145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_4679 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_4679  superoxide dismutase copper/zinc binding  100 
 
 		 201 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.841473 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4310  superoxide dismutase copper/zinc binding  99.5 
 
 		 201 aa  404  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.366806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4827  superoxide dismutase copper/zinc binding  91.54 
 
 		 201 aa  356  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.661461  normal  0.600787 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2833  superoxide dismutase copper/zinc binding  75.62 
 
 		 177 aa  254  5e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0916793  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2378  superoxide dismutase copper/zinc binding  73.75 
 
 		 177 aa  247  9e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3819  superoxide dismutase copper/zinc binding  75.32 
 
 		 179 aa  240  1e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.130006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2922  superoxide dismutase copper/zinc binding  66.94 
 
 		 183 aa  173  1.9999999999999998e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.719659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0122  superoxide dismutase copper/zinc binding  57.04 
 
 		 179 aa  153  2e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.542638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1561  superoxide dismutase copper/zinc binding  48.08 
 
 		 172 aa  134  9.999999999999999e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.639151  normal  0.731272 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1699  superoxide dismutase copper/zinc binding  46.94 
 
 		 176 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000210654  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2872  superoxide dismutase copper/zinc binding  47.89 
 
 		 169 aa  127  9.000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0217452 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2865  superoxide dismutase copper/zinc binding  41.33 
 
 		 172 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3011  superoxide dismutase copper/zinc binding protein  40.76 
 
 		 174 aa  112  5e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4729  superoxide dismutase copper/zinc binding  39.47 
 
 		 179 aa  111  8.000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5039  superoxide dismutase, Cu-Zn  38.82 
 
 		 179 aa  109  3e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.792086  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0195  superoxide dismutase, Cu-Zn  38.82 
 
 		 179 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5046  superoxide dismutase, Cu-Zn  38.82 
 
 		 179 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4777  superoxide dismutase, Cu-Zn  37.5 
 
 		 179 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4617  superoxide dismutase, Cu-Zn  37.5 
 
 		 179 aa  107  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4639  superoxide dismutase, Cu-Zn  37.5 
 
 		 179 aa  107  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5139  superoxide dismutase, Cu-Zn  37.5 
 
 		 179 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5051  superoxide dismutase, Cu-Zn  37.5 
 
 		 179 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5018  superoxide dismutase, Cu-Zn  37.5 
 
 		 165 aa  106  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3518  superoxide dismutase copper/zinc binding  37.91 
 
 		 180 aa  104  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3220  superoxide dismutase, copper/zinc binding  36.55 
 
 		 173 aa  99.4  4e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0488  superoxide dismutase, copper/zinc binding  36.6 
 
 		 172 aa  98.2  8e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1796  putative copper/Zinc superoxide dismutase  35.63 
 
 		 185 aa  97.4  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.749298  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3135  superoxide dismutase, copper/zinc binding  32.14 
 
 		 191 aa  97.1  1e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.310957  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0442  superoxide dismutase, copper/zinc binding  35.63 
 
 		 185 aa  96.3  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.039325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2796  copper/Zinc superoxide dismutase  32.92 
 
 		 169 aa  93.2  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.914684 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0224  superoxide dismutase copper/zinc binding  36.3 
 
 		 172 aa  93.2  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.504945  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4070  superoxide dismutase copper/zinc binding  41.8 
 
 		 171 aa  92.8  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.273253  normal  0.944661 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1782  copper/Zinc superoxide dismutase  38.19 
 
 		 156 aa  92.4  4e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0454  superoxide dismutase, copper/zinc binding  35.84 
 
 		 190 aa  92  5e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.101401  normal  0.041937 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2345  superoxide dismutase  37.86 
 
 		 178 aa  88.6  5e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0211561  normal  0.0730316 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0702  superoxide dismutase copper/zinc binding  39.44 
 
 		 172 aa  88.6  6e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.123655  normal  0.846065 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1161  superoxide dismutase copper/zinc binding  37.01 
 
 		 171 aa  87  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.552065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1009  superoxide dismutase copper/zinc binding  37.01 
 
 		 171 aa  86.3  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.814161 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3067  Superoxide dismutase  39.67 
 
 		 175 aa  85.5  4e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00079657 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1634  superoxide dismutase, copper/zinc binding  38.4 
 
 		 165 aa  85.5  5e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.725775 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3597  superoxide dismutase, copper/zinc binding  33.33 
 
 		 169 aa  84  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.592346  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0817  superoxide dismutase, copper/zinc binding  37.5 
 
 		 226 aa  78.2  0.00000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.509975  decreased coverage  0.0003056 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2943  copper/Zinc superoxide dismutase  38.84 
 
 		 172 aa  77  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.171551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4681  Superoxide dismutase  37.41 
 
 		 208 aa  77  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.179058 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2057  superoxide dismutase, copper/zinc binding  39.17 
 
 		 175 aa  73.6  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0494601  normal  0.319354 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1880  superoxide dismutase copper/zinc binding  39.17 
 
 		 175 aa  73.2  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0125  superoxide dismutase copper/zinc binding  39.02 
 
 		 206 aa  73.9  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.100957 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1610  Superoxide dismutase  41.32 
 
 		 184 aa  73.2  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0124  superoxide dismutase copper/zinc binding  38.6 
 
 		 189 aa  72.4  0.000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0952022 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7975  Cu/Zn superoxide dismutase-like protein  32.34 
 
 		 226 aa  72  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102706  normal  0.114926 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1347  superoxide dismutase, copper/zinc binding  33.33 
 
 		 183 aa  71.6  0.000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3711  superoxide dismutase copper/zinc binding  35.83 
 
 		 180 aa  70.1  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30470  CU-Zn Superoxide dismutase  35.29 
 
 		 180 aa  70.1  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03561  superoxide dismutase  37.7 
 
 		 203 aa  70.1  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1186  superoxide dismutase, Cu-Zn  34.48 
 
 		 171 aa  69.3  0.00000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03563  superoxide dismutase  38.02 
 
 		 200 aa  68.9  0.00000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0852  superoxide dismutase, copper/zinc binding  35.42 
 
 		 183 aa  68.9  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.260138 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12203  Copper/Zinc superoxide dismutase  31.95 
 
 		 194 aa  67.8  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.348099  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3163  superoxide dismutase (Cu-Zn)  34.91 
 
 		 174 aa  67.4  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.315078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4338  copper/Zinc superoxide dismutase  35.07 
 
 		 180 aa  67  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1801  superoxide dismutase  35.95 
 
 		 172 aa  66.6  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0159903  normal  0.0303591 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4761  superoxide dismutase, copper/zinc binding  26.15 
 
 		 179 aa  66.6  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.271734  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3827  superoxide dismutase  31.85 
 
 		 173 aa  67.4  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3942  superoxide dismutase copper/zinc binding  35.25 
 
 		 212 aa  66.6  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379903  normal  0.128954 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2125  superoxide dismutase, copper/zinc binding  33.56 
 
 		 170 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0013475  normal  0.0132534 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0659  superoxide dismutase, Cu-Zn  33.99 
 
 		 174 aa  65.9  0.0000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3554  superoxide dismutase  34.81 
 
 		 171 aa  65.9  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642978  normal  0.247145 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2297  superoxide dismutase, copper/zinc binding  33.79 
 
 		 180 aa  65.9  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.011982  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2024  superoxide dismutase, copper/zinc binding  33.78 
 
 		 170 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000023752  hitchhiker  0.00000198076 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1951  superoxide dismutase, copper/zinc binding protein  33.78 
 
 		 170 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0285693  hitchhiker  0.00191784 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06578  hypothetical protein  35.62 
 
 		 170 aa  65.9  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1900  superoxide dismutase, copper/zinc binding  30.16 
 
 		 185 aa  65.5  0.0000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.370601  normal  0.24871 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2653  superoxide dismutase, copper/zinc binding  32.48 
 
 		 182 aa  65.1  0.0000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.792961  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2485  superoxide dismutase  32.52 
 
 		 171 aa  65.1  0.0000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.841642  normal  0.166633 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1980  superoxide dismutase, copper/zinc binding  34.03 
 
 		 183 aa  64.7  0.0000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0783595 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2022  superoxide dismutase (Cu-Zn)  33.55 
 
 		 170 aa  64.7  0.0000000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001207  superoxide dismutase [Cu-Zn] precursor  37.9 
 
 		 171 aa  63.9  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0161  copper/zinc superoxide dismutase  37.61 
 
 		 178 aa  63.9  0.000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00000919214  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3343  superoxide dismutase copper/zinc binding protein  28.4 
 
 		 210 aa  64.3  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0409606 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0703  superoxide dismutase, Cu-Zn  31.74 
 
 		 173 aa  63.5  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2380  superoxide dismutase copper/zinc binding protein  30.77 
 
 		 220 aa  63.5  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0659  superoxide dismutase, Cu-Zn  31.74 
 
 		 173 aa  63.5  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3638  superoxide dismutase, copper/zinc binding  32.08 
 
 		 173 aa  63.2  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3449  superoxide dismutase, copper/zinc binding  36.13 
 
 		 180 aa  62.4  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000937306 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2581  superoxide dismutase copper/zinc binding  33.51 
 
 		 183 aa  62.4  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.152888  normal  0.324375 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1507  superoxide dismutase precursor (Cu-Zn)  31.29 
 
 		 178 aa  62.4  0.000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.814898  normal  0.841266 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1200  putative superoxide dismutase  32.67 
 
 		 219 aa  62.4  0.000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2767  superoxide dismutase copper/zinc binding protein  28.9 
 
 		 204 aa  61.6  0.000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.238721 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1838  superoxide dismutase  35.06 
 
 		 173 aa  61.2  0.000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.159694  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01616  superoxide dismutase, Cu, Zn  33.99 
 
 		 173 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00181178  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1994  Superoxide dismutase  33.99 
 
 		 173 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000374216  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2757  superoxide dismutase, copper/zinc binding  36.61 
 
 		 191 aa  60.8  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00492325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2358  superoxide dismutase  33.99 
 
 		 173 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000359959  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01606  hypothetical protein  33.99 
 
 		 173 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00112048  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1723  superoxide dismutase  33.99 
 
 		 173 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.335611  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1857  superoxide dismutase  33.99 
 
 		 173 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.195407  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2177  superoxide dismutase copper/zinc binding  32.6 
 
 		 183 aa  60.8  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.462725  normal  0.0481765 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1983  superoxide dismutase  33.99 
 
 		 178 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0141955  hitchhiker  0.00119703 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1552  superoxide dismutase  33.33 
 
 		 173 aa  60.5  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0496165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1626  superoxide dismutase, copper/zinc binding  33.93 
 
 		 177 aa  60.5  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>