59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4964 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4408  NHL repeat-containing protein  77.76 
 
 		 538 aa  754    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4789  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  77.38 
 
 		 550 aa  753    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.425 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1786  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  87.69 
 
 		 526 aa  877    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.222131 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4964  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  100 
 
 		 529 aa  1026    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4495  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  77.76 
 
 		 538 aa  754    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.789599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3693  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  71.73 
 
 		 531 aa  731    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0345166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0275  hypothetical protein  46.22 
 
 		 502 aa  381  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.152973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4866  NHL repeat containing protein  38.64 
 
 		 510 aa  262  1e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4246  NHL repeat-containing protein  31.78 
 
 		 542 aa  182  9.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.359028  normal  0.663745 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4920  NHL repeat containing protein  30.48 
 
 		 542 aa  170  6e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.610425  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4276  NHL repeat-containing protein  29.74 
 
 		 543 aa  170  7e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0287557 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2800  NHL repeat-containing protein  29.1 
 
 		 538 aa  154  5e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.350365  normal  0.74213 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1635  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  31.73 
 
 		 545 aa  147  5e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.260295  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0329  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  29.15 
 
 		 553 aa  145  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2610  hypothetical protein  28.97 
 
 		 302 aa  77.4  0.0000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000643636  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7086  serine/threonine protein kinase  29 
 
 		 732 aa  61.2  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10949  transmembrane serine/threonine-protein kinase D pknD  28.26 
 
 		 664 aa  55.1  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2396  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  27.78 
 
 		 275 aa  55.1  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000818527  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1639  hypothetical protein  23.99 
 
 		 657 aa  53.9  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0222  hypothetical protein  23.99 
 
 		 657 aa  53.5  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.640849  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1558  hydrolase  26.21 
 
 		 294 aa  52.8  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.530388  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1220  hypothetical protein  23.99 
 
 		 657 aa  53.1  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.124677  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0365  hypothetical protein  23.99 
 
 		 657 aa  53.1  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.860395  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1063  hypothetical protein  23.99 
 
 		 657 aa  53.1  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0053  hypothetical protein  23.99 
 
 		 657 aa  53.1  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1728  hypothetical protein  23.33 
 
 		 657 aa  50.4  0.00009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0868275  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2153  gluconolactonase  31.25 
 
 		 323 aa  50.1  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.669846 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7528  putative hydrolase  25.45 
 
 		 302 aa  50.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0701263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0535  NHL repeat-containing protein  28.51 
 
 		 642 aa  50.1  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000386483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4507  Gluconolactonase  31.13 
 
 		 308 aa  49.7  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1414  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  31.87 
 
 		 279 aa  48.9  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.853392 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2094  hypothetical protein  25.76 
 
 		 343 aa  48.5  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.327538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0714  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  26.55 
 
 		 307 aa  48.1  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.958974 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1858  serine/threonine-protein kinase  23.47 
 
 		 274 aa  47.8  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.129879 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5696  calcium-binding protein  29.31 
 
 		 249 aa  47.4  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.086452  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2788  NHL repeat-containing protein  33.33 
 
 		 349 aa  47.4  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3789  putative hydrolase  29.35 
 
 		 285 aa  47.4  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00804259  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1671  hypothetical protein  28.9 
 
 		 357 aa  47.4  0.0007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0387951  normal  0.034674 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3940  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  31.43 
 
 		 295 aa  47  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4272  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  31.25 
 
 		 307 aa  46.2  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0244404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  25 
 
 		 696 aa  47  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1192  hypothetical protein  22.76 
 
 		 667 aa  46.6  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.251244  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1379  NHL repeat-containing protein  24.52 
 
 		 319 aa  45.8  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0368543 
 
 
-
 
NC_003296  RS02985  putative hydrolase transmembrane protein  32.3 
 
 		 349 aa  45.8  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.168534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2399  hypothetical protein  33.06 
 
 		 294 aa  46.2  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.480883 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4631  Gluconolactonase  29.09 
 
 		 302 aa  45.1  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0459934 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04622  gluconolactonase  24.12 
 
 		 292 aa  45.1  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7126  serine/threonine protein kinase  24.52 
 
 		 770 aa  45.1  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13557  hypothetical protein  31.68 
 
 		 343 aa  45.4  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000762607 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3109  NHL repeat containing protein  30.36 
 
 		 355 aa  45.4  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4185  serine/threonine protein kinase  24.8 
 
 		 719 aa  45.1  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6221  gluconolactonase  26.7 
 
 		 314 aa  45.1  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.162368  normal  0.0196248 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0143  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  29.03 
 
 		 427 aa  43.9  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.689507  normal  0.832483 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0134  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  29.03 
 
 		 427 aa  43.9  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771117  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0556  immunoglobulin I-set domain-containing protein  25.17 
 
 		 1130 aa  43.9  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.329662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0124  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  29.03 
 
 		 427 aa  43.9  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5316  gluconolactonase  26.45 
 
 		 303 aa  43.9  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4088  serine/threonine protein kinase  29.08 
 
 		 850 aa  43.5  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.527089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0249  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  26.29 
 
 		 497 aa  43.5  0.01  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>