47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II1192 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008784  BMASAVP1_0053  hypothetical protein  89.21 
 
 
657 aa  1188    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1063  hypothetical protein  89.21 
 
 
657 aa  1188    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0365  hypothetical protein  89.21 
 
 
657 aa  1188    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.860395  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0222  hypothetical protein  89.36 
 
 
657 aa  1189    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.640849  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1728  hypothetical protein  89.51 
 
 
657 aa  1196    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0868275  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1192  hypothetical protein  100 
 
 
667 aa  1365    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.251244  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1639  hypothetical protein  89.06 
 
 
657 aa  1186    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1220  hypothetical protein  89.21 
 
 
657 aa  1188    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.124677  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02985  putative hydrolase transmembrane protein  32.75 
 
 
349 aa  115  3e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.168534  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1652  copper resistance D domain-containing protein  25.97 
 
 
927 aa  110  7.000000000000001e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3680  putative hydrolase transmembrane protein  32.74 
 
 
331 aa  108  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.592047  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5477  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  31.11 
 
 
351 aa  102  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.521709 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0248  putative hydrolase transmembrane protein  24.65 
 
 
335 aa  94.7  4e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1431  lyase precursor-like  25.09 
 
 
416 aa  77  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000675912  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1989  streptogramin lyase gluconolactonase family  27.13 
 
 
368 aa  77  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2738  twin-arginine translocation pathway signal  26.94 
 
 
359 aa  75.5  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.21554 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0277  streptogramin lyase  23.47 
 
 
326 aa  73.6  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0306728  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1990  streptogramin lyase  24.48 
 
 
326 aa  70.1  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.573521  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1421  streptogramin lyase  25.76 
 
 
332 aa  64.3  0.000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1558  hydrolase  23.45 
 
 
294 aa  63.9  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.530388  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10998  PE-PGRS family protein  28.57 
 
 
457 aa  55.5  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000104383  normal  0.995085 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1749  hypothetical protein  23.18 
 
 
296 aa  54.3  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000980915  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06130  hypothetical protein  24.54 
 
 
316 aa  53.9  0.000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.772958  decreased coverage  0.00656931 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2867  putative hydrolase  23.92 
 
 
291 aa  52.8  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.618426  normal  0.632922 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0141  lyase-like protein  27.05 
 
 
328 aa  52  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0574  hypothetical protein  25.7 
 
 
316 aa  52  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.30321  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1786  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  23.62 
 
 
526 aa  50.8  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.222131 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1671  hypothetical protein  19.79 
 
 
524 aa  50.1  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2607  GGDEF domain-containing protein  34.57 
 
 
1054 aa  50.4  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.202674  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1199  hypothetical protein  30.56 
 
 
533 aa  49.3  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3693  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  22.26 
 
 
531 aa  49.7  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0345166  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3497  hypothetical protein  36.19 
 
 
1170 aa  49.3  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  20.57 
 
 
831 aa  48.9  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1898  putative hydrolase  23.58 
 
 
299 aa  48.5  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.305143 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4824  histidine kinase  26.74 
 
 
1024 aa  48.1  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0714049  normal  0.112759 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3276  lyase-like protein  29.01 
 
 
377 aa  48.1  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4964  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  27.66 
 
 
529 aa  47  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  24.89 
 
 
1667 aa  45.8  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7528  putative hydrolase  23.03 
 
 
302 aa  45.8  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0701263  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3239  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  40.96 
 
 
1535 aa  45.4  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1889  hydrolase  23.74 
 
 
290 aa  45.8  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10996  PE-PGRS family protein  25 
 
 
313 aa  45.1  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.7191000000000003e-35  normal  0.547752 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1165  NHL repeat containing protein  29.91 
 
 
950 aa  45.1  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0259008 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2572  hypothetical protein  30.85 
 
 
1608 aa  44.7  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4495  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  28.08 
 
 
538 aa  44.7  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.789599  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4408  NHL repeat-containing protein  28.08 
 
 
538 aa  44.7  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1764  sensor histidine kinase/response regulator  33.72 
 
 
1093 aa  43.9  0.01  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.412354  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>