74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3693 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3693  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  100 
 
 		 531 aa  1034    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0345166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1786  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  71.76 
 
 		 526 aa  708    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.222131 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4789  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  72.24 
 
 		 550 aa  735    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.425 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4964  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  71.73 
 
 		 529 aa  709    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4495  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  72.43 
 
 		 538 aa  735    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.789599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4408  NHL repeat-containing protein  72.43 
 
 		 538 aa  735    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0275  hypothetical protein  45.2 
 
 		 502 aa  390  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.152973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4866  NHL repeat containing protein  40.27 
 
 		 510 aa  285  2.0000000000000002e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4246  NHL repeat-containing protein  28.75 
 
 		 542 aa  188  3e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.359028  normal  0.663745 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4276  NHL repeat-containing protein  27.57 
 
 		 543 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0287557 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4920  NHL repeat containing protein  28.52 
 
 		 542 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.610425  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2800  NHL repeat-containing protein  27.53 
 
 		 538 aa  175  1.9999999999999998e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.350365  normal  0.74213 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1635  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  31.35 
 
 		 545 aa  172  2e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.260295  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0329  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.36 
 
 		 553 aa  169  9e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2610  hypothetical protein  31.89 
 
 		 302 aa  89.7  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000643636  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10949  transmembrane serine/threonine-protein kinase D pknD  26.49 
 
 		 664 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1558  hydrolase  27.17 
 
 		 294 aa  59.3  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.530388  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2986  PA14 domain-containing protein  23.68 
 
 		 1293 aa  55.1  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7086  serine/threonine protein kinase  26.69 
 
 		 732 aa  55.5  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7126  serine/threonine protein kinase  25.73 
 
 		 770 aa  54.7  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1671  hypothetical protein  27.27 
 
 		 357 aa  53.9  0.000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0387951  normal  0.034674 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1639  hypothetical protein  23.55 
 
 		 657 aa  53.9  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3789  putative hydrolase  27.72 
 
 		 285 aa  53.5  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00804259  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0053  hypothetical protein  23.55 
 
 		 657 aa  53.5  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1220  hypothetical protein  23.55 
 
 		 657 aa  53.5  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.124677  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0365  hypothetical protein  23.55 
 
 		 657 aa  53.5  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.860395  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0222  hypothetical protein  23.55 
 
 		 657 aa  53.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.640849  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1063  hypothetical protein  23.55 
 
 		 657 aa  53.5  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6221  gluconolactonase  26.99 
 
 		 314 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.162368  normal  0.0196248 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1414  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  30.46 
 
 		 279 aa  52  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.853392 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2396  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  26.25 
 
 		 275 aa  51.6  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000818527  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04622  gluconolactonase  30.49 
 
 		 292 aa  51.2  0.00005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  22.83 
 
 		 1789 aa  50.4  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1728  hypothetical protein  22.83 
 
 		 657 aa  50.1  0.00009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0868275  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1192  hypothetical protein  22.26 
 
 		 667 aa  50.1  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.251244  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2719  senescence marker protein-30 (SMP-30)  26.11 
 
 		 307 aa  49.7  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.281224 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0134  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  25.89 
 
 		 427 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771117  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0124  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  25.89 
 
 		 427 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0143  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  25.89 
 
 		 427 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.689507  normal  0.832483 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2723  senescence marker protein-30 (SMP-30)  28.57 
 
 		 307 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.513574  normal  0.176551 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2003  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  31.13 
 
 		 436 aa  48.9  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.528812 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7528  putative hydrolase  24.5 
 
 		 302 aa  49.3  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0701263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0809  putative glucose/sorbosone dehydrogenase  34.65 
 
 		 417 aa  48.9  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3486  Gluconolactonase  27 
 
 		 303 aa  48.5  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.656299 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1858  serine/threonine-protein kinase  30.89 
 
 		 274 aa  48.1  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.129879 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  24.56 
 
 		 1807 aa  48.1  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1359  NHL repeat containing protein  26.59 
 
 		 439 aa  47.8  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.666477 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0556  immunoglobulin I-set domain-containing protein  22.06 
 
 		 1130 aa  47.4  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.329662  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1472  NHL/RHS/YD repeat-containing protein  25.3 
 
 		 1834 aa  47  0.0008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3457  low-density lipoprotein receptor YWTD repeat protein  29.29 
 
 		 335 aa  46.6  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0967146 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  26.73 
 
 		 1750 aa  46.2  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3276  lyase-like protein  26.13 
 
 		 377 aa  46.6  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4185  serine/threonine protein kinase  22.78 
 
 		 719 aa  46.2  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3774  Gluconolactonase  28.99 
 
 		 303 aa  46.6  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.282281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4507  Gluconolactonase  28.28 
 
 		 308 aa  45.8  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28830  hypothetical protein  28.46 
 
 		 310 aa  45.4  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0152098  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0508  strictosidine synthase  25.3 
 
 		 363 aa  45.1  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3934  WD-40 repeat-containing protein  25.61 
 
 		 1599 aa  45.1  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.146607  unclonable  0.000100505 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8319  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  27.49 
 
 		 306 aa  45.1  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.736171  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2979  ATP/GTP-binding  30.61 
 
 		 277 aa  45.4  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0296682  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1102  gluconolactonase, putative  23.56 
 
 		 290 aa  45.1  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5618  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  26.67 
 
 		 306 aa  45.1  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.638263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4136  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.19 
 
 		 306 aa  45.1  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3531  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  25.5 
 
 		 309 aa  44.7  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2153  gluconolactonase  28.91 
 
 		 323 aa  44.7  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.669846 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0535  NHL repeat-containing protein  25.65 
 
 		 642 aa  44.7  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000386483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2681  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  27.54 
 
 		 574 aa  44.3  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0619  putative L-sorbosone dehydrogenase  35.44 
 
 		 417 aa  44.7  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.76 
 
 		 1599 aa  44.3  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0141  lyase-like protein  24.67 
 
 		 328 aa  43.9  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1601  NHL repeat-containing protein  31.34 
 
 		 491 aa  43.9  0.008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0447928  normal  0.136115 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3913  gluconolactonase  24.06 
 
 		 306 aa  43.5  0.009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.201835  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3940  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  28.21 
 
 		 295 aa  43.5  0.01  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  25.72 
 
 		 1357 aa  43.5  0.01  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>