 
 
173 aa  145  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.815221 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2358  superoxide dismutase  46.2 
 
 
173 aa  143  1e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000359959  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01616  superoxide dismutase, Cu, Zn  46.2 
 
 
173 aa  143  1e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00181178  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1994  Superoxide dismutase  46.2 
 
 
173 aa  143  1e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000374216  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01606  hypothetical protein  46.2 
 
 
173 aa  143  1e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00112048  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1723  superoxide dismutase  46.2 
 
 
173 aa  143  1e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.335611  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1857  superoxide dismutase  46.2 
 
 
173 aa  143  1e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.195407  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1801  superoxide dismutase  47.4 
 
 
172 aa  142  2e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0159903  normal  0.0303591 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1983  superoxide dismutase  46.2 
 
 
178 aa  142  2e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0141955  hitchhiker  0.00119703 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1552  superoxide dismutase  46.2 
 
 
173 aa  142  2e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0496165  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0703  superoxide dismutase, Cu-Zn  47.95 
 
 
173 aa  142  3e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0659  superoxide dismutase, Cu-Zn  47.95 
 
 
173 aa  142  3e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1838  superoxide dismutase  45.61 
 
 
173 aa  141  3e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.159694  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0982  putative superoxide dismutase  45.83 
 
 
175 aa  140  9.999999999999999e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  decreased coverage  0.000174344  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0538  superoxide dismutase copper/zinc binding  45.81 
 
 
178 aa  138  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0765812  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1507  superoxide dismutase precursor (Cu-Zn)  50.72 
 
 
178 aa  134  5e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.814898  normal  0.841266 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2297  superoxide dismutase [Cu-Zn] precursor  48.18 
 
 
162 aa  121  4e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2270  superoxide dismutase [Cu-Zn] precursor  48.18 
 
 
162 aa  121  4e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2599  superoxide dismutase, copper/zinc binding  39.19 
 
 
239 aa  97.1  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00595972  normal  0.45771 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0906  superoxide dismutase, Cu/Zn  34.86 
 
 
192 aa  84.7  5e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.381444  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3011  superoxide dismutase copper/zinc binding protein  34.43 
 
 
174 aa  84  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2581  superoxide dismutase copper/zinc binding  34.48 
 
 
183 aa  81.3  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.152888  normal  0.324375 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1634  superoxide dismutase, copper/zinc binding  35.26 
 
 
165 aa  78.6  0.00000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.725775 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2177  superoxide dismutase copper/zinc binding  34.48 
 
 
183 aa  78.2  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.462725  normal  0.0481765 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2796  copper/Zinc superoxide dismutase  31.28 
 
 
169 aa  76.6  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.914684 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3449  superoxide dismutase, copper/zinc binding  32.08 
 
 
180 aa  76.6  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  0.00000937306 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3343  superoxide dismutase copper/zinc binding protein  33.89 
 
 
210 aa  75.5  0.0000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0409606 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3067  Superoxide dismutase  34.81 
 
 
175 aa  75.9  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00079657 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2865  superoxide dismutase copper/zinc binding  32.57 
 
 
172 aa  75.1  0.0000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2368  superoxide dismutase Cu-Zn precursor protein  35.26 
 
 
182 aa  74.3  0.0000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0422357 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4761  superoxide dismutase, copper/zinc binding  30.32 
 
 
179 aa  74.3  0.0000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.271734  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1880  superoxide dismutase copper/zinc binding  32.32 
 
 
175 aa  73.9  0.0000000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4059  superoxide dismutase copper/zinc binding  34.84 
 
 
214 aa  73.9  0.0000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.453641  normal  0.169503 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2057  superoxide dismutase, copper/zinc binding  32.52 
 
 
175 aa  73.2  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0494601  normal  0.319354 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4338  copper/Zinc superoxide dismutase  31.69 
 
 
180 aa  72  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3554  superoxide dismutase  30.86 
 
 
171 aa  72.4  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642978  normal  0.247145 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3597  superoxide dismutase, copper/zinc binding  34.27 
 
 
169 aa  72.4  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.592346  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4523  superoxide dismutase  34.07 
 
 
510 aa  72  0.000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2872  superoxide dismutase copper/zinc binding  31.97 
 
 
169 aa  72  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0217452 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1610  Superoxide dismutase  32.85 
 
 
184 aa  70.9  0.000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3135  superoxide dismutase, copper/zinc binding  34.38 
 
 
191 aa  70.1  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.310957  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0454  superoxide dismutase, copper/zinc binding  35.76 
 
 
190 aa  70.5  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.101401  normal  0.041937 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1980  superoxide dismutase, copper/zinc binding  32.91 
 
 
183 aa  68.6  0.00000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0783595 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0124  superoxide dismutase copper/zinc binding  35.09 
 
 
189 aa  68.2  0.00000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0952022 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0488  superoxide dismutase, copper/zinc binding  34.97 
 
 
172 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4681  Superoxide dismutase  28.03 
 
 
208 aa  67  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.179058 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2943  copper/Zinc superoxide dismutase  31.88 
 
 
172 aa  66.2  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.171551  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1796  putative copper/Zinc superoxide dismutase  35.46 
 
 
185 aa  66.2  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.749298  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0442  superoxide dismutase, copper/zinc binding  35.46 
 
 
185 aa  66.2  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.039325  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4070  superoxide dismutase copper/zinc binding  33.79 
 
 
171 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.273253  normal  0.944661 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0122  superoxide dismutase copper/zinc binding  31.79 
 
 
179 aa  65.9  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.542638  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1009  superoxide dismutase copper/zinc binding  34.62 
 
 
171 aa  66.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.814161 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3711  superoxide dismutase copper/zinc binding  30.82 
 
 
180 aa  66.2  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3728  superoxide dismutase copper/zinc binding protein  32.93 
 
 
244 aa  65.9  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1782  copper/Zinc superoxide dismutase  34.87 
 
 
156 aa  65.9  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1161  superoxide dismutase copper/zinc binding  34.62 
 
 
171 aa  65.9  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.552065  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3942  superoxide dismutase copper/zinc binding  33.96 
 
 
212 aa  65.5  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379903  normal  0.128954 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0224  superoxide dismutase copper/zinc binding  33.57 
 
 
172 aa  65.1  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.504945  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12203  Copper/Zinc superoxide dismutase  28.35 
 
 
194 aa  64.7  0.0000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.348099  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1626  superoxide dismutase, copper/zinc binding  31.85 
 
 
177 aa  64.3  0.0000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1900  superoxide dismutase, copper/zinc binding  30.29 
 
 
185 aa  63.5  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.370601  normal  0.24871 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4310  superoxide dismutase copper/zinc binding  37.9 
 
 
201 aa  63.9  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.366806  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>