162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2345 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2345  superoxide dismutase  100 
 
 
178 aa  360  7.0000000000000005e-99  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0211561  normal  0.0730316 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4070  superoxide dismutase copper/zinc binding  57.05 
 
 
171 aa  168  3e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.273253  normal  0.944661 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3067  Superoxide dismutase  49.09 
 
 
175 aa  158  5e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00079657 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3011  superoxide dismutase copper/zinc binding protein  46.15 
 
 
174 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2865  superoxide dismutase copper/zinc binding  44.83 
 
 
172 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0488  superoxide dismutase, copper/zinc binding  47.37 
 
 
172 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3518  superoxide dismutase copper/zinc binding  40.35 
 
 
180 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3135  superoxide dismutase, copper/zinc binding  42.26 
 
 
191 aa  125  2.0000000000000002e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.310957  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0224  superoxide dismutase copper/zinc binding  48.61 
 
 
172 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.504945  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4777  superoxide dismutase, Cu-Zn  41.28 
 
 
179 aa  125  3e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4617  superoxide dismutase, Cu-Zn  41.28 
 
 
179 aa  125  3e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4639  superoxide dismutase, Cu-Zn  41.28 
 
 
179 aa  125  3e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5139  superoxide dismutase, Cu-Zn  41.28 
 
 
179 aa  125  3e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1782  copper/Zinc superoxide dismutase  46.53 
 
 
156 aa  125  3e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5051  superoxide dismutase, Cu-Zn  41.28 
 
 
179 aa  125  3e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4729  superoxide dismutase copper/zinc binding  40.7 
 
 
179 aa  125  3e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5039  superoxide dismutase, Cu-Zn  38.82 
 
 
179 aa  124  6e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.792086  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5046  superoxide dismutase, Cu-Zn  40.7 
 
 
179 aa  124  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0195  superoxide dismutase, Cu-Zn  40.12 
 
 
179 aa  122  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5018  superoxide dismutase, Cu-Zn  46.81 
 
 
165 aa  122  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4681  Superoxide dismutase  42.86 
 
 
208 aa  121  5e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.179058 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0122  superoxide dismutase copper/zinc binding  45.03 
 
 
179 aa  120  8e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.542638  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0817  superoxide dismutase, copper/zinc binding  43.54 
 
 
226 aa  118  4.9999999999999996e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.509975  decreased coverage  0.0003056 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2796  copper/Zinc superoxide dismutase  40.83 
 
 
169 aa  117  7.999999999999999e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.914684 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3220  superoxide dismutase, copper/zinc binding  42.44 
 
 
173 aa  114  6e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0852  superoxide dismutase, copper/zinc binding  45.77 
 
 
183 aa  113  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.260138 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3597  superoxide dismutase, copper/zinc binding  43.92 
 
 
169 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.592346  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2177  superoxide dismutase copper/zinc binding  37.36 
 
 
183 aa  110  8.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.462725  normal  0.0481765 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2872  superoxide dismutase copper/zinc binding  41.38 
 
 
169 aa  110  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0217452 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2581  superoxide dismutase copper/zinc binding  41.89 
 
 
183 aa  108  3e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.152888  normal  0.324375 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7975  Cu/Zn superoxide dismutase-like protein  40.83 
 
 
226 aa  108  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102706  normal  0.114926 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2599  superoxide dismutase, copper/zinc binding  41.88 
 
 
239 aa  108  5e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00595972  normal  0.45771 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1610  Superoxide dismutase  41.78 
 
 
184 aa  108  5e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3942  superoxide dismutase copper/zinc binding  38.93 
 
 
212 aa  107  7.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379903  normal  0.128954 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3449  superoxide dismutase, copper/zinc binding  41.78 
 
 
180 aa  105  3e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  0.00000937306 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3554  superoxide dismutase  38.55 
 
 
171 aa  105  4e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642978  normal  0.247145 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2943  copper/Zinc superoxide dismutase  38.93 
 
 
172 aa  102  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.171551  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4523  superoxide dismutase  38.75 
 
 
510 aa  102  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1561  superoxide dismutase copper/zinc binding  36.05 
 
 
172 aa  101  6e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.639151  normal  0.731272 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1880  superoxide dismutase copper/zinc binding  39.75 
 
 
175 aa  101  7e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1699  superoxide dismutase copper/zinc binding  40.79 
 
 
176 aa  100  9e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000210654  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1161  superoxide dismutase copper/zinc binding  40.38 
 
 
171 aa  100  9e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.552065  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1009  superoxide dismutase copper/zinc binding  40.38 
 
 
171 aa  100  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.814161 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0906  superoxide dismutase, Cu/Zn  40.94 
 
 
192 aa  99.4  2e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.381444  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2757  superoxide dismutase, copper/zinc binding  45.59 
 
 
191 aa  100  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00492325  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2057  superoxide dismutase, copper/zinc binding  39.74 
 
 
175 aa  99.8  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0494601  normal  0.319354 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3819  superoxide dismutase copper/zinc binding  38.71 
 
 
179 aa  99.4  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.130006  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1634  superoxide dismutase, copper/zinc binding  42.57 
 
 
165 aa  99.4  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.725775 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4338  copper/Zinc superoxide dismutase  40.44 
 
 
180 aa  98.6  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2368  superoxide dismutase Cu-Zn precursor protein  40.26 
 
 
182 aa  98.2  6e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0422357 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2767  superoxide dismutase copper/zinc binding protein  36.57 
 
 
204 aa  93.6  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.238721 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4761  superoxide dismutase, copper/zinc binding  33.9 
 
 
179 aa  93.2  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.271734  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1626  superoxide dismutase, copper/zinc binding  32.2 
 
 
177 aa  92.4  3e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2833  superoxide dismutase copper/zinc binding  38.56 
 
 
177 aa  91.3  7e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0916793  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0125  superoxide dismutase copper/zinc binding  40.85 
 
 
206 aa  90.5  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.100957 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0442  superoxide dismutase, copper/zinc binding  39.46 
 
 
185 aa  90.1  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.039325  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2380  superoxide dismutase copper/zinc binding protein  37.65 
 
 
220 aa  90.1  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4059  superoxide dismutase copper/zinc binding  36.36 
 
 
214 aa  90.5  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.453641  normal  0.169503 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1796  putative copper/Zinc superoxide dismutase  38.78 
 
 
185 aa  89  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.749298  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4679  superoxide dismutase copper/zinc binding  37.86 
 
 
201 aa  88.2  6e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.841473 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4310  superoxide dismutase copper/zinc binding  37.86 
 
 
201 aa  88.2  6e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.366806  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2378  superoxide dismutase copper/zinc binding  38.57 
 
 
177 aa  86.3  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03561  superoxide dismutase  37.67 
 
 
203 aa  85.9  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3711  superoxide dismutase copper/zinc binding  41.13 
 
 
180 aa  86.7  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12203  Copper/Zinc superoxide dismutase  36.13 
 
 
194 aa  86.3  2e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.348099  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0124  superoxide dismutase copper/zinc binding  38.71 
 
 
189 aa  84.3  8e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0952022 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0454  superoxide dismutase, copper/zinc binding  36.48 
 
 
190 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.101401  normal  0.041937 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4827  superoxide dismutase copper/zinc binding  37.14 
 
 
201 aa  81.3  0.000000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.661461  normal  0.600787 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0702  superoxide dismutase copper/zinc binding  37.59 
 
 
172 aa  79.3  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.123655  normal  0.846065 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2922  superoxide dismutase copper/zinc binding  43.64 
 
 
183 aa  79.3  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.719659  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0664  superoxide dismutase copper/zinc binding protein  38.51 
 
 
218 aa  77.8  0.00000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4195  superoxide dismutase copper/zinc binding  42.61 
 
 
210 aa  77.8  0.00000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1900  superoxide dismutase, copper/zinc binding  34.88 
 
 
185 aa  77  0.0000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.370601  normal  0.24871 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3343  superoxide dismutase copper/zinc binding protein  31.52 
 
 
210 aa  77.4  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0409606 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03563  superoxide dismutase  34 
 
 
200 aa  76.6  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1980  superoxide dismutase, copper/zinc binding  36.57 
 
 
183 aa  76.6  0.0000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0783595 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1200  putative superoxide dismutase  33.16 
 
 
219 aa  73.2  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3827  superoxide dismutase  29.38 
 
 
173 aa  72.8  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0511  superoxide dismutase [Cu-Zn] precursor  33.91 
 
 
170 aa  72.4  0.000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.59112  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0735  superoxide dismutase, copper/zinc binding  35.03 
 
 
235 aa  72  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1186  superoxide dismutase, Cu-Zn  33.14 
 
 
171 aa  71.2  0.000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2022  superoxide dismutase (Cu-Zn)  34.25 
 
 
170 aa  70.9  0.000000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0703  superoxide dismutase, Cu-Zn  31.84 
 
 
173 aa  70.5  0.00000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0659  superoxide dismutase, Cu-Zn  31.84 
 
 
173 aa  70.5  0.00000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08070  superoxide dismutase (Cu-Zn)  38.6 
 
 
158 aa  70.1  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000475437  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3728  superoxide dismutase copper/zinc binding protein  33.33 
 
 
244 aa  70.1  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1347  superoxide dismutase, copper/zinc binding  30.17 
 
 
183 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2125  superoxide dismutase, copper/zinc binding  32.26 
 
 
170 aa  68.9  0.00000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0013475  normal  0.0132534 
 
 
-
 
NC_006686  CND01490  copper zinc superoxide dismutase  35.03 
 
 
154 aa  68.6  0.00000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.452302  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06578  hypothetical protein  33.15 
 
 
170 aa  68.2  0.00000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0733  superoxide dismutase copper/zinc binding  32.3 
 
 
175 aa  67.8  0.00000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000189816  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0572  superoxide dismutase, copper/zinc binding protein  32.4 
 
 
228 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0584  superoxide dismutase, copper/zinc binding  32.4 
 
 
228 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.327335  hitchhiker  0.00792141 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0562  superoxide dismutase, copper/zinc binding  32.4 
 
 
228 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.751022 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3163  superoxide dismutase (Cu-Zn)  31.84 
 
 
174 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.315078  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00241  Superoxide dismutase [Cu-Zn] (EC 1.15.1.1) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q9HEY7]  39.66 
 
 
154 aa  65.9  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2024  superoxide dismutase, copper/zinc binding  35.37 
 
 
170 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000023752  hitchhiker  0.00000198076 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1951  superoxide dismutase, copper/zinc binding protein  35.37 
 
 
170 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0285693  hitchhiker  0.00191784 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2485  superoxide dismutase  29.12 
 
 
171 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.841642  normal  0.166633 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10437  periplasmic superoxide dismutase [Cu-Zn] sodC  31.75 
 
 
240 aa  65.9  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0336347  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>