57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_4789 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_1786  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  75.91 
 
 		 526 aa  750    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.222131 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4789  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  100 
 
 		 550 aa  1077    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.425 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4964  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  77.38 
 
 		 529 aa  753    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3693  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  72.24 
 
 		 531 aa  755    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0345166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4495  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  99.44 
 
 		 538 aa  1045    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.789599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4408  NHL repeat-containing protein  99.44 
 
 		 538 aa  1045    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0275  hypothetical protein  48.3 
 
 		 502 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.152973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4866  NHL repeat containing protein  38.03 
 
 		 510 aa  271  2.9999999999999997e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4246  NHL repeat-containing protein  31.66 
 
 		 542 aa  196  1e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.359028  normal  0.663745 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4920  NHL repeat containing protein  31.99 
 
 		 542 aa  192  9e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.610425  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4276  NHL repeat-containing protein  30.28 
 
 		 543 aa  192  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0287557 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2800  NHL repeat-containing protein  29.55 
 
 		 538 aa  174  3.9999999999999995e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.350365  normal  0.74213 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0329  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  29.76 
 
 		 553 aa  167  5e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1635  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  30.96 
 
 		 545 aa  167  5e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.260295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2610  hypothetical protein  33.46 
 
 		 302 aa  93.6  9e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000643636  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2986  PA14 domain-containing protein  23.02 
 
 		 1293 aa  65.1  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1472  NHL/RHS/YD repeat-containing protein  26.15 
 
 		 1834 aa  58.9  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1858  serine/threonine-protein kinase  24.77 
 
 		 274 aa  56.6  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.129879 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1558  hydrolase  27.64 
 
 		 294 aa  56.2  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.530388  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2396  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  27.89 
 
 		 275 aa  55.5  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000818527  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04622  gluconolactonase  25.11 
 
 		 292 aa  54.3  0.000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7528  putative hydrolase  27.19 
 
 		 302 aa  54.3  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0701263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2018  gluconolactonase  29.91 
 
 		 283 aa  53.9  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2064  gluconolactonase  29.91 
 
 		 283 aa  53.9  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2001  gluconolactonase  29.91 
 
 		 283 aa  53.9  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3789  putative hydrolase  30.3 
 
 		 285 aa  53.5  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00804259  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1898  putative hydrolase  29.95 
 
 		 299 aa  52.4  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.305143 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4185  serine/threonine protein kinase  24.8 
 
 		 719 aa  52.4  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0124  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  32.03 
 
 		 427 aa  52.8  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0134  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  32.03 
 
 		 427 aa  52.8  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771117  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0143  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  32.03 
 
 		 427 aa  52.8  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.689507  normal  0.832483 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1671  hypothetical protein  27.52 
 
 		 357 aa  50.8  0.00005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0387951  normal  0.034674 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2741  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  26.48 
 
 		 290 aa  50.1  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.883174 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  22.25 
 
 		 1789 aa  48.9  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6221  gluconolactonase  25 
 
 		 314 aa  49.3  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.162368  normal  0.0196248 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5696  calcium-binding protein  28.57 
 
 		 249 aa  48.5  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.086452  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2153  gluconolactonase  30.05 
 
 		 323 aa  48.5  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.669846 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1414  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  29.71 
 
 		 279 aa  48.5  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.853392 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4136  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  25.93 
 
 		 306 aa  48.5  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10949  transmembrane serine/threonine-protein kinase D pknD  29.8 
 
 		 664 aa  47.8  0.0006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7086  serine/threonine protein kinase  26.35 
 
 		 732 aa  47.4  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0535  NHL repeat-containing protein  23.08 
 
 		 642 aa  47  0.0009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000386483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5618  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  25 
 
 		 306 aa  46.6  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.638263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2867  putative hydrolase  28.7 
 
 		 291 aa  46.6  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.618426  normal  0.632922 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  25.93 
 
 		 696 aa  47  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2141  hypothetical protein  27.78 
 
 		 346 aa  47  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1611  Fibronectin type III domain protein  27.44 
 
 		 805 aa  46.2  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  unclonable  0.000457229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  22.86 
 
 		 1750 aa  45.4  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2917  NHL repeat containing protein  28.16 
 
 		 623 aa  45.4  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.304592  normal  0.453442 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3457  low-density lipoprotein receptor YWTD repeat protein  27.86 
 
 		 335 aa  45.4  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0967146 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2237  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  26.92 
 
 		 273 aa  45.1  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0969  gluconolactonase  25.25 
 
 		 304 aa  44.7  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173261  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28830  hypothetical protein  25.69 
 
 		 310 aa  44.7  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0152098  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8319  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  27.52 
 
 		 306 aa  44.7  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.736171  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2719  senescence marker protein-30 (SMP-30)  24.56 
 
 		 307 aa  44.3  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.281224 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7126  serine/threonine protein kinase  25.97 
 
 		 770 aa  44.3  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1639  hypothetical protein  22.83 
 
 		 657 aa  43.9  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>