59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1635 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_1635  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  100 
 
 		 545 aa  1068    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.260295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4246  NHL repeat-containing protein  46.92 
 
 		 542 aa  445  1e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.359028  normal  0.663745 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4276  NHL repeat-containing protein  46.44 
 
 		 543 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0287557 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4920  NHL repeat containing protein  45.17 
 
 		 542 aa  418  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.610425  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0329  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  44.74 
 
 		 553 aa  392  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2800  NHL repeat-containing protein  40.81 
 
 		 538 aa  388  1e-106  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.350365  normal  0.74213 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3693  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  31.35 
 
 		 531 aa  172  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0345166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0275  hypothetical protein  30.06 
 
 		 502 aa  170  6e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.152973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4495  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  30.94 
 
 		 538 aa  166  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.789599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4408  NHL repeat-containing protein  30.94 
 
 		 538 aa  166  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1786  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  32.02 
 
 		 526 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.222131 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4789  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  30.65 
 
 		 550 aa  164  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.425 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4866  NHL repeat containing protein  30.83 
 
 		 510 aa  152  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4964  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  31.73 
 
 		 529 aa  140  7e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2610  hypothetical protein  35.69 
 
 		 302 aa  124  5e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000643636  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1414  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  27.76 
 
 		 279 aa  53.9  0.000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.853392 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2684  hypothetical protein  26.96 
 
 		 363 aa  53.9  0.000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  23.73 
 
 		 1667 aa  53.5  0.000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0535  NHL repeat-containing protein  27.21 
 
 		 642 aa  52.4  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000386483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  25.11 
 
 		 696 aa  52.4  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4785  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  30.69 
 
 		 312 aa  51.6  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.0048727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1531  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  25.91 
 
 		 310 aa  50.8  0.00006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0805032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2063  NHL repeat containing protein  23.46 
 
 		 652 aa  50.4  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2728  gluconolactonase  28.84 
 
 		 339 aa  48.9  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.698337 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1525  hypothetical protein  28.85 
 
 		 391 aa  49.3  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.568964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3789  putative hydrolase  24.07 
 
 		 285 aa  47.8  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00804259  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2815  hypothetical protein  26.24 
 
 		 363 aa  47.8  0.0005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4631  Gluconolactonase  30.77 
 
 		 302 aa  47.8  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0459934 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2246  hypothetical protein  29.5 
 
 		 294 aa  47.8  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4512  gluconolactonase  28.57 
 
 		 305 aa  47  0.0008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00932463  normal  0.660783 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1858  serine/threonine-protein kinase  29.46 
 
 		 274 aa  47  0.0009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.129879 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5454  alpha-1,2-mannosidase  26.96 
 
 		 1189 aa  46.2  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.8868  normal  0.279794 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6274  gluconolactonase  37.5 
 
 		 308 aa  46.6  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1726  L-sorbosone dehydrogenase, putative  32.35 
 
 		 362 aa  46.2  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.856742 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3293  strictosidine synthase  38.03 
 
 		 367 aa  47  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.894775  normal  0.62202 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7086  serine/threonine protein kinase  30.77 
 
 		 732 aa  46.6  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2867  putative hydrolase  25.16 
 
 		 291 aa  46.2  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.618426  normal  0.632922 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2094  hypothetical protein  22.16 
 
 		 343 aa  45.8  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.327538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2396  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  25.7 
 
 		 275 aa  45.4  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000818527  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3389  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  36.25 
 
 		 303 aa  45.4  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.242226 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0095  WD-40 repeat-containing protein  23.99 
 
 		 342 aa  45.1  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000200238  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3486  Gluconolactonase  28.68 
 
 		 303 aa  44.7  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.656299 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2118  putative gluconolactonase precursor  36.25 
 
 		 306 aa  44.7  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0176891  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0104  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  28.19 
 
 		 353 aa  45.1  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04622  gluconolactonase  30.77 
 
 		 292 aa  44.7  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5618  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  26.97 
 
 		 306 aa  45.1  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.638263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4272  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  32.43 
 
 		 307 aa  44.7  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0244404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2846  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.4 
 
 		 333 aa  44.3  0.006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3465  senescence marker protein-30 (SMP-30)  36.25 
 
 		 309 aa  44.3  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.391955  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0193  L-sorbosone dehydrogenase, putative  28.81 
 
 		 379 aa  44.3  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.435435  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1558  hydrolase  22.71 
 
 		 294 aa  44.3  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.530388  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0658  gluconolactonase  27.46 
 
 		 307 aa  43.9  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.752628 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1898  putative hydrolase  24.03 
 
 		 299 aa  43.9  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.305143 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1405  hypothetical protein  29.32 
 
 		 325 aa  43.9  0.008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.386776 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0714  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  26.52 
 
 		 307 aa  43.9  0.008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.958974 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10949  transmembrane serine/threonine-protein kinase D pknD  28.66 
 
 		 664 aa  43.9  0.008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4144  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  35 
 
 		 309 aa  43.5  0.009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1903  gluconolactonase precursor  36.25 
 
 		 309 aa  43.5  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3490  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  26.92 
 
 		 371 aa  43.5  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>