10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2399 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_2399  hypothetical protein  100 
 
 		 294 aa  595  1e-169  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.480883 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2246  hypothetical protein  88.78 
 
 		 294 aa  535  1e-151  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28830  hypothetical protein  53.09 
 
 		 310 aa  290  3e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0152098  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3582  hypothetical protein  44.68 
 
 		 289 aa  241  1e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.104716  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42680  hypothetical protein  44.24 
 
 		 289 aa  236  3e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0275  hypothetical protein  28.44 
 
 		 502 aa  52.4  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.152973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4964  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  33.06 
 
 		 529 aa  45.8  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3457  low-density lipoprotein receptor YWTD repeat protein  29.31 
 
 		 335 aa  45.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0967146 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0257  gluconolactonase  33.33 
 
 		 350 aa  43.9  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1786  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  28.7 
 
 		 526 aa  43.1  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.222131 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>