16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2610 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2610  hypothetical protein  100 
 
 		 302 aa  598  1e-170  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000643636  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4276  NHL repeat-containing protein  36.65 
 
 		 543 aa  152  5e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0287557 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4920  NHL repeat containing protein  35.07 
 
 		 542 aa  149  7e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.610425  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4246  NHL repeat-containing protein  34.05 
 
 		 542 aa  143  4e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.359028  normal  0.663745 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2800  NHL repeat-containing protein  33.58 
 
 		 538 aa  137  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.350365  normal  0.74213 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1635  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  35.69 
 
 		 545 aa  124  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.260295  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0329  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  32.17 
 
 		 553 aa  103  5e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4789  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  33.46 
 
 		 550 aa  94  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.425 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4866  NHL repeat containing protein  28.09 
 
 		 510 aa  93.2  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4408  NHL repeat-containing protein  33.07 
 
 		 538 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4495  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  33.07 
 
 		 538 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.789599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3693  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  31.89 
 
 		 531 aa  89.7  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0345166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1786  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.76 
 
 		 526 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.222131 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4964  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  28.97 
 
 		 529 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0275  hypothetical protein  25.81 
 
 		 502 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.152973  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  24.55 
 
 		 1364 aa  42.4  0.01  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.109375 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>