65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_32550 on replicon NC_009361
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009361  OSTLU_32550  copper/zinc superoxide dismutase-like protein  100 
 
 
189 aa  385  1e-106  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3449  superoxide dismutase, copper/zinc binding  37.13 
 
 
180 aa  78.6  0.00000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  0.00000937306 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0906  superoxide dismutase, Cu/Zn  34.57 
 
 
192 aa  72  0.000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.381444  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1610  Superoxide dismutase  35.61 
 
 
184 aa  71.2  0.000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3554  superoxide dismutase  32.08 
 
 
171 aa  68.6  0.00000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642978  normal  0.247145 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2943  copper/Zinc superoxide dismutase  34.93 
 
 
172 aa  66.2  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.171551  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4338  copper/Zinc superoxide dismutase  30.63 
 
 
180 aa  64.7  0.0000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3711  superoxide dismutase copper/zinc binding  32.6 
 
 
180 aa  63.9  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1626  superoxide dismutase, copper/zinc binding  30.46 
 
 
177 aa  62.4  0.000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4681  Superoxide dismutase  33.33 
 
 
208 aa  62.4  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.179058 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1880  superoxide dismutase copper/zinc binding  33.94 
 
 
175 aa  62  0.000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2057  superoxide dismutase, copper/zinc binding  33.54 
 
 
175 aa  60.5  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0494601  normal  0.319354 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_15852  predicted protein  32.9 
 
 
138 aa  59.7  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0113934  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3942  superoxide dismutase copper/zinc binding  30.07 
 
 
212 aa  59.7  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379903  normal  0.128954 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_28559  predicted protein  34.04 
 
 
197 aa  59.7  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000859292  hitchhiker  0.000000574282 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2757  superoxide dismutase, copper/zinc binding  33.62 
 
 
191 aa  60.1  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00492325  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12203  Copper/Zinc superoxide dismutase  31.01 
 
 
194 aa  55.1  0.0000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.348099  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3011  superoxide dismutase copper/zinc binding protein  33.59 
 
 
174 aa  55.1  0.0000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0125  superoxide dismutase copper/zinc binding  30.72 
 
 
206 aa  53.9  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.100957 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4761  superoxide dismutase, copper/zinc binding  27.34 
 
 
179 aa  53.9  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.271734  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3067  Superoxide dismutase  30.14 
 
 
175 aa  53.9  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00079657 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2599  superoxide dismutase, copper/zinc binding  31.12 
 
 
239 aa  52.8  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00595972  normal  0.45771 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0124  superoxide dismutase copper/zinc binding  31.36 
 
 
189 aa  52  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0952022 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2368  superoxide dismutase Cu-Zn precursor protein  28.57 
 
 
182 aa  52  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0422357 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03307  superoxide dismutase, Cu-Zn  31.72 
 
 
181 aa  50.4  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00782096  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND01490  copper zinc superoxide dismutase  31.88 
 
 
154 aa  50.8  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.452302  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1507  superoxide dismutase precursor (Cu-Zn)  26.97 
 
 
178 aa  50.4  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.814898  normal  0.841266 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2865  superoxide dismutase copper/zinc binding  31.75 
 
 
172 aa  50.8  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2796  copper/Zinc superoxide dismutase  27.78 
 
 
169 aa  49.7  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.914684 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2297  superoxide dismutase, copper/zinc binding  30.14 
 
 
180 aa  48.9  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.011982  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1980  superoxide dismutase, copper/zinc binding  27.78 
 
 
183 aa  48.9  0.00005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0783595 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2581  superoxide dismutase copper/zinc binding  29.17 
 
 
183 aa  48.5  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.152888  normal  0.324375 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5046  superoxide dismutase, Cu-Zn  30.77 
 
 
179 aa  47.8  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2177  superoxide dismutase copper/zinc binding  29.89 
 
 
183 aa  47.8  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.462725  normal  0.0481765 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4729  superoxide dismutase copper/zinc binding  31.47 
 
 
179 aa  47.4  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0195  superoxide dismutase, Cu-Zn  28.49 
 
 
179 aa  47  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0397  superoxide dismutase, copper/zinc binding  27.97 
 
 
176 aa  46.6  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3597  superoxide dismutase, copper/zinc binding  27.78 
 
 
169 aa  45.8  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.592346  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4523  superoxide dismutase  26.51 
 
 
510 aa  46.2  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1900  superoxide dismutase, copper/zinc binding  25.35 
 
 
185 aa  45.8  0.0004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.370601  normal  0.24871 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4777  superoxide dismutase, Cu-Zn  29.41 
 
 
179 aa  45.8  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4617  superoxide dismutase, Cu-Zn  29.41 
 
 
179 aa  45.8  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5039  superoxide dismutase, Cu-Zn  28.49 
 
 
179 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.792086  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4639  superoxide dismutase, Cu-Zn  29.41 
 
 
179 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5051  superoxide dismutase, Cu-Zn  29.41 
 
 
179 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5139  superoxide dismutase, Cu-Zn  29.41 
 
 
179 aa  45.8  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0488  superoxide dismutase, copper/zinc binding  26.95 
 
 
172 aa  45.4  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03561  superoxide dismutase  28.29 
 
 
203 aa  45.4  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2022  superoxide dismutase (Cu-Zn)  27.41 
 
 
170 aa  45.4  0.0005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2345  superoxide dismutase  28.65 
 
 
178 aa  45.1  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0211561  normal  0.0730316 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5018  superoxide dismutase, Cu-Zn  29.41 
 
 
165 aa  45.1  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00241  Superoxide dismutase [Cu-Zn] (EC 1.15.1.1) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q9HEY7]  28.97 
 
 
154 aa  43.9  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1782  copper/Zinc superoxide dismutase  31.39 
 
 
156 aa  44.7  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89018  Superoxide dismutase (Cu-Zn)  28.97 
 
 
154 aa  44.3  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.204777  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0224  superoxide dismutase copper/zinc binding  25.4 
 
 
172 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.504945  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4070  superoxide dismutase copper/zinc binding  29.63 
 
 
171 aa  42.7  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.273253  normal  0.944661 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3518  superoxide dismutase copper/zinc binding  28.1 
 
 
180 aa  42.4  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3827  superoxide dismutase  27.82 
 
 
173 aa  42.4  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0659  superoxide dismutase, Cu-Zn  31.45 
 
 
174 aa  42.4  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30470  CU-Zn Superoxide dismutase  28.47 
 
 
180 aa  42.4  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3638  superoxide dismutase, copper/zinc binding  28.23 
 
 
173 aa  42  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2872  superoxide dismutase copper/zinc binding  28.48 
 
 
169 aa  41.6  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0217452 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0511  superoxide dismutase [Cu-Zn] precursor  27.82 
 
 
170 aa  41.6  0.007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.59112  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3135  superoxide dismutase, copper/zinc binding  30 
 
 
191 aa  41.6  0.007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.310957  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2125  superoxide dismutase, copper/zinc binding  28.81 
 
 
170 aa  41.2  0.008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0013475  normal  0.0132534 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>