114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_28559 on replicon NC_009373
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009373  OSTLU_28559  predicted protein  100 
 
 
197 aa  396  1e-109  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000859292  hitchhiker  0.000000574282 
 
 
-
 
NC_006686  CND01490  copper zinc superoxide dismutase  51.27 
 
 
154 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.452302  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00241  Superoxide dismutase [Cu-Zn] (EC 1.15.1.1) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q9HEY7]  50 
 
 
154 aa  136  2e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89018  Superoxide dismutase (Cu-Zn)  48.41 
 
 
154 aa  129  4.0000000000000003e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.204777  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1610  Superoxide dismutase  43.21 
 
 
184 aa  119  3e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_15852  predicted protein  44.44 
 
 
138 aa  108  4.0000000000000004e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0113934  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0906  superoxide dismutase, Cu/Zn  42.31 
 
 
192 aa  103  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.381444  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3449  superoxide dismutase, copper/zinc binding  37.43 
 
 
180 aa  96.7  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  0.00000937306 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4681  Superoxide dismutase  40.41 
 
 
208 aa  90.9  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.179058 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3942  superoxide dismutase copper/zinc binding  38.36 
 
 
212 aa  90.5  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379903  normal  0.128954 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2057  superoxide dismutase, copper/zinc binding  40.97 
 
 
175 aa  89.4  3e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0494601  normal  0.319354 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1880  superoxide dismutase copper/zinc binding  40.97 
 
 
175 aa  89.4  3e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3554  superoxide dismutase  37.74 
 
 
171 aa  87.4  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642978  normal  0.247145 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1980  superoxide dismutase, copper/zinc binding  38.93 
 
 
183 aa  85.5  5e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0783595 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4338  copper/Zinc superoxide dismutase  38.93 
 
 
180 aa  82.8  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2943  copper/Zinc superoxide dismutase  36.11 
 
 
172 aa  82  0.000000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.171551  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2368  superoxide dismutase Cu-Zn precursor protein  35.86 
 
 
182 aa  81.6  0.000000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0422357 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0125  superoxide dismutase copper/zinc binding  39.29 
 
 
206 aa  80.5  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.100957 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2757  superoxide dismutase, copper/zinc binding  40.32 
 
 
191 aa  78.6  0.00000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00492325  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2581  superoxide dismutase copper/zinc binding  37.24 
 
 
183 aa  78.6  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.152888  normal  0.324375 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2177  superoxide dismutase copper/zinc binding  36.55 
 
 
183 aa  75.9  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.462725  normal  0.0481765 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3711  superoxide dismutase copper/zinc binding  37.04 
 
 
180 aa  76.3  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03561  superoxide dismutase  37.23 
 
 
203 aa  73.6  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1900  superoxide dismutase, copper/zinc binding  33.76 
 
 
185 aa  72.8  0.000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.370601  normal  0.24871 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3067  Superoxide dismutase  35 
 
 
175 aa  72.4  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00079657 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1626  superoxide dismutase, copper/zinc binding  33.33 
 
 
177 aa  71.6  0.000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12203  Copper/Zinc superoxide dismutase  30.43 
 
 
194 aa  69.7  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.348099  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0224  superoxide dismutase copper/zinc binding  35.16 
 
 
172 aa  67.4  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.504945  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03563  superoxide dismutase  32.52 
 
 
200 aa  65.1  0.0000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0124  superoxide dismutase copper/zinc binding  37.69 
 
 
189 aa  64.3  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0952022 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2796  copper/Zinc superoxide dismutase  30.16 
 
 
169 aa  63.9  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.914684 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1782  copper/Zinc superoxide dismutase  38.93 
 
 
156 aa  63.5  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2599  superoxide dismutase, copper/zinc binding  34.81 
 
 
239 aa  61.2  0.000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00595972  normal  0.45771 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3135  superoxide dismutase, copper/zinc binding  32.14 
 
 
191 aa  60.8  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.310957  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3220  superoxide dismutase, copper/zinc binding  30.91 
 
 
173 aa  60.8  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4070  superoxide dismutase copper/zinc binding  34.53 
 
 
171 aa  61.2  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.273253  normal  0.944661 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0488  superoxide dismutase, copper/zinc binding  33.59 
 
 
172 aa  60.1  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4761  superoxide dismutase, copper/zinc binding  36.97 
 
 
179 aa  60.5  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.271734  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3597  superoxide dismutase, copper/zinc binding  33.59 
 
 
169 aa  59.7  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.592346  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32550  copper/zinc superoxide dismutase-like protein  34.04 
 
 
189 aa  59.7  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4523  superoxide dismutase  30.19 
 
 
510 aa  58.5  0.00000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2345  superoxide dismutase  29.66 
 
 
178 aa  57.4  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0211561  normal  0.0730316 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1009  superoxide dismutase copper/zinc binding  32.32 
 
 
171 aa  57.4  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.814161 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08070  superoxide dismutase (Cu-Zn)  30.77 
 
 
158 aa  57.8  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000475437  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2865  superoxide dismutase copper/zinc binding  31.37 
 
 
172 aa  56.6  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1161  superoxide dismutase copper/zinc binding  35.38 
 
 
171 aa  56.6  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.552065  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4310  superoxide dismutase copper/zinc binding  34.68 
 
 
201 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.366806  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4679  superoxide dismutase copper/zinc binding  34.68 
 
 
201 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.841473 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1634  superoxide dismutase, copper/zinc binding  36.52 
 
 
165 aa  55.5  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.725775 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4777  superoxide dismutase, Cu-Zn  34.13 
 
 
179 aa  54.7  0.0000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4617  superoxide dismutase, Cu-Zn  34.13 
 
 
179 aa  54.7  0.0000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4639  superoxide dismutase, Cu-Zn  34.13 
 
 
179 aa  54.7  0.0000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5139  superoxide dismutase, Cu-Zn  34.13 
 
 
179 aa  54.7  0.0000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3819  superoxide dismutase copper/zinc binding  32.52 
 
 
179 aa  54.7  0.0000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.130006  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5051  superoxide dismutase, Cu-Zn  34.13 
 
 
179 aa  54.7  0.0000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5018  superoxide dismutase, Cu-Zn  34.4 
 
 
165 aa  54.7  0.0000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4195  superoxide dismutase copper/zinc binding  29.57 
 
 
210 aa  53.9  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4729  superoxide dismutase copper/zinc binding  31.34 
 
 
179 aa  54.3  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5046  superoxide dismutase, Cu-Zn  31.37 
 
 
179 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1796  putative copper/Zinc superoxide dismutase  33.86 
 
 
185 aa  53.5  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.749298  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3518  superoxide dismutase copper/zinc binding  34.85 
 
 
180 aa  53.5  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4827  superoxide dismutase copper/zinc binding  33.87 
 
 
201 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.661461  normal  0.600787 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5039  superoxide dismutase, Cu-Zn  33.33 
 
 
179 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.792086  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0195  superoxide dismutase, Cu-Zn  33.33 
 
 
179 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0817  superoxide dismutase, copper/zinc binding  30.83 
 
 
226 aa  52.8  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.509975  decreased coverage  0.0003056 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0442  superoxide dismutase, copper/zinc binding  33.86 
 
 
185 aa  52.8  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.039325  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2653  superoxide dismutase, copper/zinc binding  33.08 
 
 
182 aa  51.6  0.000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.792961  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2767  superoxide dismutase copper/zinc binding protein  30.52 
 
 
204 aa  50.8  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.238721 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2833  superoxide dismutase copper/zinc binding  36.07 
 
 
177 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0916793  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1561  superoxide dismutase copper/zinc binding  33.71 
 
 
172 aa  49.7  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.639151  normal  0.731272 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03307  superoxide dismutase, Cu-Zn  27.44 
 
 
181 aa  49.7  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00782096  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1699  superoxide dismutase copper/zinc binding  32.56 
 
 
176 aa  49.3  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000210654  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3011  superoxide dismutase copper/zinc binding protein  27.4 
 
 
174 aa  48.9  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3827  superoxide dismutase  28.65 
 
 
173 aa  48.5  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2378  superoxide dismutase copper/zinc binding  35.25 
 
 
177 aa  48.5  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2481  superoxide dismutase, copper/zinc binding  32.12 
 
 
178 aa  48.1  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2347  superoxide dismutase copper/zinc binding  32.12 
 
 
178 aa  48.1  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.178903 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3343  superoxide dismutase copper/zinc binding protein  27.27 
 
 
210 aa  47.8  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0409606 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2297  superoxide dismutase, copper/zinc binding  29.01 
 
 
180 aa  47  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.011982  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0454  superoxide dismutase, copper/zinc binding  32.23 
 
 
190 aa  47  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.101401  normal  0.041937 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4059  superoxide dismutase copper/zinc binding  33.57 
 
 
214 aa  47  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.453641  normal  0.169503 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2380  superoxide dismutase copper/zinc binding protein  29.8 
 
 
220 aa  46.6  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0859  superoxide dismutase, Cu-Zn  30.86 
 
 
216 aa  45.8  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06045  superoxide dismutase copper chaperone Lys7, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G09700)  29.37 
 
 
247 aa  45.8  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.621456  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0733  superoxide dismutase copper/zinc binding  29.51 
 
 
175 aa  45.4  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000189816  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1823  superoxide dismutase, copper/zinc binding  30.91 
 
 
178 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0265669  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2434  superoxide dismutase, copper/zinc binding  30.91 
 
 
178 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0971704  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1330  copper/zinc superoxide dismutase  31.25 
 
 
186 aa  43.9  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.236149  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2439  superoxide dismutase copper/zinc binding  30.91 
 
 
178 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000305746  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0664  superoxide dismutase copper/zinc binding protein  29.79 
 
 
218 aa  43.5  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1214  superoxide dismutase, Cu-Zn  32.28 
 
 
179 aa  43.9  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1056  copper/zinc superoxide dismutase  32.28 
 
 
179 aa  43.9  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1062  copper/zinc superoxide dismutase  32.28 
 
 
179 aa  43.9  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.7887  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2922  superoxide dismutase copper/zinc binding  31.62 
 
 
183 aa  43.9  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.719659  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2022  superoxide dismutase (Cu-Zn)  29.03 
 
 
170 aa  43.5  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2188  superoxide dismutase copper/zinc binding  28.22 
 
 
206 aa  43.5  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0161821  normal  0.256851 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0538  superoxide dismutase copper/zinc binding  26.35 
 
 
178 aa  43.5  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0765812  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30470  CU-Zn Superoxide dismutase  31.82 
 
 
180 aa  43.1  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1338  superoxide dismutase, Cu-Zn  28.21 
 
 
172 aa  43.1  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0852  superoxide dismutase, copper/zinc binding  33.33 
 
 
183 aa  42.4  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.260138 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>