18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3646 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3646  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 424 aa  839    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.302268 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3441  hypothetical protein  33.63 
 
 		 422 aa  120  7e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0020  hypothetical protein  29.72 
 
 		 440 aa  119  9.999999999999999e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3498  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  31.06 
 
 		 413 aa  110  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0371184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3524  hypothetical protein  33.14 
 
 		 413 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.661679  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3592  hypothetical protein  32.12 
 
 		 413 aa  99.4  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.203962  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5509  hypothetical protein  31.75 
 
 		 329 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3704  hypothetical protein  31.25 
 
 		 329 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4523  superoxide dismutase  33.2 
 
 		 510 aa  60.1  0.00000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4017  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  27.72 
 
 		 347 aa  53.9  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3974  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  27.72 
 
 		 347 aa  53.9  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1405  hypothetical protein  30.28 
 
 		 325 aa  51.6  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.386776 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4965  hypothetical protein  30.2 
 
 		 325 aa  49.7  0.00009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1081  hypothetical protein  25.45 
 
 		 322 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.212127 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3813  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  22.02 
 
 		 326 aa  48.1  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3389  hypothetical protein  26.04 
 
 		 315 aa  44.3  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42030  hypothetical protein  26.4 
 
 		 332 aa  43.9  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1768  heat shock protein DnaJ-like  36.36 
 
 		 415 aa  43.5  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0454464  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>