166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2872 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_2872  superoxide dismutase copper/zinc binding  100 
 
 
169 aa  332  1e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0217452 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0122  superoxide dismutase copper/zinc binding  53.69 
 
 
179 aa  166  1e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.542638  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1561  superoxide dismutase copper/zinc binding  50.58 
 
 
172 aa  164  5e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.639151  normal  0.731272 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1699  superoxide dismutase copper/zinc binding  50.67 
 
 
176 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000210654  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3819  superoxide dismutase copper/zinc binding  49.04 
 
 
179 aa  143  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.130006  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3011  superoxide dismutase copper/zinc binding protein  48.32 
 
 
174 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3518  superoxide dismutase copper/zinc binding  46.53 
 
 
180 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3220  superoxide dismutase, copper/zinc binding  43.68 
 
 
173 aa  134  6.0000000000000005e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2865  superoxide dismutase copper/zinc binding  43.71 
 
 
172 aa  132  3e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4679  superoxide dismutase copper/zinc binding  47.89 
 
 
201 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.841473 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4310  superoxide dismutase copper/zinc binding  47.89 
 
 
201 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.366806  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3067  Superoxide dismutase  43.35 
 
 
175 aa  128  4.0000000000000003e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00079657 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5039  superoxide dismutase, Cu-Zn  39.64 
 
 
179 aa  122  3e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.792086  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4827  superoxide dismutase copper/zinc binding  46.48 
 
 
201 aa  122  3e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.661461  normal  0.600787 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2922  superoxide dismutase copper/zinc binding  48.99 
 
 
183 aa  122  3e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.719659  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2378  superoxide dismutase copper/zinc binding  47.18 
 
 
177 aa  121  5e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4729  superoxide dismutase copper/zinc binding  42.36 
 
 
179 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5046  superoxide dismutase, Cu-Zn  41.67 
 
 
179 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4777  superoxide dismutase, Cu-Zn  43.06 
 
 
179 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4617  superoxide dismutase, Cu-Zn  43.06 
 
 
179 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4639  superoxide dismutase, Cu-Zn  43.06 
 
 
179 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5139  superoxide dismutase, Cu-Zn  43.06 
 
 
179 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5018  superoxide dismutase, Cu-Zn  43.06 
 
 
165 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5051  superoxide dismutase, Cu-Zn  43.06 
 
 
179 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0195  superoxide dismutase, Cu-Zn  39.05 
 
 
179 aa  119  3e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2345  superoxide dismutase  40.35 
 
 
178 aa  118  3e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0211561  normal  0.0730316 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2833  superoxide dismutase copper/zinc binding  42.68 
 
 
177 aa  117  6e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0916793  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4070  superoxide dismutase copper/zinc binding  45.83 
 
 
171 aa  117  7.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.273253  normal  0.944661 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2796  copper/Zinc superoxide dismutase  40.61 
 
 
169 aa  113  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.914684 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3135  superoxide dismutase, copper/zinc binding  40.8 
 
 
191 aa  113  1.0000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.310957  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0488  superoxide dismutase, copper/zinc binding  39.87 
 
 
172 aa  112  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1634  superoxide dismutase, copper/zinc binding  38.29 
 
 
165 aa  109  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.725775 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3597  superoxide dismutase, copper/zinc binding  41.18 
 
 
169 aa  108  3e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.592346  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0224  superoxide dismutase copper/zinc binding  42.2 
 
 
172 aa  108  3e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.504945  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0442  superoxide dismutase, copper/zinc binding  39.6 
 
 
185 aa  105  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.039325  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1796  putative copper/Zinc superoxide dismutase  38.93 
 
 
185 aa  105  4e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.749298  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0817  superoxide dismutase, copper/zinc binding  42.28 
 
 
226 aa  103  8e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.509975  decreased coverage  0.0003056 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2943  copper/Zinc superoxide dismutase  40.61 
 
 
172 aa  103  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.171551  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4338  copper/Zinc superoxide dismutase  42.96 
 
 
180 aa  100  9e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1782  copper/Zinc superoxide dismutase  44.83 
 
 
156 aa  99.8  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3449  superoxide dismutase, copper/zinc binding  41.61 
 
 
180 aa  98.6  4e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  0.00000937306 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4681  Superoxide dismutase  39.6 
 
 
208 aa  98.2  5e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.179058 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0454  superoxide dismutase, copper/zinc binding  36.49 
 
 
190 aa  96.7  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.101401  normal  0.041937 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1610  Superoxide dismutase  40.54 
 
 
184 aa  94.7  6e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1161  superoxide dismutase copper/zinc binding  39.35 
 
 
171 aa  94.4  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.552065  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0702  superoxide dismutase copper/zinc binding  39.19 
 
 
172 aa  94.4  7e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.123655  normal  0.846065 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1009  superoxide dismutase copper/zinc binding  39.87 
 
 
171 aa  94  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.814161 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1626  superoxide dismutase, copper/zinc binding  36.72 
 
 
177 aa  92.8  2e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3554  superoxide dismutase  36.46 
 
 
171 aa  90.9  9e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642978  normal  0.247145 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1880  superoxide dismutase copper/zinc binding  39.24 
 
 
175 aa  90.1  1e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1200  putative superoxide dismutase  35.48 
 
 
219 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2057  superoxide dismutase, copper/zinc binding  39.61 
 
 
175 aa  88.2  4e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0494601  normal  0.319354 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0125  superoxide dismutase copper/zinc binding  45 
 
 
206 aa  88.2  5e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.100957 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3942  superoxide dismutase copper/zinc binding  36.88 
 
 
212 aa  88.2  5e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379903  normal  0.128954 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2599  superoxide dismutase, copper/zinc binding  36.48 
 
 
239 aa  87.4  8e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00595972  normal  0.45771 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2757  superoxide dismutase, copper/zinc binding  43.48 
 
 
191 aa  87  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00492325  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03561  superoxide dismutase  42.74 
 
 
203 aa  85.9  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1347  superoxide dismutase, copper/zinc binding  33.52 
 
 
183 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1082  copper/zinc superoxide dismutase  34.41 
 
 
177 aa  85.1  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.302029 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1154  copper/zinc superoxide dismutase  34.41 
 
 
177 aa  85.1  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1419  copper/zinc superoxide dismutase  34.41 
 
 
177 aa  85.1  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0294455 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2368  superoxide dismutase Cu-Zn precursor protein  37.89 
 
 
182 aa  84.3  6e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0422357 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0703  superoxide dismutase, Cu-Zn  33.15 
 
 
173 aa  84  8e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0659  superoxide dismutase, Cu-Zn  33.15 
 
 
173 aa  84  8e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2125  superoxide dismutase, copper/zinc binding  35.57 
 
 
170 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0013475  normal  0.0132534 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4523  superoxide dismutase  35.76 
 
 
510 aa  82.4  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0852  superoxide dismutase, copper/zinc binding  43.57 
 
 
183 aa  83.2  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.260138 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0978  copper/zinc superoxide dismutase  33.5 
 
 
189 aa  82.8  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2024  superoxide dismutase, copper/zinc binding  36.67 
 
 
170 aa  82  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000023752  hitchhiker  0.00000198076 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1951  superoxide dismutase, copper/zinc binding protein  36.67 
 
 
170 aa  82  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0285693  hitchhiker  0.00191784 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0124  superoxide dismutase copper/zinc binding  38.97 
 
 
189 aa  82.4  0.000000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0952022 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3445  superoxide dismutase  35.67 
 
 
201 aa  82.4  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3315  copper/zinc superoxide dismutase  35.9 
 
 
195 aa  82.4  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.151154  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06578  hypothetical protein  32.96 
 
 
170 aa  81.6  0.000000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2485  superoxide dismutase  32.78 
 
 
171 aa  81.3  0.000000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.841642  normal  0.166633 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0659  superoxide dismutase, Cu-Zn  34.83 
 
 
174 aa  80.9  0.000000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3163  superoxide dismutase (Cu-Zn)  34.48 
 
 
174 aa  80.9  0.000000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.315078  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2101  superoxide dismutase copper/zinc binding  32.97 
 
 
174 aa  80.9  0.000000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.651227  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2380  superoxide dismutase copper/zinc binding protein  34.1 
 
 
220 aa  80.5  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7975  Cu/Zn superoxide dismutase-like protein  32.16 
 
 
226 aa  79.3  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102706  normal  0.114926 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2022  superoxide dismutase (Cu-Zn)  33.15 
 
 
170 aa  79.3  0.00000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4761  superoxide dismutase, copper/zinc binding  31.95 
 
 
179 aa  77.4  0.00000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.271734  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2177  superoxide dismutase copper/zinc binding  32.07 
 
 
183 aa  77  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.462725  normal  0.0481765 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0906  superoxide dismutase, Cu/Zn  35.8 
 
 
192 aa  77  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.381444  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2653  superoxide dismutase, copper/zinc binding  37.16 
 
 
182 aa  77  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.792961  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3638  superoxide dismutase, copper/zinc binding  33.76 
 
 
173 aa  77  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30470  CU-Zn Superoxide dismutase  33.15 
 
 
180 aa  76.6  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0161  copper/zinc superoxide dismutase  32.24 
 
 
178 aa  75.9  0.0000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00000919214  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2297  superoxide dismutase [Cu-Zn] precursor  32.14 
 
 
162 aa  75.5  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2581  superoxide dismutase copper/zinc binding  32.8 
 
 
183 aa  75.5  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.152888  normal  0.324375 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2297  superoxide dismutase, copper/zinc binding  32.39 
 
 
180 aa  74.7  0.0000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.011982  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2270  superoxide dismutase [Cu-Zn] precursor  34.53 
 
 
162 aa  74.7  0.0000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12203  Copper/Zinc superoxide dismutase  29.95 
 
 
194 aa  73.9  0.0000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.348099  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1507  superoxide dismutase precursor (Cu-Zn)  33.7 
 
 
178 aa  73.9  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.814898  normal  0.841266 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001207  superoxide dismutase [Cu-Zn] precursor  29.55 
 
 
171 aa  73.6  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08070  superoxide dismutase (Cu-Zn)  32.67 
 
 
158 aa  73.6  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000475437  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3827  superoxide dismutase  30.6 
 
 
173 aa  73.9  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3711  superoxide dismutase copper/zinc binding  37.23 
 
 
180 aa  73.2  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0788  copper/zinc superoxide dismutase  31.33 
 
 
178 aa  72.8  0.000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0511  superoxide dismutase [Cu-Zn] precursor  31.98 
 
 
170 aa  72  0.000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.59112  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>