162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A1903 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A1903  superoxide dismutase  100 
 
 		 173 aa  347  3e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.292339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1537  superoxide dismutase  99.42 
 
 		 173 aa  345  1e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.19125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1550  superoxide dismutase  99.42 
 
 		 173 aa  345  1e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1610  superoxide dismutase  99.42 
 
 		 173 aa  345  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.815221 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1734  superoxide dismutase  98.84 
 
 		 173 aa  343  8e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0827551  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1552  superoxide dismutase  83.24 
 
 		 173 aa  295  1e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0496165  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01616  superoxide dismutase, Cu, Zn  82.66 
 
 		 173 aa  295  2e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00181178  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1994  Superoxide dismutase  82.66 
 
 		 173 aa  295  2e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000374216  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01606  hypothetical protein  82.66 
 
 		 173 aa  295  2e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00112048  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2358  superoxide dismutase  82.66 
 
 		 173 aa  295  2e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000359959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1723  superoxide dismutase  82.66 
 
 		 173 aa  295  2e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.335611  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1857  superoxide dismutase  82.66 
 
 		 173 aa  295  2e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.195407  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1983  superoxide dismutase  82.66 
 
 		 178 aa  294  4e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0141955  hitchhiker  0.00119703 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1838  superoxide dismutase  82.08 
 
 		 173 aa  293  6e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.159694  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1801  superoxide dismutase  79.65 
 
 		 172 aa  281  5.000000000000001e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0159903  normal  0.0303591 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2210  superoxide dismutase  65.32 
 
 		 173 aa  234  5.0000000000000005e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0109092  hitchhiker  0.000454174 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1082  copper/zinc superoxide dismutase  58.48 
 
 		 177 aa  199  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.302029 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1154  copper/zinc superoxide dismutase  58.48 
 
 		 177 aa  199  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1419  copper/zinc superoxide dismutase  58.48 
 
 		 177 aa  199  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0294455 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3827  superoxide dismutase  56.07 
 
 		 173 aa  197  6e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1154  copper/Zinc superoxide dismutase  63.06 
 
 		 172 aa  197  7e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.744174 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2101  superoxide dismutase copper/zinc binding  59.77 
 
 		 174 aa  195  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.651227  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3315  copper/zinc superoxide dismutase  65.81 
 
 		 195 aa  195  3e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.151154  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1338  superoxide dismutase, Cu-Zn  63.23 
 
 		 172 aa  194  8.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0978  copper/zinc superoxide dismutase  65.16 
 
 		 189 aa  193  9e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3445  superoxide dismutase  65.16 
 
 		 201 aa  193  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3163  superoxide dismutase (Cu-Zn)  56.07 
 
 		 174 aa  192  2e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.315078  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30470  CU-Zn Superoxide dismutase  57.56 
 
 		 180 aa  192  2e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1200  putative superoxide dismutase  57.65 
 
 		 219 aa  192  3e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0703  superoxide dismutase, Cu-Zn  55.49 
 
 		 173 aa  187  5e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0659  superoxide dismutase, Cu-Zn  55.49 
 
 		 173 aa  187  5e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0397  superoxide dismutase, copper/zinc binding  57.96 
 
 		 176 aa  184  6e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2125  superoxide dismutase, copper/zinc binding  55.75 
 
 		 170 aa  180  9.000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0013475  normal  0.0132534 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2024  superoxide dismutase, copper/zinc binding  59.6 
 
 		 170 aa  174  4e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000023752  hitchhiker  0.00000198076 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1951  superoxide dismutase, copper/zinc binding protein  59.6 
 
 		 170 aa  174  4e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0285693  hitchhiker  0.00191784 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0659  superoxide dismutase, Cu-Zn  53.22 
 
 		 174 aa  171  5e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1186  superoxide dismutase, Cu-Zn  56.29 
 
 		 171 aa  169  1e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1347  superoxide dismutase, copper/zinc binding  51.7 
 
 		 183 aa  169  2e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2485  superoxide dismutase  53.53 
 
 		 171 aa  168  3e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.841642  normal  0.166633 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06578  hypothetical protein  53.18 
 
 		 170 aa  166  1e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3638  superoxide dismutase, copper/zinc binding  55.06 
 
 		 173 aa  162  3e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2297  superoxide dismutase, copper/zinc binding  52.05 
 
 		 180 aa  158  3e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.011982  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0538  superoxide dismutase copper/zinc binding  48.33 
 
 		 178 aa  157  6e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0765812  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03307  superoxide dismutase, Cu-Zn  49.4 
 
 		 181 aa  157  8e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00782096  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2022  superoxide dismutase (Cu-Zn)  49.44 
 
 		 170 aa  155  3e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1507  superoxide dismutase precursor (Cu-Zn)  47.16 
 
 		 178 aa  149  1e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.814898  normal  0.841266 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001207  superoxide dismutase [Cu-Zn] precursor  48.28 
 
 		 171 aa  147  5e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2653  superoxide dismutase, copper/zinc binding  51.88 
 
 		 182 aa  147  8e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.792961  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0511  superoxide dismutase [Cu-Zn] precursor  46.55 
 
 		 170 aa  147  1.0000000000000001e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.59112  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0982  putative superoxide dismutase  44.91 
 
 		 175 aa  139  3e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  decreased coverage  0.000174344  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0122  superoxide dismutase (Cu/Zn)  47.47 
 
 		 179 aa  136  2e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.291157  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0161  copper/zinc superoxide dismutase  52.52 
 
 		 178 aa  134  5e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00000919214  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0788  copper/zinc superoxide dismutase  48.34 
 
 		 178 aa  132  3e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1330  copper/zinc superoxide dismutase  46.71 
 
 		 186 aa  131  5e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.236149  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2297  superoxide dismutase [Cu-Zn] precursor  42.77 
 
 		 162 aa  125  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2270  superoxide dismutase [Cu-Zn] precursor  51.82 
 
 		 162 aa  125  3e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3011  superoxide dismutase copper/zinc binding protein  37.85 
 
 		 174 aa  88.2  5e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2865  superoxide dismutase copper/zinc binding  35.33 
 
 		 172 aa  84  9e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0224  superoxide dismutase copper/zinc binding  38.36 
 
 		 172 aa  83.6  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.504945  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3343  superoxide dismutase copper/zinc binding protein  36.47 
 
 		 210 aa  81.6  0.000000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0409606 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3067  Superoxide dismutase  35.63 
 
 		 175 aa  82  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00079657 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2796  copper/Zinc superoxide dismutase  33.15 
 
 		 169 aa  78.2  0.00000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.914684 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2599  superoxide dismutase, copper/zinc binding  35.19 
 
 		 239 aa  75.9  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00595972  normal  0.45771 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1900  superoxide dismutase, copper/zinc binding  30.41 
 
 		 185 aa  74.7  0.0000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.370601  normal  0.24871 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0733  superoxide dismutase copper/zinc binding  38.78 
 
 		 175 aa  72.8  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000189816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0488  superoxide dismutase, copper/zinc binding  33.13 
 
 		 172 aa  71.6  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0906  superoxide dismutase, Cu/Zn  39.02 
 
 		 192 aa  70.9  0.000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.381444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4523  superoxide dismutase  35.07 
 
 		 510 aa  70.9  0.000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3220  superoxide dismutase, copper/zinc binding  32.57 
 
 		 173 aa  70.9  0.000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4681  Superoxide dismutase  36.11 
 
 		 208 aa  70.5  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.179058 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08070  superoxide dismutase (Cu-Zn)  36.76 
 
 		 158 aa  69.7  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000475437  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1634  superoxide dismutase, copper/zinc binding  34.27 
 
 		 165 aa  68.2  0.00000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.725775 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2943  copper/Zinc superoxide dismutase  35.25 
 
 		 172 aa  67.8  0.00000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.171551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4070  superoxide dismutase copper/zinc binding  36.49 
 
 		 171 aa  67.4  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.273253  normal  0.944661 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3135  superoxide dismutase, copper/zinc binding  31.28 
 
 		 191 aa  66.2  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.310957  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1610  Superoxide dismutase  33.57 
 
 		 184 aa  66.2  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4761  superoxide dismutase, copper/zinc binding  32.62 
 
 		 179 aa  66.6  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.271734  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3597  superoxide dismutase, copper/zinc binding  32.1 
 
 		 169 aa  65.9  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.592346  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4059  superoxide dismutase copper/zinc binding  29.76 
 
 		 214 aa  65.5  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.453641  normal  0.169503 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1782  copper/Zinc superoxide dismutase  35.14 
 
 		 156 aa  65.1  0.0000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4777  superoxide dismutase, Cu-Zn  31.28 
 
 		 179 aa  64.7  0.0000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4617  superoxide dismutase, Cu-Zn  31.28 
 
 		 179 aa  64.7  0.0000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4639  superoxide dismutase, Cu-Zn  31.28 
 
 		 179 aa  64.7  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5139  superoxide dismutase, Cu-Zn  31.28 
 
 		 179 aa  64.7  0.0000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5051  superoxide dismutase, Cu-Zn  31.28 
 
 		 179 aa  64.7  0.0000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1980  superoxide dismutase, copper/zinc binding  30.77 
 
 		 183 aa  64.7  0.0000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0783595 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4729  superoxide dismutase copper/zinc binding  31.28 
 
 		 179 aa  64.7  0.0000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2057  superoxide dismutase, copper/zinc binding  34.29 
 
 		 175 aa  64.3  0.0000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0494601  normal  0.319354 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1880  superoxide dismutase copper/zinc binding  34.29 
 
 		 175 aa  64.3  0.0000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0664  superoxide dismutase copper/zinc binding protein  38.84 
 
 		 218 aa  64.3  0.0000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2767  superoxide dismutase copper/zinc binding protein  28.74 
 
 		 204 aa  63.9  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.238721 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0195  superoxide dismutase, Cu-Zn  31.67 
 
 		 179 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2380  superoxide dismutase copper/zinc binding protein  31.68 
 
 		 220 aa  63.9  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5039  superoxide dismutase, Cu-Zn  32.22 
 
 		 179 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.792086  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3711  superoxide dismutase copper/zinc binding  33.33 
 
 		 180 aa  63.5  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5046  superoxide dismutase, Cu-Zn  30.73 
 
 		 179 aa  62.8  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3518  superoxide dismutase copper/zinc binding  30 
 
 		 180 aa  62.4  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12203  Copper/Zinc superoxide dismutase  27.36 
 
 		 194 aa  62  0.000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.348099  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7975  Cu/Zn superoxide dismutase-like protein  31.01 
 
 		 226 aa  61.6  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102706  normal  0.114926 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0124  superoxide dismutase copper/zinc binding  30.38 
 
 		 189 aa  60.8  0.000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0952022 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>