140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1330 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1330  copper/zinc superoxide dismutase  100 
 
 
186 aa  375  1e-103  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.236149  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0161  copper/zinc superoxide dismutase  67.2 
 
 
178 aa  248  4e-65  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00000919214  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0788  copper/zinc superoxide dismutase  63.44 
 
 
178 aa  237  5.999999999999999e-62  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0122  superoxide dismutase (Cu/Zn)  59.14 
 
 
179 aa  216  1e-55  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.291157  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1186  superoxide dismutase, Cu-Zn  55.84 
 
 
171 aa  164  5e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001207  superoxide dismutase [Cu-Zn] precursor  56.34 
 
 
171 aa  158  4e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0511  superoxide dismutase [Cu-Zn] precursor  52.17 
 
 
170 aa  158  4e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.59112  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30470  CU-Zn Superoxide dismutase  49.69 
 
 
180 aa  155  2e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1419  copper/zinc superoxide dismutase  51.3 
 
 
177 aa  155  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0294455 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1082  copper/zinc superoxide dismutase  51.3 
 
 
177 aa  155  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.302029 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1154  copper/zinc superoxide dismutase  51.3 
 
 
177 aa  155  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1347  superoxide dismutase, copper/zinc binding  44.2 
 
 
183 aa  154  9e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06578  hypothetical protein  54.49 
 
 
170 aa  152  2e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1200  putative superoxide dismutase  49.34 
 
 
219 aa  148  3e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3638  superoxide dismutase, copper/zinc binding  51.33 
 
 
173 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2101  superoxide dismutase copper/zinc binding  48.65 
 
 
174 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.651227  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1338  superoxide dismutase, Cu-Zn  52.32 
 
 
172 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0978  copper/zinc superoxide dismutase  46.91 
 
 
189 aa  144  7.0000000000000006e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3315  copper/zinc superoxide dismutase  43.32 
 
 
195 aa  144  9e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.151154  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0659  superoxide dismutase, Cu-Zn  48.45 
 
 
174 aa  144  1e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3163  superoxide dismutase (Cu-Zn)  47.68 
 
 
174 aa  144  1e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.315078  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3445  superoxide dismutase  48.37 
 
 
201 aa  143  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1154  copper/Zinc superoxide dismutase  52.98 
 
 
172 aa  142  4e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.744174 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03307  superoxide dismutase, Cu-Zn  49.67 
 
 
181 aa  141  4e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00782096  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2297  superoxide dismutase, copper/zinc binding  50.71 
 
 
180 aa  141  5e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.011982  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2022  superoxide dismutase (Cu-Zn)  41.94 
 
 
170 aa  140  9.999999999999999e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2485  superoxide dismutase  44.94 
 
 
171 aa  137  8.999999999999999e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.841642  normal  0.166633 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2210  superoxide dismutase  48.68 
 
 
173 aa  135  3.0000000000000003e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0109092  hitchhiker  0.000454174 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3827  superoxide dismutase  43.75 
 
 
173 aa  132  3e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2125  superoxide dismutase, copper/zinc binding  42.39 
 
 
170 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0013475  normal  0.0132534 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1903  superoxide dismutase  46.71 
 
 
173 aa  131  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.292339  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1537  superoxide dismutase  46.71 
 
 
173 aa  131  6.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.19125  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1550  superoxide dismutase  46.71 
 
 
173 aa  131  6.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1734  superoxide dismutase  46.71 
 
 
173 aa  130  7.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0827551  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2024  superoxide dismutase, copper/zinc binding  46.1 
 
 
170 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000023752  hitchhiker  0.00000198076 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1951  superoxide dismutase, copper/zinc binding protein  46.1 
 
 
170 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0285693  hitchhiker  0.00191784 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1610  superoxide dismutase  46.05 
 
 
173 aa  129  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.815221 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01616  superoxide dismutase, Cu, Zn  45.39 
 
 
173 aa  127  6e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00181178  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1994  Superoxide dismutase  45.39 
 
 
173 aa  127  6e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000374216  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01606  hypothetical protein  45.39 
 
 
173 aa  127  6e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00112048  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2358  superoxide dismutase  45.39 
 
 
173 aa  127  6e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000359959  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1723  superoxide dismutase  45.39 
 
 
173 aa  127  6e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.335611  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1857  superoxide dismutase  45.39 
 
 
173 aa  127  6e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.195407  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1838  superoxide dismutase  45.39 
 
 
173 aa  128  6e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.159694  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1983  superoxide dismutase  45.39 
 
 
178 aa  127  7.000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0141955  hitchhiker  0.00119703 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1552  superoxide dismutase  45.39 
 
 
173 aa  127  8.000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0496165  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0397  superoxide dismutase, copper/zinc binding  48.67 
 
 
176 aa  126  2.0000000000000002e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0703  superoxide dismutase, Cu-Zn  43.75 
 
 
173 aa  124  6e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0659  superoxide dismutase, Cu-Zn  43.75 
 
 
173 aa  124  6e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1507  superoxide dismutase precursor (Cu-Zn)  42.42 
 
 
178 aa  122  3e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.814898  normal  0.841266 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2653  superoxide dismutase, copper/zinc binding  42.76 
 
 
182 aa  120  9.999999999999999e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.792961  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1801  superoxide dismutase  46.04 
 
 
172 aa  119  3e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0159903  normal  0.0303591 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0982  putative superoxide dismutase  40.83 
 
 
175 aa  117  9.999999999999999e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  decreased coverage  0.000174344  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2297  superoxide dismutase [Cu-Zn] precursor  38.59 
 
 
162 aa  110  9e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0538  superoxide dismutase copper/zinc binding  44.52 
 
 
178 aa  109  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0765812  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2270  superoxide dismutase [Cu-Zn] precursor  45.52 
 
 
162 aa  108  5e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2581  superoxide dismutase copper/zinc binding  39.52 
 
 
183 aa  77.8  0.00000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.152888  normal  0.324375 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2057  superoxide dismutase, copper/zinc binding  36.17 
 
 
175 aa  76.6  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0494601  normal  0.319354 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1880  superoxide dismutase copper/zinc binding  36.17 
 
 
175 aa  76.6  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2177  superoxide dismutase copper/zinc binding  39.52 
 
 
183 aa  75.5  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.462725  normal  0.0481765 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3554  superoxide dismutase  32.63 
 
 
171 aa  75.1  0.0000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642978  normal  0.247145 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3942  superoxide dismutase copper/zinc binding  35.95 
 
 
212 aa  72.8  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379903  normal  0.128954 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0906  superoxide dismutase, Cu/Zn  37.39 
 
 
192 aa  71.2  0.000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.381444  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2796  copper/Zinc superoxide dismutase  30.91 
 
 
169 aa  70.5  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.914684 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1900  superoxide dismutase, copper/zinc binding  29.9 
 
 
185 aa  70.5  0.00000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.370601  normal  0.24871 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2368  superoxide dismutase Cu-Zn precursor protein  32.29 
 
 
182 aa  70.1  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0422357 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4338  copper/Zinc superoxide dismutase  32.62 
 
 
180 aa  68.9  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1980  superoxide dismutase, copper/zinc binding  29.59 
 
 
183 aa  68.6  0.00000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0783595 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12203  Copper/Zinc superoxide dismutase  30.15 
 
 
194 aa  66.6  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.348099  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3449  superoxide dismutase, copper/zinc binding  33.57 
 
 
180 aa  66.2  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  0.00000937306 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1634  superoxide dismutase, copper/zinc binding  33.57 
 
 
165 aa  66.6  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.725775 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4681  Superoxide dismutase  31.41 
 
 
208 aa  65.9  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.179058 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1796  putative copper/Zinc superoxide dismutase  35.94 
 
 
185 aa  66.2  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.749298  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0442  superoxide dismutase, copper/zinc binding  35.94 
 
 
185 aa  65.9  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.039325  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4761  superoxide dismutase, copper/zinc binding  32.1 
 
 
179 aa  65.5  0.0000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.271734  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1610  Superoxide dismutase  33.57 
 
 
184 aa  65.1  0.0000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0125  superoxide dismutase copper/zinc binding  37.3 
 
 
206 aa  64.7  0.0000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.100957 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2599  superoxide dismutase, copper/zinc binding  31.37 
 
 
239 aa  64.3  0.0000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00595972  normal  0.45771 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2943  copper/Zinc superoxide dismutase  35 
 
 
172 aa  63.5  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.171551  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03561  superoxide dismutase  34.56 
 
 
203 aa  62.8  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1626  superoxide dismutase, copper/zinc binding  31.51 
 
 
177 aa  61.6  0.000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0454  superoxide dismutase, copper/zinc binding  34.38 
 
 
190 aa  60.8  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.101401  normal  0.041937 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3711  superoxide dismutase copper/zinc binding  31.13 
 
 
180 aa  60.8  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3597  superoxide dismutase, copper/zinc binding  33.33 
 
 
169 aa  60.8  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.592346  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3011  superoxide dismutase copper/zinc binding protein  30.26 
 
 
174 aa  59.7  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08070  superoxide dismutase (Cu-Zn)  29.86 
 
 
158 aa  59.7  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000475437  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3067  Superoxide dismutase  33.33 
 
 
175 aa  59.3  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00079657 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2757  superoxide dismutase, copper/zinc binding  34.86 
 
 
191 aa  58.9  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00492325  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2872  superoxide dismutase copper/zinc binding  29.86 
 
 
169 aa  58.9  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0217452 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4070  superoxide dismutase copper/zinc binding  34.23 
 
 
171 aa  58.5  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.273253  normal  0.944661 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1782  copper/Zinc superoxide dismutase  32.19 
 
 
156 aa  57.8  0.00000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0122  superoxide dismutase copper/zinc binding  28.21 
 
 
179 aa  57.8  0.00000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.542638  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4679  superoxide dismutase copper/zinc binding  31.33 
 
 
201 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.841473 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4523  superoxide dismutase  31.15 
 
 
510 aa  57.8  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4310  superoxide dismutase copper/zinc binding  31.33 
 
 
201 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.366806  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0124  superoxide dismutase copper/zinc binding  28.47 
 
 
189 aa  56.2  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0952022 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1009  superoxide dismutase copper/zinc binding  31.75 
 
 
171 aa  56.2  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.814161 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1161  superoxide dismutase copper/zinc binding  30.95 
 
 
171 aa  56.2  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.552065  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0224  superoxide dismutase copper/zinc binding  29.58 
 
 
172 aa  55.1  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.504945  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4729  superoxide dismutase copper/zinc binding  28.27 
 
 
179 aa  55.1  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>